Investigating the influence of biofilter-biofilm bacterial communities on the microbiota of rearing water and Atlantic salmon fry in RAS

Resirkulerende akvakultursystemer (RAS) gir mange fordeler, blant annet vannsparing, redusert miljøpåvirkning og bedre kontroll over vannkvalitetsparametere, noe som til slutt fører til bedre vekst hos oppdrettsfisken. En viktig fordel med RAS er evnen til å regulere vannkvaliteten og skape optimale...

Full description

Bibliographic Details
Main Author: Aasen, Anna
Other Authors: Bakke, Ingrid
Format: Master Thesis
Language:English
Published: NTNU 2023
Subjects:
Online Access:https://hdl.handle.net/11250/3085315
Description
Summary:Resirkulerende akvakultursystemer (RAS) gir mange fordeler, blant annet vannsparing, redusert miljøpåvirkning og bedre kontroll over vannkvalitetsparametere, noe som til slutt fører til bedre vekst hos oppdrettsfisken. En viktig fordel med RAS er evnen til å regulere vannkvaliteten og skape optimale forhold for de oppdrettede organismene. Dessverre er vår kunnskap om mikrobielle samfunnsdynamikker i RAS begrenset på grunn av manglende forskning. I tillegg fungerer biofilteret, en essensiell komponent i RAS som fjerner giftige nitrogenforbindelser utskilt av fisken, som et betydelig reservoir for bakterier. Vi vet imidlertid lite om innvirkningen av disse bakteriene i biofilter-biofilm på mikrobiotaen i oppdrettsvannet og hos fisken. Målet med denne studien var å undersøke hvordan biofilter-biofilm-bakteriesamfunnene påvirker mikrobiotaen i oppdrettsvannet og hos atlantisk lakseyngel i RAS. Vi oppdrettet atlantisk lakseyngel i to identiske laboratoriebaserte RAS-anlegg som opererte under samme forhold, med den eneste forskjellen i biofilm-bærerne som ble brukt i biofilterne. Disse biofilm-bærerne ble hentet fra to kommersielle RAS-anlegg som var lokalisert i ulike geografiske områder. Etter 30 dagers drift ble biofilm-bærerne byttet mellom systemene. Selv om eksperimentet var planlagt å vare i 60 dager, ble det avsluttet etter 40 dager på grunn av en uventet strømbrudd. I løpet av eksperimentet ble prøver av biofilm-bærerne, suspendert vann og lakseyngel samlet inn, og bakteriesamfunnsanalyse ble utført ved hjelp av Illumina-sekvensering av 16S rDNA-ampliconer. Resultatene viste betydelige forskjeller mellom de bakterielle samfunnene i oppdrettsvannet og lakseyngelen sammenlignet med biofilter-biofilm-mikrobiotaen gjennom hele eksperimentet. Imidlertid hadde både vannet og biofilm-bærerne en høy andel av delte taksonomiske grupper, som Rhodobacterales og Burkholderiales. Videre viste vannets mikrobiota større likhet med biofilter-biofilm-mikrobiotaen innenfor sitt eget system. Selv om mikrobiotaen hos ...