Estudio metagenómico de la biodiversidad y potencial metabólico de hábitats terrestres de la antártica

La metagenómica es un término que describe tanto un campo de la biología como una serie de herramientas que permiten, entre otras cosas, el análisis de comunidades microbianas sin la necesidad de cultivar dichos microorganismos. El constante avance de la eficiencia y certeza de estas técnicas han co...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Fernández Hurtado, Mario Alejandro
Other Authors: Baeza Cancino, Marcelo Enrique
Format: Thesis
Language:Spanish
Published: Universidad de Chile 2023
Subjects:
Online Access:https://repositorio.uchile.cl/handle/2250/192973
Description
Summary:La metagenómica es un término que describe tanto un campo de la biología como una serie de herramientas que permiten, entre otras cosas, el análisis de comunidades microbianas sin la necesidad de cultivar dichos microorganismos. El constante avance de la eficiencia y certeza de estas técnicas han convertido a la metagenómica en una poderosa herramienta para estudiar la biodiversidad microbiana de una zona en particular. En este estudio, se investigó el potencial metabólico y la diversidad de comunidades microbianas de diez muestras de suelo de distintas localidades de la antártica mediante un alcance metagenómico de secuenciación de escopeta. Se observó que la distancia geográfica no se correlaciona con el número de diferencias significativas en metabolismo entre las muestras; a pesar de que algunas localidades fueron agrupadas según lo esperado en base a sus distancias, la mayoría de los agrupamientos no muestran una relación entre distancia y similitud metabólica. Sin embargo, se encontró que la mayoría de los módulos metabólicos son compartidos entre localidades, no observándose ninguno que no estuviera en al menos dos localidades. Además, en el conjunto de diez muestras se observaron 17 filos, 177 familias y 297 géneros bacterianos y 5 filos, 53 familias y 72 géneros fúngicos. Tanto la diversidad como abundancia de fungi observada fue menor que la bacteriana en todas las localidades. Se presentaron diferencias notables en la diversidad presente en cada localidad a varios niveles taxonómicos, habiendo solo un puñado de localidades con diversidades similares. Adicionalmente, se encontró que la disimilitud en términos de diversidad no se correlaciona con las diferencias significativas en metabolismo entre cada localidad. Finalmente, este trabajo permitió dar un primer paso en cuanto a identificar qué organismos están presentes en estas localidades y cuáles funciones y procesos metabólicos ocurren a nivel de comunidad microbiológica en los suelos estudiados. Metagenomics is a concept that encompasses a field ...