Modeliranje i simuliranje Hodgkin-Huxley modela neurona korištenjem NEURON softvera
Prilikom izrade ovog zadatka završnog rada detaljno je obrađen postupak modeliranja i simuliranja računalnog modela neurona te podešavanja željenih parametra koristeći NEURON softver. Nadalje je objašnjen neuron te sama propagacija akcijskog potencijala sa biološkog i računalnog stajališta. Korišten...
| Main Author: | |
|---|---|
| Other Authors: | |
| Format: | Bachelor Thesis |
| Language: | Croatian |
| Published: |
Sveučilište Sjever. Sveučilišni centar Varaždin. Odjel za elektrotehniku.
2020
|
| Subjects: | |
| Online Access: | https://zir.nsk.hr/islandora/object/unin:3283 https://urn.nsk.hr/urn:nbn:hr:122:106578 https://zir.nsk.hr/islandora/object/unin:3283/datastream/PDF |
| Summary: | Prilikom izrade ovog zadatka završnog rada detaljno je obrađen postupak modeliranja i simuliranja računalnog modela neurona te podešavanja željenih parametra koristeći NEURON softver. Nadalje je objašnjen neuron te sama propagacija akcijskog potencijala sa biološkog i računalnog stajališta. Korištenjem Hodgkin-Huxley-evog matematičkog modela neurona, ovaj rad opisuje način na koji se može izraditi i simulirati propagacija akcijskog potencijala te napraviti analiza dobivenih rezultata u NEURON softveru. U radu je opisan rad neurona, svi dijelovi od kojih se on sastoji te način na koji se navedeni neuron može računalno simulirati koristeći Hodgkin-Huxley-ev model neurona. Usprkos tome što je objavljen 50-tih godina prošlog stoljeća, Hodgkin-Huxley-ev model neurona je još uvijek optimalan model za istraživanje funkcije neurona prilikom promjene određenih parametara. Kako bi se detaljno kvalificiralo korisničko iskustvo tijekom rada u NEURON softveru, opisani su glavni alati koji se koriste prilikom modeliranja. Navedena su dobra i loša iskustva prilikom korištenja NEURON softvera te su predložena moguća poboljšanja u svrhu izrade boljeg softvera. Budući da je NEURON softver svojevrsna alternativa korištenju Matlaba za modeliranje i simuliranje rada neurona, napravljena je usporedba između ovakvog tipa softvera koji koristi open-source licencu kao i softvera sa plaćenom licencom kao što je to Matlab. Iako postoje određene manjkavosti, sami rezultati simulacija govore u prilogu jednostavnosti korištenja NEURON softvera te njegovoj korisnosti u modeliranju rada neurona. During the preperation of this thesis, the process of modeling and simulating a computer model of a neuron, and setting the desired parameters, using NEURON software is discussed in detail. Moreover, the neuron and the propagation of the action potential from a biological and computational point of view are also further explained. Using Hodgkin-Huxley's mathematical model of a neuron, this thesis describes how action potential propagate and analysis ... |
|---|