Uravnavanje izražanja nekaterih peroksidaz s transkripcijskimi faktorji TGA pri odzivu krompirja na virusno okužbo

Rastline so zaradi svoje sesilnosti neprestano izpostavljene različnim vrstam biotskega in abiotskega stresa. Bolezni, ki jih patogeni povzročajo pri ekonomsko pomembnih poljščinah, imajo lahko uničujoč vpliv na svetovno pridelavo hrane. Eden najbolj škodljivih in razširjenih rastlinskih patogenov j...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Jaklič, Barbara
Other Authors: Coll, Anna
Format: Master Thesis
Language:Slovenian
Published: 2023
Subjects:
PRX
PVY
TGA
Online Access:https://repozitorij.uni-lj.si/IzpisGradiva.php?id=152103
https://repozitorij.uni-lj.si/Dokument.php?id=177379&dn=
https://plus.cobiss.net/cobiss/si/sl/bib/174553603
https://hdl.handle.net/20.500.12556/RUL-152103
Description
Summary:Rastline so zaradi svoje sesilnosti neprestano izpostavljene različnim vrstam biotskega in abiotskega stresa. Bolezni, ki jih patogeni povzročajo pri ekonomsko pomembnih poljščinah, imajo lahko uničujoč vpliv na svetovno pridelavo hrane. Eden najbolj škodljivih in razširjenih rastlinskih patogenov je krompirjev virus Y (PVY), ki povzroča ogromne izgube pridelka po vsem svetu. Mehanizmi obrambe rastlin pred okužbami s patogeni so dobro raziskani pri modelnih rastlinah kot je Arabidopsis thaliana, medtem ko je raziskav na drugih rastlinah precej manj. Zato smo se pri magistrskem delu osredotočili na uravnavanje transkripcije pri odzivu na virusno okužbo krompirja (Solanum tuberosum, L.), ki je za rižem, pšenico in koruzo četrta najpomembnejša poljščina na svetu. Rastline so za obrambo pred patogeni razvile večravenski obrambni odziv, ki zajema z vzorci izzvano imunost (PTI) ter z efektorji izzvano imunost (ETI). Kljub različnim načinom prepoznave tako PTI kot tudi ETI izzoveta aktivacijo MAP-kinaznih signalnih kaskad, spremembe v ravni kalcijevih ionov, nastanek reaktivnih kisikovih zvrsti, spremembe uravnavanja transkripcije in spremembe v hormonskem ravnovesju. V magistrski nalogi smo se osredotočili na skupino transkripcijskih faktorjev TGA (TGAGC vezavni protein), ki jih uvrščamo v družino proteinov z bazičnim zvitjem levcinske zadrge (bZIP). Na Nacionalnem inštitutu za biologijo nedavno odkrit skrajšan transkripcijski faktor mini-TGA StTGA2.1 za razliko od ostalih predstavnikov skupine ne vsebuje bZIP DNA-vezavne domene. S testom prehodne aktivacije na rastlinah Nicotiana benthamiana smo dokazali, da se homodimeri StTGA2.1 zaradi odsotnosti DNA vezavne domene ne morejo sami po sebi vezati na tarčne regije DNA, lahko pa tvorijo heterodimere z drugimi StTGA iz skupine II, natančneje StTGA2.3. S tem uravnavajo aktivnost tarčnega promotorja za peroksidazo StPRX07 iz skupine peroksidaz III, ki sodelujejo pri nastajanju reaktivnih kisikovih zvrsti pri obrambnem odzivu rastline. Povezava med okužbo krompirja s PVY ...