Tokhal-adenovírus és hal-herpeszvírusok genetikai elemzése

Észak-amerikai, fehér tokból (Acipenser transmontanus) izolált herpeszvírus (Acipenserid herpesvirus 2, AciHV-2) genomjának részleges meghatározását és elemzését, továbbá a szintén fehér tokból izolált adenovírus (white sturgeon adenovirus 1, WSAdV-1) genom teljes nukleotid szekvenciájának meghatáro...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Doszpoly, Andor
Format: Other/Unknown Material
Language:Hungarian
Subjects:
Online Access:http://hdl.handle.net/10832/167
Description
Summary:Észak-amerikai, fehér tokból (Acipenser transmontanus) izolált herpeszvírus (Acipenserid herpesvirus 2, AciHV-2) genomjának részleges meghatározását és elemzését, továbbá a szintén fehér tokból izolált adenovírus (white sturgeon adenovirus 1, WSAdV-1) genom teljes nukleotid szekvenciájának meghatározását és részletes genetikai elemzését végeztem el. A fehér tokból izolált herpeszvírus (HV) genomjának elemzése azért ígérkezett érdekesnek, mert munkám kezdetekor még nagyon kevés információ állt rendelkezésünkre az alacsonyabbrendű gerincesek HV-airól. Az AciHV-2 genom mintegy 50%-ának (66 kbp) nukleotidsorrendjét meghatároztuk és elemeztük. A vírus genomszerveződése és a filogenetikai számítások azt mutatták, hogy az AciHV-2 legközelebbi rokona a foltos csatornaharcsából (Ictalurus punctatus) izolált Ictalurid herpesvirus 1 (IcHV-1), melynek teljes nukleotidsorrendjét meghatározták a 1990-es években. Az AciHV-2-t javaslatunknak megfelelően besorolták az Ictalurivirus nemzetségbe, amit korábban az IcHV-1-nek hoztak létre a Herpesviridae családon belül. Az egyre gyarapodó molekuláris adatok hatására 2008-ban a Nemzetközi Vírusrendszertani Bizottság (ICTV) létrehozott egy új víruscsaládot, nevezetesen az Alloherpesviridae családot, a halak és kétéltűek HV-ainak és az Ictalurivirus nemzetséget átsorolták ebbe az új családba. Ugyanakkor megalapították a Herpesvirales rendet, amelyben jelenleg három család található. Az AciHV-2 mellett egy-egy génblokkot (7–7 kbp) polimeráz láncreakcióval (PCR) kinyertünk és elemeztünk fekete törpeharcsából (Ameiurus melas) és lénai tokból (Acipenser baeri) izolált HV-okból (Ictalurid herpesvirus 2, IcHV-2 és Siberian sturgeon herpesvirus, SbSHV). Továbbá PCR-rel kimutattunk Cyprinid herpesvirus 1 és 2 (CyHV-1 és 2) fertőzést hazai ponty (Cyprinus carpio) illetve ezüstkárász (Carassius gibelio) állományból. Munkám kezdetekor a WSAdV-1, mely máig az egyetlen izolált hal-adenovírus, be nem sorolt státuszban szerepelt az Adenoviridae családban. Az először meghatározott szekvenciái alapján ...