Ensamblaje, anotación y análisis del mitocondrial de Lagopus muta pyrenaica

[ES] En general existen pocos datos moleculares de la especie Lagopus muta. En este trabajo describimos el mitogenoma de la subespecie Lagopus muta pyrenaica a partir de datos de secuenciación masiva. El mitogenoma de L. muta pyrenaica tiene 16,683 pb de longitud y está compuesto por 13 genes codifi...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Fernández Mimbrera, Mª Ángeles
Other Authors: Sánchez Baca, Antonio, Universidad de Jaén. Biología Experimental
Format: Bachelor Thesis
Language:Spanish
Published: Jaén: Universidad de Jaén 2021
Subjects:
Online Access:https://hdl.handle.net/10953.1/14542
Description
Summary:[ES] En general existen pocos datos moleculares de la especie Lagopus muta. En este trabajo describimos el mitogenoma de la subespecie Lagopus muta pyrenaica a partir de datos de secuenciación masiva. El mitogenoma de L. muta pyrenaica tiene 16,683 pb de longitud y está compuesto por 13 genes codificantes para proteínas, 2 genes RNA ribosómicos, 22 genes RNA transferentes y una región control. La organización y orientación de los genes es la misma que en otras especies de la familia Phasianidae. En la región control se han identificado los tres dominios, así como varias secuencias conservadas. El análisis filogenético ha demostrado que las relaciones filogenéticas obtenidas dentro de la familia Phasianidae concuerdan con las descritas previamente y reafirman el estatus de subespecie de L. muta pyrenaica. Además, los resultados demuestran que las poblaciones de L. muta pyrenaica están más relacionadas con las poblaciones europeas que con otras poblaciones de esta especie. [EN] In general, there is little molecular data on the Lagopus muta species. Here we describe the mitogenome of the subspecies Lagopus muta pyrenaica based on massive sequencing data. The mitogenome of L. muta pyrenaica is 16,683 bp in length and is composed of 13 protein-coding genes, 2 ribosomal RNA genes, 22 transfer RNA genes and a control region. The organisation and orientation of the genes is the same as in other species of the family Phasianidae. In the control region, all three domains have been identified, as well as several conserved sequences. Phylogenetic analysis has shown that the phylogenetic relationships obtained within the family Phasianidae are in agreement with those previously described and reaffirm the subspecies status of L. muta pyrenaica. Furthermore, the results show that populations of L. muta pyrenaica are more closely related to European populations than to other populations of this species.