La diversité des communautés microbiennes eucaryotes actives dans les océans canadiens : analyses moléculaires de la diversité du gène d'ARNr 18S et de la nitrate réductase assimilatrice

Dans les océans, les microbes sont à la base de la chaîne alimentaire et sont essentiels aux cycles biogéochimiques marins. Le domaine de l'écologie marine moléculaire a révélé que les microbes eucaryotes présentent une grande diversité à tous les rangs taxonomiques. Des recherches étudiant le...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Scarcella, Karen
Other Authors: Lovejoy, Connie
Format: Thesis
Language:French
Published: Université Laval 2009
Subjects:
geo
Online Access:https://hdl.handle.net/20.500.11794/20913
Description
Summary:Dans les océans, les microbes sont à la base de la chaîne alimentaire et sont essentiels aux cycles biogéochimiques marins. Le domaine de l'écologie marine moléculaire a révélé que les microbes eucaryotes présentent une grande diversité à tous les rangs taxonomiques. Des recherches étudiant le gène ARNr 18S à partir de l'ADN ont fourni des informations phylogénétiques sur les communautés microbiennes eucaryotes dans l'océan Arctique. Ce projet constitue la première étude portant sur la diversité de ces communautés à partir des transcrits d'ARNr. Ces transcrits ont révélé l'identité taxonomique des communautés microbiennes eucaryotes actives dans cette région sensible aux changements climatiques. En plus, ceci est la première étude, en haute mer, de la nitrate réductase assimilatrice (NR), un gène eucaryote fonctionnel clé. La comparaison entre l'ADN et l' ARN fourni de l'information sur l'histoire des masses d'eau et permet de lier la taxonomie et l'activité dans un environnement naturel. In the oceans, microbes form the basis of the food chain and are essential for marine biogeochemical cycles. The field of molecular marine ecology has shown that eucaryotic microbes are highly diverse in all taxonomic rows. DNA research on the ARNr 18S gene provided phylogenetic information on euCaryotic microbial communities in the Arctic Ocean. This project is the first study on the diversity of these communities from ARNr transcripts. These transcripts revealed the taxonomic identity of the euCaryotic microbial communities active in this climate sensitive region. In addition, this is the first study on the high seas of assimilative reducing nitrate (NR), a key functional eucaryot gene. The comparison between DNA and RNA provided with information on the history of water bodies and allows linking taxonomy and activity in a natural environment.