Effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen
Som en del av Barents Sea Drill Cuttings Research Initiative (BARCUT) fokuserte denne masteroppgaven på å avdekke om bakteriesammensetningen i sedimentet rundt en borebrønn påvirkes av boreavfallsdeponeringer. Under tokt med M/S «Njord Viking» 30. november – 3. desember 2013 ble det hentet opp kjern...
Main Author: | |
---|---|
Format: | Master Thesis |
Language: | Norwegian Bokmål |
Published: |
UiT The Arctic University of Norway
2014
|
Subjects: | |
Online Access: | https://hdl.handle.net/10037/7114 |
id |
ftunivtroemsoe:oai:munin.uit.no:10037/7114 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftunivtroemsoe:oai:munin.uit.no:10037/7114 2023-05-15T15:38:58+02:00 Effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen Øverleir, Ida Maylen 2014-05-15 https://hdl.handle.net/10037/7114 nob nob UiT The Arctic University of Norway UiT Norges arktiske universitet https://hdl.handle.net/10037/7114 URN:NBN:no-uit_munin_6700 openAccess Copyright 2014 The Author(s) VDP::Teknologi: 500::Bioteknologi: 590 VDP::Technology: 500::Biotechnology: 590 BIO-3901 Master thesis Mastergradsoppgave 2014 ftunivtroemsoe 2021-06-25T17:54:08Z Som en del av Barents Sea Drill Cuttings Research Initiative (BARCUT) fokuserte denne masteroppgaven på å avdekke om bakteriesammensetningen i sedimentet rundt en borebrønn påvirkes av boreavfallsdeponeringer. Under tokt med M/S «Njord Viking» 30. november – 3. desember 2013 ble det hentet opp kjerneprøver ved en letebrønn i Brønnlokaliteten. Dette ble gjort samtidig med at Akvaplan-niva gjennomførte havbunnsundersøkelser på samme lokalitet. Det ble tatt prøver fra i alt seks ulike stasjoner, hvor det på halvparten av disse ble hentet opp to paralleller. I min oppgave ble kun de tre stasjonene hvor man hentet opp paralleller undersøkt. Disse lå i et transekt fra 30 til 210 m østover fra brønnen. DNA ble ekstrahert fra sedimentprøvene og genet for bakterielt 16S ribosomalt RNA ble oppkopiert med PCR ved bruk av universelle primere. Diversiteten av dette genet i de forskjellige PCR-produktene gir da et speilbilde av bakteriediversiteten i de tilsvarende prøvene. PCR-produktene ble sekvensert ved bruk av Next-Generation-sekvenseringsteknologi (Illumina MiSeq) ved Barents BioCentre Lab, Forskningsparken i Tromsø. De totalt 15,6 millioner råsekvensene som ble produsert ble sammenstilt og filtrert ut fra flere kvalitetskriterier. Det gjenværende sekvensmaterialet ble så analysert med bioinformatiske og statistiske verktøy. Master Thesis Barents Sea Tromsø University of Tromsø: Munin Open Research Archive Barents Sea Niva ENVELOPE(23.913,23.913,66.136,66.136) Tromsø |
institution |
Open Polar |
collection |
University of Tromsø: Munin Open Research Archive |
op_collection_id |
ftunivtroemsoe |
language |
Norwegian Bokmål |
topic |
VDP::Teknologi: 500::Bioteknologi: 590 VDP::Technology: 500::Biotechnology: 590 BIO-3901 |
spellingShingle |
VDP::Teknologi: 500::Bioteknologi: 590 VDP::Technology: 500::Biotechnology: 590 BIO-3901 Øverleir, Ida Maylen Effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen |
topic_facet |
VDP::Teknologi: 500::Bioteknologi: 590 VDP::Technology: 500::Biotechnology: 590 BIO-3901 |
description |
Som en del av Barents Sea Drill Cuttings Research Initiative (BARCUT) fokuserte denne masteroppgaven på å avdekke om bakteriesammensetningen i sedimentet rundt en borebrønn påvirkes av boreavfallsdeponeringer. Under tokt med M/S «Njord Viking» 30. november – 3. desember 2013 ble det hentet opp kjerneprøver ved en letebrønn i Brønnlokaliteten. Dette ble gjort samtidig med at Akvaplan-niva gjennomførte havbunnsundersøkelser på samme lokalitet. Det ble tatt prøver fra i alt seks ulike stasjoner, hvor det på halvparten av disse ble hentet opp to paralleller. I min oppgave ble kun de tre stasjonene hvor man hentet opp paralleller undersøkt. Disse lå i et transekt fra 30 til 210 m østover fra brønnen. DNA ble ekstrahert fra sedimentprøvene og genet for bakterielt 16S ribosomalt RNA ble oppkopiert med PCR ved bruk av universelle primere. Diversiteten av dette genet i de forskjellige PCR-produktene gir da et speilbilde av bakteriediversiteten i de tilsvarende prøvene. PCR-produktene ble sekvensert ved bruk av Next-Generation-sekvenseringsteknologi (Illumina MiSeq) ved Barents BioCentre Lab, Forskningsparken i Tromsø. De totalt 15,6 millioner råsekvensene som ble produsert ble sammenstilt og filtrert ut fra flere kvalitetskriterier. Det gjenværende sekvensmaterialet ble så analysert med bioinformatiske og statistiske verktøy. |
format |
Master Thesis |
author |
Øverleir, Ida Maylen |
author_facet |
Øverleir, Ida Maylen |
author_sort |
Øverleir, Ida Maylen |
title |
Effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen |
title_short |
Effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen |
title_full |
Effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen |
title_fullStr |
Effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen |
title_full_unstemmed |
Effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen |
title_sort |
effekter på bakteriesamfunn av boreslamdeponering på havbunnen |
publisher |
UiT The Arctic University of Norway |
publishDate |
2014 |
url |
https://hdl.handle.net/10037/7114 |
long_lat |
ENVELOPE(23.913,23.913,66.136,66.136) |
geographic |
Barents Sea Niva Tromsø |
geographic_facet |
Barents Sea Niva Tromsø |
genre |
Barents Sea Tromsø |
genre_facet |
Barents Sea Tromsø |
op_relation |
https://hdl.handle.net/10037/7114 URN:NBN:no-uit_munin_6700 |
op_rights |
openAccess Copyright 2014 The Author(s) |
_version_ |
1766370402193375232 |