| Summary: | Dissertação de Mestrado Integrado em Medicina Veterinária Parapoxvirus causes nodular lesions in the skin and mucosal membranes of diverse species of pinnipeds, worldwide. Seal parapoxvirus is currently categorized as a tentative species of the Parapoxvirus genus. Between 2009 and 2018, 22 samples were collected from 12 pinnipeds representing 5 different species (grey seal, harp seal, harbor seal, California sea lion and northern elephant seal) with clinical suspicion of parapoxvirus infection, from rehabilitation facilities on the east and west coast of the United States of America. The aims of this study were to confirm the presence of parapoxvirus in the clinical samples by PCR, to resolve evolutionary relationships to other members of the genus and to determine whether pinnipeds from different species and locations are infected with the same parapoxvirus strains. Parapoxvirus DNA was detected in 11 of the 12 animals. The sequence analysis showed that the parapoxvirus sequences from the seal samples differed significantly from parapoxviruses found in terrestrial hosts and that the pinniped parapoxviruses formed a separated cluster within the genus. Five distinct parapoxvirus variants were detected. Parapoxviruses from harbor seals from the Atlantic and Pacific coast clustered separately, indicating different virus variants in the two subspecies. One variant of parapoxvirus was found in both a California sea lion (Otariidae family) and a northern elephant seal (Phocidae family) housed in the same facility. Therefore, the results of this study support the classification of Seal parapoxvirus as a separate species within the genus Parapoxvirus and give further insight into the phylogenetic relationships between the different circulating Seal parapoxvirus strains. RESUMO - Análise molecular e filogenética de parapoxvirus em pinípedes norte-Americanos - Os parapoxvírus causam lesões nodulares na pele e mucosa de diferentes espécies de pinípedes, por todo o mundo. O Seal parapoxvirus ainda não se encontra incluído como uma espécie do género Parapoxvirus. Entre 2009 e 2018, foram colhidas 22 amostras de 12 pinípedes de 5 espécies diferentes (foca cinzenta, foca da Groenlândia, foca-comum, leão-marinho Californiano e elefante marinho do norte) com suspeita clínica de infecção por parapoxvírus, internados em diferentes em centros de recuperação nas costas Este e Oeste dos Estados Unidos da América. Os objectivos deste trabalho consistiram em confirmar a presença de parapoxvírus nas amostras por PCR, estudar a relação evolutiva deste vírus com outros membros do género e determinar se pinípedes de diferentes espécies e locais estão ou não infectados com a mesma variante de parapoxvírus. Foi detectado ADN de parapoxvírus em 11 dos 12 animais. A análise das sequências revelou que as sequências virais obtidas a partir das amostras de focas diferiram significativamente dos parapoxvírus encontrados em hospedeiros terrestres e que os parapoxvírus dos pinípedes formaram um agregado separado dentro do género. Foram detectadas cinco variantes distintas de parapoxvirus. Parapoxvírus da espécie foca-comum da costa do Atlântico e do Pacífico agruparam-se separadamente, indicando diferentes variantes de vírus nas duas subespécies. Uma variante de parapoxvirus foi detectada tanto num leão-marinho Californiano (família Otariidae) como num elefante marinho do norte (família Phocidae) alojados na mesma instalação. Desta forma, os resultados deste estudo suportam a classificação do Seal parapoxvirus como uma nova espécie pertencente ao género Parapoxvirus e fornecem uma visão adicional sobre as relações filogenéticas entre as diferentes variantes circulantes de parapoxvírus de pinípedes. N/A
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