РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ
Данный выпуск журнала посвящен выдающемуся популяционному генетику Юрию Петровичу Ал- тухову, который много внимания в своих исследованиях уделял разработке молекулярно-генетических маркеров для популяционных исследований. За прошедшее время маркеры и методы их разработки претерпели существенные изм...
Published in: | Генетика |
---|---|
Main Authors: | , , , , |
Other Authors: | , |
Format: | Article in Journal/Newspaper |
Language: | unknown |
Published: |
2017
|
Subjects: | |
Online Access: | http://www.vigg.ru/genetika/html/toc/2017/toc_53.17.11.pdf http://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/111455 https://doi.org/10.7868/S0016675817110091 |
id |
ftsiberianfuniv:oai:elib.sfu-kras.ru:2311/111455 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftsiberianfuniv:oai:elib.sfu-kras.ru:2311/111455 2023-05-15T18:19:40+02:00 РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ Орешкова, Н. В. Путинцева, Ю. А. Шаров, В. В. Кузьмин, Д. А. Крутовский, К. В. Институт фундаментальной биологии и биотехнологии Базовая кафедра защиты и современных технологии мониторинга лесов 2017-11 http://www.vigg.ru/genetika/html/toc/2017/toc_53.17.11.pdf http://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/111455 https://doi.org/10.7868/S0016675817110091 unknown Генетика Q4 Орешкова, Н. В. РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ [Текст] / Н. В. Орешкова, Ю. А. Путинцева, В. В. Шаров, Д. А. Кузьмин, К. В. Крутовский // Генетика. — 2017. — Т. 53 (№ 11). — С. 1278-1284 http://www.vigg.ru/genetika/html/toc/2017/toc_53.17.11.pdf http://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/111455 doi:10.7868/S0016675817110091 генетическое разнообразие геном гетерозиготность лиственница сибирская Larix sibirica микросателлитные маркеры полногеномное секвенирование 34.05.17 Journal Article Journal Article Preprint 2017 ftsiberianfuniv https://doi.org/10.7868/S0016675817110091 2019-12-31T16:10:46Z Данный выпуск журнала посвящен выдающемуся популяционному генетику Юрию Петровичу Ал- тухову, который много внимания в своих исследованиях уделял разработке молекулярно-генетических маркеров для популяционных исследований. За прошедшее время маркеры и методы их разработки претерпели существенные изменения. Благодаря современным методам полногеномного секвенирова- ния стала возможной разработка маркеров очень широкого класса – как селективно-нейтральных, так и функциональных. Из них наиболее информативными, удобными, воспроизводимыми, относи- тельно недорогими и полиморфными остаются по-прежнему микросателлитные локусы. Полноге- номное секвенирование значительно облегчает их поиск и разработку. Данная статья посвящена разработке новых микросателлитных маркеров для очень важного вида бореальных лесов – лист- венницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.). Из полученной сборки генома лиственницы были ото- браны несколько тысяч контигов, содержащих микросателлитные локусы с ди-, три-, тетра- и пен- тануклеотидными мотивами. Всего было протестировано 59 пар праймеров для локусов с динуклео- тидными мотивами как наиболее изменчивых. Из них в конечном итоге были отобраны 11 пар для 11 локусов с динуклеотидными повторами, которые показали высокий уровень полиморфизма и могут быть использованы в различных популяционно-генетических исследованиях и для иденти- фикации происхождения древесины и растительного материала. Article in Journal/Newspaper Sibirica Siberian Federal University: Archiv Elektronnych SFU Генетика 11 1278 1284 |
institution |
Open Polar |
collection |
Siberian Federal University: Archiv Elektronnych SFU |
op_collection_id |
ftsiberianfuniv |
language |
unknown |
topic |
генетическое разнообразие геном гетерозиготность лиственница сибирская Larix sibirica микросателлитные маркеры полногеномное секвенирование 34.05.17 |
spellingShingle |
генетическое разнообразие геном гетерозиготность лиственница сибирская Larix sibirica микросателлитные маркеры полногеномное секвенирование 34.05.17 Орешкова, Н. В. Путинцева, Ю. А. Шаров, В. В. Кузьмин, Д. А. Крутовский, К. В. РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ |
topic_facet |
генетическое разнообразие геном гетерозиготность лиственница сибирская Larix sibirica микросателлитные маркеры полногеномное секвенирование 34.05.17 |
description |
Данный выпуск журнала посвящен выдающемуся популяционному генетику Юрию Петровичу Ал- тухову, который много внимания в своих исследованиях уделял разработке молекулярно-генетических маркеров для популяционных исследований. За прошедшее время маркеры и методы их разработки претерпели существенные изменения. Благодаря современным методам полногеномного секвенирова- ния стала возможной разработка маркеров очень широкого класса – как селективно-нейтральных, так и функциональных. Из них наиболее информативными, удобными, воспроизводимыми, относи- тельно недорогими и полиморфными остаются по-прежнему микросателлитные локусы. Полноге- номное секвенирование значительно облегчает их поиск и разработку. Данная статья посвящена разработке новых микросателлитных маркеров для очень важного вида бореальных лесов – лист- венницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.). Из полученной сборки генома лиственницы были ото- браны несколько тысяч контигов, содержащих микросателлитные локусы с ди-, три-, тетра- и пен- тануклеотидными мотивами. Всего было протестировано 59 пар праймеров для локусов с динуклео- тидными мотивами как наиболее изменчивых. Из них в конечном итоге были отобраны 11 пар для 11 локусов с динуклеотидными повторами, которые показали высокий уровень полиморфизма и могут быть использованы в различных популяционно-генетических исследованиях и для иденти- фикации происхождения древесины и растительного материала. |
author2 |
Институт фундаментальной биологии и биотехнологии Базовая кафедра защиты и современных технологии мониторинга лесов |
format |
Article in Journal/Newspaper |
author |
Орешкова, Н. В. Путинцева, Ю. А. Шаров, В. В. Кузьмин, Д. А. Крутовский, К. В. |
author_facet |
Орешкова, Н. В. Путинцева, Ю. А. Шаров, В. В. Кузьмин, Д. А. Крутовский, К. В. |
author_sort |
Орешкова, Н. В. |
title |
РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ |
title_short |
РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ |
title_full |
РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ |
title_fullStr |
РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ |
title_full_unstemmed |
РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ |
title_sort |
разработка микросателлитных маркеров лиственницы сибирской (larix sibirica ledeb.) на основе полногеномного de novo секвенирования |
publishDate |
2017 |
url |
http://www.vigg.ru/genetika/html/toc/2017/toc_53.17.11.pdf http://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/111455 https://doi.org/10.7868/S0016675817110091 |
genre |
Sibirica |
genre_facet |
Sibirica |
op_relation |
Генетика Q4 Орешкова, Н. В. РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ [Текст] / Н. В. Орешкова, Ю. А. Путинцева, В. В. Шаров, Д. А. Кузьмин, К. В. Крутовский // Генетика. — 2017. — Т. 53 (№ 11). — С. 1278-1284 http://www.vigg.ru/genetika/html/toc/2017/toc_53.17.11.pdf http://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/111455 doi:10.7868/S0016675817110091 |
op_doi |
https://doi.org/10.7868/S0016675817110091 |
container_title |
Генетика |
container_issue |
11 |
container_start_page |
1278 |
op_container_end_page |
1284 |
_version_ |
1766196866240741376 |