ANÁLISE TRANSCRIPTOMICA DE PRASIOLA CRISPA REVELA GENES DE RESISTÊNCIA A RADIAÇÃO ULTRAVIOLETA

As algas constituem um grupo polifilético de organismos eucarióticos fotossintéticos extremamente diversificado. Possuem ampla distribuição em diferentes tipos de ambientes, sendo Prasiola crispa (Lightfoot) Kützing (1843), espécie pertencente à classe Trebouxiophyceae, alga com maior distribuição n...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: França, Marcos, dos Reis Matsumoto, Marlon, Leis Carvalho, Evelise, Zimmer Dezordi, Filipe, Marcos Pinto, Paulo, Echeverria Macedo, Pablo
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:unknown
Published: Anais do Salão Internacional de Ensino, Pesquisa e Extensão 2020
Subjects:
UV
Online Access:https://periodicos.unipampa.edu.br/index.php/SIEPE/article/view/91218
Description
Summary:As algas constituem um grupo polifilético de organismos eucarióticos fotossintéticos extremamente diversificado. Possuem ampla distribuição em diferentes tipos de ambientes, sendo Prasiola crispa (Lightfoot) Kützing (1843), espécie pertencente à classe Trebouxiophyceae, alga com maior distribuição no Continente Antártico. Nesse ambiente, diferentes organismos, assim como P. crispa, são constantemente expostos a variações ambientais, como variados ciclos de congelamento e descongelamento e alta incidência de radiação Ultravioleta. A exposição a esse ambiente pode impedir processos celulares, ou causar dano a macromoléculas como diferentes proteínas e DNA. Os genes associados com os mecanismos de resistência a essas condições em P. crispa são ainda desconhecidos. Sendo assim, o objetivo desse trabalho é caracterizar sequências presentes no transcriptoma de P. crispa responsáveis pela sua resistência a alta incidência de radiação Ultravioleta no Continente Antártico. Para isso, exemplares de P. Crispa foram coletados em áreas livres de gelo perto da Região da Estação Polonesa Arctowski, Baía do Almirantado, Ilha Rei George (61°50’ - 62°15’ S e 57°30’ - 59°00’ W), Antártica. RNA total foi isolado através do kit de extração Ambion (Termo Fisher Scientific). Transcriptoma foi sequenciado pela Macrogen utilizando da plataforma de sequenciamento de última geração Solexa-Illumina HiSeq 2500. Reads provenientes do sequenciamento foram submetidas a processo de montagem através do software Trinity, sendo estes dados utilizados para a composição de um banco de dados local. Sequências proteicas relacionadas a resistência a alta incidência de radiação ultravioleta foram recuperadas de bancos de dados como NCBI e Uniprot e submetidas ao algoritmo BLAST junto ao banco de dados local. Baseando-se em similaridade e um E-value igual ou inferior a 1e-5, 66 sequências proteicas foram resgatadas e ordenadas em top hits de acordo com espécie e homologia. Sendo assim, conclui-se que diante da alta taxa de semelhança de sequências ...