Η συμβολή της Τηλεπισκόπησης στην ανίχνευση υπογραφών φυσικής επιλογής στους γκρίζους λύκους της Βόρειας Αμερικής

• Main Authors: Σαμοΐλη, Σοφία Κ., Samoili, Sophia K.
• Other Authors: Αργιαλάς, Δημήτριος, Ecole Polytechnique Federale De Lausanne, Καραθανάση, Βασιλεία, Golay, Francois (EPFL), Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Σχολή Αγρονόμων και Τοπογράφων Μηχανικών. Τομέας Τοπογραφίας. Εργαστήριο Τηλεπισκόπησης
• Format: Master Thesis
• Language: Greek
• Published: 2010
• Subjects: Φυσική επιλογή; Αναγνώριση υπογραφών; Μέθοδος χωρικής ανάλυσης; Γενετική τοπίου; Περιβαλλοντική πίεση; Μικρο-δορυφόροι; Λογιστική παλινδρόμηση; Μοντέλα συσχέτισης; Σημαντικά αλληλόμορφα γονίδια; Γενετική διαφοροποίηση; Natural selection; Signature detection; Spatial analysis method; Landscape genetics; Environmental pressure; Microsatellites; Logistic regression; Association models; Significant alleles; Genetic diversity; Canis lupus
• Online Access: https://dspace.lib.ntua.gr/xmlui/handle/123456789/3275; https://doi.org/10.26240/heal.ntua.1101

208 σ. Μεταπτυχιακή Εργασία -- Εθνικό Μετσόβιο Πολυτεχνείο. Διεπιστημονικό - Διατμηματικό Πρόγραμμα Μεταπτυχιακών Σπουδών (Δ.Π.Μ.Σ.) "Περιβάλλον και Ανάπτυξη" Η παρούσα μεταπτυχιακή διπλωματική αποτελεί μια διεπιστημονική προσέγγιση για την αναγνώριση υπογραφών φυσικής επιλογής λόγω περιβαλλοντικής επίδρασης, εξετάζοντας τη συμβολή της Τηλεπισκόπησης και της Χωρικής Ανάλυσης στο πεδίο της Γενετικής του Τοπίου (Landscape Genetics). Αν και πληθώρα μελετών επιχείρησαν να συνδέσουν γενετική και περιβαλλοντική πληροφορία, ώστε να αποκαλυφθούν τα γονίδια που έχουν σχηματιστεί υπό την επίδραση της φυσικής επιλογής λόγω ποικίλων αλληλεπιδρώντων περιβαλλοντικών παραγόντων, πολλές επίδοξες τηλεπισκοπικής φύσεως παράμετροι δεν έχουν ακόμη αξιοποιηθεί ευρέως. Η εργασία αυτή στοχεύει στην κάλυψη αυτού του κενού, ερευνώντας το ενδεχόμενο τηλεπισκοπικά δεδομένα να προκαλέσουν την ανάδειξη σημαντικών συσχετίσεων μεταξύ γονιδίων και περιβάλλοντος. Ένα ετερογενές σύνολο ποσοτικών και ποιοτικών παραμέτρων από ένα ευρύ πεδίο πηγών συλλέχθηκε και εξετάστηκε για πιθανές συσχετίσεις μεταξύ αλληλόμορφων συχνοτήτων σε συγκεκριμένες κωδικοποιημένες θέσεις του γονιδιώματος (marker loci) και περιβαλλοντικών παραμέτρων, ώστε να αναγνωριστούν οι υπογραφές της φυσικές επιλογής στο γονιδίωμα του γκρίζου λύκου της Βόρειας Αμερικής (Canis lupus). Ιδιαίτερη έμφαση δόθηκε στην διερεύνηση του κανονικοποιημένου δείκτη βλάστησης (NDVI), καθώς αποτελεί καινοτόμο υποψήφιο προγνωστικό παράγοντα στην εξελικτική διαφοροποίηση των δειγμάτων του υπό εξέταση πληθυσμού. Το σύνολο των δεδομένων που τελικά αναλύθηκε, αποτελείτο από γενετικά δείγματα από μικρο-δορυφόρους (microsatellites), και δύο τύπους περιβαλλοντικών παραμέτρων, κλιματικών και τηλεπισκοπικών (NDVI, altitude), τα οποία συλλέχθηκαν σαν μηνιαίες μεταβλητές – όπου ήταν διαθέσιμες – ώστε να εξεταστούν για πιθανή επίδραση από την εποχικότητα των γενετικών δεδομένων. Η επεξεργασία τους πραγματοποιήθηκε από τη Μέθοδο Χωρικής Ανάλυσης (Spatial Analysis Method - SAM) για 22 περιβαλλοντικές και 523 ...