In silico and in vitro studies of a non-commensal soil bacterium and its interactions with a mammalian host

Oppgaven skal holdes konfidensiell til des 2017 av hensyn til mulig senere publisering av deler av innholdet Methylococcus capsulatus (Bath) er en Gram-negativ, metanotrof bakterie. Til tross for at den aldri har vært beskrevet å være en del av tarmflora har M. capsulatus (Bath) vist seg å ha positi...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Indrelid, Stine
Format: Master Thesis
Language:English
Published: Norwegian University of Life Sciences, Ås 2013
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/11250/186600
Description
Summary:Oppgaven skal holdes konfidensiell til des 2017 av hensyn til mulig senere publisering av deler av innholdet Methylococcus capsulatus (Bath) er en Gram-negativ, metanotrof bakterie. Til tross for at den aldri har vært beskrevet å være en del av tarmflora har M. capsulatus (Bath) vist seg å ha positive effekter ved inflammatoriske tilstander i vertebrater. M. capsulatus (Bath) hindrer utvikling av soya-indusert enteritt i Atlanterhavslaks og har vist seg å ha profylaktisk effekt ved dekstran natriumsulfat-indusert kolitt hos mus. In vitro studier har vist at M. capsulatus (Bath) kan binde seg spesifikt til humane CD14+ monocyttderiverte dendrittiske celler (DC). Denne ikke-kommensale, jordlevende bakterien ser altså ut til å kunne interagere med humane immunceller, men også å ha immunmodulerende effekter in vivo. Mekanismene bak disse effektene er imidlertid enda ikke kjent. Målet for dette arbeidet har vært å identifisere strukturer og egenskaper ved M. capsulatus (Bath) som gjør den i stand til å interagere med en vert og påvirke immunresponser. Proteomet til M. capsulatus (Bath) ble analysert ved bioinformatiske metoder. Subcellulær lokalitet for samtlige proteiner ble predikert og bakteriens sekretom ble definert. Interaksjon med DC ble studert og utskilte proteiner ble identifisert ved eksperimentelle metoder. Arbeidet ledet til identifisering av adhesiner med putative bindingsseter for adhesjonsmolekyler på vertebratimmunceller, proteiner med mulige roller i invasjon av vertsceller og proteiner med potensiell effekt på viktige immunregulatoriske signalveier i vertebrater. Methylococcus capsulatus (Bath) is a Gram-negative, methanotroph bacterium. Although it has never been described to be part of vertebrate intestinal microbiota, M. capsulatus (Bath) has been demonstrated to have a positive effect on inflammatory conditions in vertebrates. M. capsulatus (Bath) abolishes soya induced enteritis in Atlantic salmon and to have prophylactic effect on dextran sodium sulphate induced colitis in mice. In vitro ...