РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ ЛИСТВЕННИЦЫ СИБИРСКОЙ (Larix sibirica Ledeb.) НА ОСНОВЕ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ

• Published in: Генетика
• Main Authors: Орешкова, Н. В., Путинцева, Ю. А., Шаров, В. В., Кузьмин, Д. А., Крутовский, К. В.
• Other Authors: Институт фундаментальной биологии и биотехнологии, Базовая кафедра защиты и современных технологии мониторинга лесов
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: unknown
• Published: 2017
• Subjects: генетическое разнообразие; геном; гетерозиготность; лиственница сибирская; Larix sibirica; микросателлитные маркеры; полногеномное секвенирование; 34.05.17; Sibirica
• Online Access: http://www.vigg.ru/genetika/html/toc/2017/toc_53.17.11.pdf; http://elib.sfu-kras.ru/handle/2311/111455; https://doi.org/10.7868/S0016675817110091

Данный выпуск журнала посвящен выдающемуся популяционному генетику Юрию Петровичу Ал- тухову, который много внимания в своих исследованиях уделял разработке молекулярно-генетических маркеров для популяционных исследований. За прошедшее время маркеры и методы их разработки претерпели существенные изменения. Благодаря современным методам полногеномного секвенирова- ния стала возможной разработка маркеров очень широкого класса – как селективно-нейтральных, так и функциональных. Из них наиболее информативными, удобными, воспроизводимыми, относи- тельно недорогими и полиморфными остаются по-прежнему микросателлитные локусы. Полноге- номное секвенирование значительно облегчает их поиск и разработку. Данная статья посвящена разработке новых микросателлитных маркеров для очень важного вида бореальных лесов – лист- венницы сибирской (Larix sibirica Ledeb.). Из полученной сборки генома лиственницы были ото- браны несколько тысяч контигов, содержащих микросателлитные локусы с ди-, три-, тетра- и пен- тануклеотидными мотивами. Всего было протестировано 59 пар праймеров для локусов с динуклео- тидными мотивами как наиболее изменчивых. Из них в конечном итоге были отобраны 11 пар для 11 локусов с динуклеотидными повторами, которые показали высокий уровень полиморфизма и могут быть использованы в различных популяционно-генетических исследованиях и для иденти- фикации происхождения древесины и растительного материала.