Denevér eredetű cirkovírusszerű vírusok diverzitása és egy Vespertilio murinus vírustörzs genomvizsgálata

A közelmúlt metagenomikai kutatásai rávilágítottak, hogy a Circoviridae család a cirkuláris, replikázt kódoló, egyszálú DNS genommal rendelkező vírusoknak (circular replication associated protein-encoding single stranded DNA virus, CRESS-DNS vírus) csak egy kis szeletét alkotja. Ezen nagyon diverz v...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Kapitány, Szilvia
Format: Thesis
Language:Hungarian
Published: 2017
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10832/1888
Description
Summary:A közelmúlt metagenomikai kutatásai rávilágítottak, hogy a Circoviridae család a cirkuláris, replikázt kódoló, egyszálú DNS genommal rendelkező vírusoknak (circular replication associated protein-encoding single stranded DNA virus, CRESS-DNS vírus) csak egy kis szeletét alkotja. Ezen nagyon diverz vírusklád tagjait kimutatták már az egysejtűektől kezdve a növényeken és ízeltlábúakon át a gerincesekig a legkülönbözőbb eukarióta fajokból. A denevér eredetű CRESS-DNS vírusok egy része a Circoviridae család tagja, de sok, ettől nagyon távol eső vírust is leírtak már. A mi vizsgálatunk célja a denevér és denevér táplálék eredetű CRESS-DNS vírusok diverzitásának feltárása, s általuk a CRESS-DNS vírusok jelenleg bonyolultnak tűnő rendszertanának megértése volt. Legfőbb kérdésünk, hogy vajon melyek lehetnek a denevérek saját, az állatokban szaporodni képes vírusai, és melyek jutnak csupán táplálkozásuk révén a szervezetükbe? Ehhez összesen 392 db európai, afrikai, ázsiai és észak-amerikai denevér mintát dolgoztunk fel, melyek zömében guanó és bélsár eredetűek voltak. A PCR analízis során a CRESS-DNS vírusok egyik megőrzött, a vírus replikációjában szerepet játszó génjének kb. 450 bp hosszú szakaszát erősítettük fel.