Hydrocarbon-degrading bacteria associated with intestinal tract of fish from the Baltic sea / Angliavandenilius skaidančios bakterijos Baltijos jūros žuvų virškinamuosiuose traktuose / Углеводород расщепляющие бактерии в пищеварительном тракте рыб Балтийского моря

• Published in: Journal of Environmental Engineering and Landscape Management
• Main Authors: Šyvokienė, Janina, Micknienė, Liongina
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: English
• Published: VGTU Press Technika 2011
• Subjects: pollution; fish; intestinal bacteria; abundance of hydrocarbon-degrading bacteria; 16S rRNA gene sequencing; species composition; Kad’; Gadus morhua
• Online Access: http://journals.vgtu.lt/index.php/JEELM/article/view/5340; https://doi.org/10.3846/16486897.2011.602559

The hydrocarbon-degrading bacterial diversity of the intestinal tract content of fish – the Baltic cod (Gadus morhua), plaice (Platichthys flesus) and the Baltic herring (Clupea harengus) – from the Baltic Sea has been investigated by molecular methods: DNA extraction, amplification polymerase chain reaction product and sequencing of partial 16S rRNA genes. The results of this study show that dense total heterotrophic bacterial populations occur in the intestinal tract of investigated fish. The data obtained showed that the abundance of hydrocarbon-degrading bacteria in the intestinal tract of fish varied from 2.40×104to 1.08×105cfu g–1between fish species and was still high. Phenotypic examination of the recorded hydrocarbon-degrading bacteria from the intestinal tract of the Baltic cod, plaice and the Baltic herring revealed that they belong toAeromonas, Pseudomonas/Shewanella. Molecular species of hydrocarbon-degrading bacteria found in the digestive tract of fish from the Baltic Sea were:Aeromonas veronii, Aeromonas sobria, Shewanella spp. and Acinetobacter spp. We argue that hydrocarbon-degrading bacteria in intestinal tract of fish take part in purification processes, as well as, bacteria in water and play a role in adaptation and survival of fish chronically exposed to pollution with hydrocarbons. Santrauka Angliavandenilius skaidančių bakterijų įvairovė Baltijos jūros žuvų – menkių (Gadus morhua), plekšnių (Platichthys flesus) ir strimėlių (Clupea harengus) žarnynų turinyje tirta molekuliniais metodais: DNR išskyrimas, polimerazės grandininės reakcijos produkto amplifikacija ir 16S rRNR genų sekvenavimas. Tirtų žuvų žarnynuose nustatytos gausios heterotrofinių bakterijų populiacijos. Angliavandenilius skaidančios bakterijos išskirtos iš visų tirtų žuvų žarnynų turinio. Jų kiekis žuvų žarnynuose svyravo nuo 2,4×104iki 1,08×105kfv (koloniją formuojantis vienetas) ir buvo pakankamai didelis. Fenotipiniais bakterijų identifikavimo metodais nustatyta, kad angliavandenilius skaidančios bakterijos, išskirtos iš Baltijos jūros žuvų žarnynų turinio, priklausėAeromonas Pseudomonas/Shewanellagentims. Molekuliniais metodais nustatyta, kad angliavandenilius skaidančios bakterijos tirtų žuvų žarnynuose yraAeromonas sobria, Aeromonas veronii, Shewanellaspp. irAcinetobacterspp. Galima daryti prielaida, kad žuvų žarnynuose gyvenančios angliavandenilius skaidančios bakterijos dalyvauja savivalos procesuose kaip ir vandenyje gyvenančios bei angliavandenilius skaidančios bakterijos ir padeda adaptuotis ir išgyventi žuvims vandenyse, pastoviai teršiamuose nafta ir jos produktais. Резюме Разнообразие углеводородрасщепляющих бактерий в содержимом кишечника рыб: трески (Gadus morhua), камбалы (Platichthys flesus) и салаки (Clupea harengus) из Балтийского моря было исследовано молекулярными методами: выделение ДНК, амплификация ПЦР продукта, секвенация 16S рРНК генов. В кишечнике исследованныхрыб найдены многочисленные популяции гетеротрофных бактерий. Углеводородрасщепляюшие бактерии выделены из содержимого кишечника всех исследованных рыб. Их численность колебалась в пределах 2,4×104– 1,08×105КФЕ (колонию формирующая единица) и была достаточно высокая. Фенотипическими методами идентификации бактерий установлено, что углеводородрасщепляюшие бактерии из пищеварительного тракта рыбпринадлежали родамAeromonas и Pseudomonas/Shewanella. Молекулярными методами определено, что углеводородрасщепляюшие бактерии из пищеварительного тракта рыб принадлежали видамAeromonas sobria, Aeromonas veronii, Shewanellaspp.,Acinetobacterspp. Можно предположить, что углеводородрасщепляющие бактерии из пищеварительного тракта рыб участвуют в процессах самоочищения, как и бактерии, обитающие в водной среде, атакже помогают адаптироваться и выжить рыбам в водах, постоянно загрязняемых нефтью и ее продуктами. Reikšminiai žodžiai:Tarša,žuvys,žarnyno bakterijos,angliavandenilius skaidančios bakterijos,16S rRNR genų sekvenavimas,rūšinė sudėtis Ключевые слова:загрязнение,рыбы,бактерии кишечника,углеводородрасщепляющие бактерии,секвенация16S рРНК генов,видовой состав