| Summary: | Som en del av Barents Sea Drill Cuttings Research Initiative (BARCUT) fokuserte denne masteroppgaven på å avdekke om bakteriesammensetningen i sedimentet rundt en borebrønn påvirkes av boreavfallsdeponeringer. Under tokt med M/S «Njord Viking» 30. november – 3. desember 2013 ble det hentet opp kjerneprøver ved en letebrønn i Brønnlokaliteten. Dette ble gjort samtidig med at Akvaplan-niva gjennomførte havbunnsundersøkelser på samme lokalitet. Det ble tatt prøver fra i alt seks ulike stasjoner, hvor det på halvparten av disse ble hentet opp to paralleller. I min oppgave ble kun de tre stasjonene hvor man hentet opp paralleller undersøkt. Disse lå i et transekt fra 30 til 210 m østover fra brønnen. DNA ble ekstrahert fra sedimentprøvene og genet for bakterielt 16S ribosomalt RNA ble oppkopiert med PCR ved bruk av universelle primere. Diversiteten av dette genet i de forskjellige PCR-produktene gir da et speilbilde av bakteriediversiteten i de tilsvarende prøvene. PCR-produktene ble sekvensert ved bruk av Next-Generation-sekvenseringsteknologi (Illumina MiSeq) ved Barents BioCentre Lab, Forskningsparken i Tromsø. De totalt 15,6 millioner råsekvensene som ble produsert ble sammenstilt og filtrert ut fra flere kvalitetskriterier. Det gjenværende sekvensmaterialet ble så analysert med bioinformatiske og statistiske verktøy.
|
|---|