Ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury

Landscape genetic approaches allow to study effects of landscape to population microevolution. Landscape can influence gene flow even in large carnivores with good dispersal ability. Understanding the influence of landscape to the gene flow between populations is crucial for species conservation, es...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Benešová, Markéta
Other Authors: Hulva, Pavel, Kreisinger, Jakub
Format: Thesis
Language:Czech
Published: Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta 2018
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/20.500.11956/97971
id ftunivpraha:oai:dspace.cuni.cz:20.500.11956/97971
record_format openpolar
spelling ftunivpraha:oai:dspace.cuni.cz:20.500.11956/97971 2023-05-15T15:50:24+02:00 Ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury Conservation genetics of grey wolf and snow leopard: effect of landscape attributes to the population structure Benešová, Markéta Hulva, Pavel Kreisinger, Jakub 2018 http://hdl.handle.net/20.500.11956/97971 Čeština cs_CZ cze Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta ochranářská genetika krajinná genetika konektivita disperze levhart sněžný vlk obecný conservation genetics landscape genetics connectivity dispersal snow leopard grey wolf diplomová práce 2018 ftunivpraha 2019-05-06T23:12:31Z Landscape genetic approaches allow to study effects of landscape to population microevolution. Landscape can influence gene flow even in large carnivores with good dispersal ability. Understanding the influence of landscape to the gene flow between populations is crucial for species conservation, especially in the species with low population densities. Aim of the study was to describe genetic structure of the grey wolf (Canis lupus) and snow leopard (Panthera uncia) in selected areas and to determine the influence of the landscape features on observed structure. Non-invasive genetic samples of snow leopard from Nepal were analysed, as well as invasive and non-invasive samples of grey wolf from Central Europe. Population structure was determined a posteriori using Bayesian clustering approaches that integrate genetic and geographical data, and compared to landscape connectivity models. Population structure of snow leopards is mostly influenced by human presence and presence of frequented roads, which represent a substantial dispersal barrier. Habitat suitable for this species is greatly restricted by altitude, however, during dispersal they are able to overcome areas with higher elevation than what is optimal for them. Pronounced genetic difference was found between central European and Carpathian. Přístupy krajinné genetiky umožňují zkoumat vliv krajiny na mikroevoluci populací. Krajina může ovlivňovat genový tok i u velkých šelem s dobrými disperzními schopnosti. Pochopení vlivu krajiny na genový tok mezi populacemi je zásadní pro ochranu druhů, obzvlášť jedná-li se o druhy s nízkou populační hustotou. Cílem práce bylo popsat genetickou strukturu populací vlka obecného (Canis lupus) a levharta sněžného (Panthera uncia) ve vybraných územích a zjistit, jaký vliv mají na pozorovanou strukturu vlastnosti krajiny. Byly analyzovány neinvazivní genetické vzorky levhartů sněžných z Nepálu a neinvazivní i invazivní vzorky vlků obecných ze střední Evropy. Populační struktura byla určena a posteriori pomocí Bayesiánských přístupů, které integrují genetická a geografická data, a srovnána s modely konektivity krajiny. Populační struktura sněžných levhartů je nejvíce ovlivněna přítomností lidí a frekventovaných cest, které pro ně představují disperzní bariéru. Habitat vhodný pro tento druh je výrazně omezen nadmořskou výškou, přesto jsou během disperze schopni překonat i oblasti s vyšší nadmořskou výškou, než jaká je pro ně optimální. Byla nalezena výrazná genetická odlišnost mezi vlky ze středoevropské nížinné a z karpatské populace, přestože mezi nimi není přímá bariéra genového toku. Tuto roli hraje. Department of Zoology Katedra zoologie Faculty of Science Přírodovědecká fakulta Thesis Canis lupus Charles University CU Digital repository Roli ENVELOPE(18.857,18.857,69.117,69.117)
institution Open Polar
collection Charles University CU Digital repository
