Antibiotic resistance in gastrointestinal bacteria isolated from the Iberian lynx and Iberian wolf: species conservation and public health concerns

Tese de Doutoramento em Genética Molecular Comparativa e Tecnológica Enterococcus spp. e Escherichia coli são bactérias comensais, habitantes regulares do trato gastrointestinal de humanos e animais, incluindo os animais selvagens. Estas espécies bacterianas são capazes de adquirir e disseminar gene...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Gonçalves, Alexandre Fradeira
Other Authors: Poeta, Patrícia Alexandra Curado Quintas Dinis, Igrejas, Gilberto Paulo Peixoto, Manrique, Carmen Torres
Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
Language:English
Published: 2015
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10348/4646
Description
Summary:Tese de Doutoramento em Genética Molecular Comparativa e Tecnológica Enterococcus spp. e Escherichia coli são bactérias comensais, habitantes regulares do trato gastrointestinal de humanos e animais, incluindo os animais selvagens. Estas espécies bacterianas são capazes de adquirir e disseminar genes de resistência a antibióticos pelo meio-ambiente, representando um problema grave em medicina humana e veterinária. Esta tese teve como objetivo avaliar o potencial de duas espécies animais ameaçadas de extinção, o Lince Ibérico e o Lobo Ibérico, como reservatórios de estirpes comensais de Escherichia coli e Enterococcus spp. que abrigam genes de resistência e de virulência. No capítulo 1 determinou-se a prevalência de Enterococcus spp. resistentes à vancomicina (“Vancomycin-Resistant Enterococci”, VRE) em amostras fecais de Lobo Ibérico (2,3%) e de Lince Ibérico (2%). No Lince Ibérico não foram detectados isolados com mecanismos de resistência adquirida à vancomicina. No Lobo Ibérico, um dos dois isolados E. faecium contendo o gene vanA pertencia ao tipo de sequência ST18 (incluído na linhagem clonal CC17), enquanto o segundo foi inserido num novo tipo de sequência, incluído na base de dados MLST e registado como ST573. Ambos os isolados vanA apresentaram resistência à tetraciclina e eritromicina [com os genes erm(B) e tet(L)] e um exibiu ainda resistência à ampicilina e à canamicina [com os genes erm(B), tet(M) e aph(3')-III ]. No capítulo 2, caracterizou-se a diversidade dos isolados de E. coli produtores de β- lactamases de espectro alargado (“Extended-spectrum β-lactamase”, ESBL), recuperados na microbiota fecal de Lince Ibérico e de Lobo Ibérico. Pela primeira vez em espécimes de Lince Ibérico em cativeiro (9%) e em Lobo Ibérico (5,5%) foram detectados isolados de E. coli produtores de ESBL do tipo TEM-52, SHV-12, CTX-M-1, e/ou CTX-M-14. Neste estudo detectou-se ainda a ocorrência de isolados de E. coli multirresistentes, provenientes de diferentes linhagens clonais, incluindo a presença de ESBL, genes de ...