| Summary: | Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária A sarna sarcóptica, provocada pelo ácaro Sarcoptes scabiei, é uma doença cutânea que afeta várias populações de carnívoros silvestres. Em algumas populações de raposa (Vulpes vulpes) a sarna originou consideráveis declínios populacionais. No lobo (Canis lupus), apesar de a sarna não ser diretamente responsável por elevada mortalidade, os animais afetados sofrem de alterações fisiológicas e comportamentais. A população lupina portuguesa divide-se em subpopulações fragmentadas e está confinada à região norte do país, pelo que esta doença poderá originar efeitos populacionais mais significativos. Com o presente trabalho pretendeu-se, i) desenvolver um novo método de monitorização não-invasiva através da deteção molecular de S. scabiei em amostras fecais de lobo ii) descrever a epidemiologia da sarna sarcóptica em carnívoros silvestres (lobo e raposa) da região Noroeste de Portugal entre 1997 e 2019, combinando dados resultantes da análise laboratorial, utilizando métodos sorológicos para identificação de anticorpos específicos, métodos moleculares para deteção de DNA de Sarcoptes sp. em amostras fecais não-invasivas e métodos de observação direta para deteção de Sarcoptes sp. em digestões de pele alopécica, bem como dados de campo constituídos por foto-armadilhas de populações selvagens; iii) validar e avaliar o desempenho do método molecular não-invasivo através de modelos multi-evento de captura-recaptura. Foi possível identificar S. scabiei por microscopia em 8/14 (57%, IC95% 32,6-78,6%) amostras de lobo e em 5/6 (83%, IC95% 43,7-97%) amostras de raposa. Na sorologia, 28/81 amostras foram positivas (prevalência predita de 45,4%, IC95% 30,3-60,5%). Nos métodos moleculares, foi detetado DNA de S. scabiei em 71/843 amostras fecais de lobo (prevalência predita de 7,2%, IC95% 5,0-9,4%). Nas foto-armadilhas, 11/72 (15%, IC95% 8,8-25,3%) deteções de lobos e 33/369 (9%, IC95% 6,4-12,3%) de raposas apresentavam lesões compatíveis com sarna. A combinação destes métodos permitiu um estudo epidemiológico mais completo da sarna sarcóptica. Observou-se um período de alta prevalência em 2006-2009, com um pico no ano 2008 por sorologia (94,8%), enquanto que nos métodos moleculares, o pico ocorreu no ano 2009 (11,7%). Através das foto-armadilhas, a alopécia foi predominante entre fevereiro e julho e observaram-se alterações no padrão de atividade. Através do modelo multi-evento foi estimado que lobos com sarna apresentam uma mortalidade 18,4% (IC95% -15,2-49,6%) superior à dos lobos não infetados (não significativa) e foi estimada uma sensibilidade de 34,0% (IC95% 15,9-58,4%) e uma especificidade de 100% para o novo método desenvolvido. ABSTRACT - New Methodologies for the Study of Sarcoptic Mange Epidemiology in Wild Carnivores - Sarcoptic mange, caused by the mite Sarcoptes scabiei is an enzootic skin disease that affects several populations of wild carnivores. In some red fox populations (Vulpes vulpes) mange have caused considerable population declines. Although in the wolf (Canis lupus), mange seems not directly responsible for high mortality, the affected animals present physiological and behavioural changes. The Portuguese lupine population is divided into fragmented subpopulations and is confined to the northern region of the country, so this disease may lead to more significant population effects. This work aimed to i) develop a new method for non-invasive monitoring through molecular detection of S. scabiei in wolf faecal samples ii) describe the epidemiology of sarcoptic mange in wild carnivores (wolf and fox) in the North-Western region of Portugal between 1997 and 2019 by combining data resulting from laboratory analysis, using serological methods for the identification of specific antibodies, molecular methods for the detection of Sarcoptes sp. DNA in non-invasive faecal samples and direct observation methods for the detection of Sarcoptes sp. in alopecic skin digestions, as well as field data from camera trapping of wild populations; iii) validate and evaluate the performance of the non-invasive molecular method through multi-event capture-recapture models. It was possible to identify the mite S. scabiei by microscopy in 8/14 (57%, CI95% 32.6-78.6%) wolf samples and in 5/6 (83%, CI95% 43.7-97%) fox samples. In serology, 28/81 samples were positive (predicted prevalence of 45.4%, CI95% 30.3-60.5%). In the molecular methods, S. scabiei DNA was detected in 71/843 faecal samples of wolves (predicted prevalence of 7.2%, CI95% 5.0-9.4%). In camera trapping, 11/72 (15%, CI95% 8.8-25.3%) wolves and 33/369 (9%, CI95% 6.4-12.3%) foxes with compatible mange lesions were detected. The combination of different methods allowed a more complete epidemiological study of sarcoptic mange. A period of high prevalence was observed in 2006-2009, with a peak in the year 2008 by serology (94.8%) while in molecular methods, the peak occurred in the year 2009 (11.7%). By camera trapping, alopecia was found to be predominant between February and July and changes in the activity pattern were observed. With the multi-event capture-recapture model, it was estimated that wolves with mange showed a mortality rate 18.4% (CI95% -15.2-49.6%) higher than non-infected wolves (non-significant), and a sensitivity of 34.0% (CI95% 15.9-58.4%) and a specificity of 100% for the new method developed were estimated. N/A
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