op_collection_id ftunivpraha
language Czech
topic ochranářská genetika
krajinná genetika
konektivita
disperze
levhart sněžný
vlk obecný
conservation genetics
landscape genetics
connectivity
dispersal
snow leopard
grey wolf
spellingShingle ochranářská genetika
krajinná genetika
konektivita
disperze
levhart sněžný
vlk obecný
conservation genetics
landscape genetics
connectivity
dispersal
snow leopard
grey wolf
Benešová, Markéta
Ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury
topic_facet ochranářská genetika
krajinná genetika
konektivita
disperze
levhart sněžný
vlk obecný
conservation genetics
landscape genetics
connectivity
dispersal
snow leopard
grey wolf
description Landscape genetic approaches allow to study effects of landscape to population microevolution. Landscape can influence gene flow even in large carnivores with good dispersal ability. Understanding the influence of landscape to the gene flow between populations is crucial for species conservation, especially in the species with low population densities. Aim of the study was to describe genetic structure of the grey wolf (Canis lupus) and snow leopard (Panthera uncia) in selected areas and to determine the influence of the landscape features on observed structure. Non-invasive genetic samples of snow leopard from Nepal were analysed, as well as invasive and non-invasive samples of grey wolf from Central Europe. Population structure was determined a posteriori using Bayesian clustering approaches that integrate genetic and geographical data, and compared to landscape connectivity models. Population structure of snow leopards is mostly influenced by human presence and presence of frequented roads, which represent a substantial dispersal barrier. Habitat suitable for this species is greatly restricted by altitude, however, during dispersal they are able to overcome areas with higher elevation than what is optimal for them. Pronounced genetic difference was found between central European and Carpathian. Přístupy krajinné genetiky umožňují zkoumat vliv krajiny na mikroevoluci populací. Krajina může ovlivňovat genový tok i u velkých šelem s dobrými disperzními schopnosti. Pochopení vlivu krajiny na genový tok mezi populacemi je zásadní pro ochranu druhů, obzvlášť jedná-li se o druhy s nízkou populační hustotou. Cílem práce bylo popsat genetickou strukturu populací vlka obecného (Canis lupus) a levharta sněžného (Panthera uncia) ve vybraných územích a zjistit, jaký vliv mají na pozorovanou strukturu vlastnosti krajiny. Byly analyzovány neinvazivní genetické vzorky levhartů sněžných z Nepálu a neinvazivní i invazivní vzorky vlků obecných ze střední Evropy. Populační struktura byla určena a posteriori pomocí Bayesiánských přístupů, které integrují genetická a geografická data, a srovnána s modely konektivity krajiny. Populační struktura sněžných levhartů je nejvíce ovlivněna přítomností lidí a frekventovaných cest, které pro ně představují disperzní bariéru. Habitat vhodný pro tento druh je výrazně omezen nadmořskou výškou, přesto jsou během disperze schopni překonat i oblasti s vyšší nadmořskou výškou, než jaká je pro ně optimální. Byla nalezena výrazná genetická odlišnost mezi vlky ze středoevropské nížinné a z karpatské populace, přestože mezi nimi není přímá bariéra genového toku. Tuto roli hraje. Department of Zoology Katedra zoologie Faculty of Science Přírodovědecká fakulta
author2 Hulva, Pavel
Kreisinger, Jakub
format Thesis
author Benešová, Markéta
author_facet Benešová, Markéta
author_sort Benešová, Markéta
title Ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury
title_short Ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury
title_full Ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury
title_fullStr Ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury
title_full_unstemmed Ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury
title_sort ochranářská genetika vlka obecného a levharta sněžného: vliv krajiny na mikroevoluci populační struktury
publisher Univerzita Karlova, Přírodovědecká fakulta
publishDate 2018
url http://hdl.handle.net/20.500.11956/97971
long_lat ENVELOPE(18.857,18.857,69.117,69.117)
geographic Roli
geographic_facet Roli
genre Canis lupus
genre_facet Canis lupus
_version_ 1766385349580292096