Streptococcus pyogenes virulans proteazına spesifik DNA aptamerlerinin geliştirilmesi

Araştırma projesi -- Ege Üniversitesi, 2018 Araştırmacı; Kaan Sami Tüzün Group A Streptococcus, et yiyen bakteri hastalığı olarak bilinen nekrotizan fasiit (NF), sepsis ve streptococcal toksik şok sendromuna yol açması nedeni ile dikkat çekmektedir. SpyCEP S. pyogenes tarafından üretilen ekstraselül...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Evran, Serap
Format: Other/Unknown Material
Language:Turkish
Published: Ege Üniversitesi 2018
Subjects:
Ege
Online Access:https://hdl.handle.net/11454/90388
Description
Summary:Araştırma projesi -- Ege Üniversitesi, 2018 Araştırmacı; Kaan Sami Tüzün Group A Streptococcus, et yiyen bakteri hastalığı olarak bilinen nekrotizan fasiit (NF), sepsis ve streptococcal toksik şok sendromuna yol açması nedeni ile dikkat çekmektedir. SpyCEP S. pyogenes tarafından üretilen ekstraselüler bir proteazdır. SpyCEP, CXC kemokinleri parçalama özelliğine sahiptir ve bu inaktivasyon mekanizması enfeksiyonun invazif karakteri ile ilgilidir. Hayvan modellerinde, SpyCEP defektli S. pyogenes'in konakçı yumuşak dokuda yayılma hızının azaldığı gösterilmiştir. DNA aptamerleri, hedeflerine yüksek seçimlilik ve ilgi ile bağlanabilen tek iplikli DNA molekülleridir. Literatürdeki benzer çalışmalarda Staphylococcus aureus, Clostridium difficile gibi çeşitli patojenlerin virulans proteinlerini, toksinlerini hedefleyen DNA aptamerleri mevcuttur. Bununla birlikte, S. pyogenes virulans proteinine spesifik DNA aptameri ilk kez bu proje kapsamında geliştirilmiştir. SpyCEP enzim aktivitesini inhibe edebilen DNA aptamerinin geliştirilmesi amacı ile SELEX (ligandların eksponansiyel zenginleştirme ile sistematik evolüsyonu) teknolojisi kullanıldı. SELEX turları sonucunda elde edilen aptamerlerin DNA dizi analizi gerçekleştirildi ve aptamerler korunmuş motif içerikleri açısından analizlendi. Seçilen aptamerlerin SpyCEP enzim aktivitesi üzerindeki inhibisyon etkileri araştırıldı. Enzim üzerinde inhibisyon etkisi gösteren DNA aptamerleri belirlendi.;DNA Aptameri, Virulans Proteazı, SELEX, S. Pyogenes.;DNA Aptamer, Virulence Protease, SELEX, S. Pyogenes.