SIMULATION OF EPIDEMIC TRANSMISSION OF МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN THE SAKHA REPUBLIC (YUKUTIA )

Goal: reconstruction of epidemic transmission of Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis on the territory with limited migration based on the comparative study of 153 isolates isolated from patients of different generations in theSakhaRepublic (Yakutia).Materials and methods. The structure of...

Full description

Bibliographic Details
Published in:Tuberculosis and Lung Diseases
Main Authors: S. N. Zhdаnovа, O. B. Ogаrkov, M. K. Vinokurovа, G. I. Аlekseevа, A. F. Krаvchenko, E. D. Sаvilov, С. Н. Жданова, О. Б. Огарков, М. К. Винокурова, Г. И. Алексеева, А. Ф. Кравченко, Е. Д. Савилов
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:Russian
Published: Медицинские знания и технологии 2017
Subjects:
Beijing
MIRU-VNTR
epidemic genotypes
эпидемические генотипы
Sakha Republic
Yakutia
Саха
Якути*
Якутия
Online Access:https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1022
https://doi.org/10.21292/2075-1230-2017-95-7-40-47
id ftjtibl:oai:oai.tiblj.elpub.ru:article/1022
record_format openpolar
institution Open Polar
collection Tuberculosis and Lung Diseases
op_collection_id ftjtibl
language Russian
topic Beijing
MIRU-VNTR
epidemic genotypes
эпидемические генотипы
spellingShingle Beijing
MIRU-VNTR
epidemic genotypes
эпидемические генотипы
S. N. Zhdаnovа
O. B. Ogаrkov
M. K. Vinokurovа
G. I. Аlekseevа
A. F. Krаvchenko
E. D. Sаvilov
С. Н. Жданова
О. Б. Огарков
М. К. Винокурова
Г. И. Алексеева
А. Ф. Кравченко
Е. Д. Савилов
SIMULATION OF EPIDEMIC TRANSMISSION OF МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN THE SAKHA REPUBLIC (YUKUTIA )
topic_facet Beijing
MIRU-VNTR
epidemic genotypes
эпидемические генотипы
description Goal: reconstruction of epidemic transmission of Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis on the territory with limited migration based on the comparative study of 153 isolates isolated from patients of different generations in theSakhaRepublic (Yakutia).Materials and methods. The structure of Mycobacterium tuberculosis population was described and analyzed through MIRU-VNTR-genotyping, subtyping of the parts of RD105/RD207 genome, pattern classification as per clonal pattern of Merker M. et al (2015), and phylogenetic simulation.Results. It was found out that highly transmissive subtypes of Beijing genotype having a high potential of developing drug resistance was confidently more prevalent (χ2 = 8.3, p < 0.01) among younger people (born after 1990) compared to the older generation (born before 1959). It was also found out that during previous five decades a certain shift occurred in the structure of M. tuberculosis population.Conclusion. The obtained data confirm the hypothesis that epidemic sybtypes ofBeijing genotype were brought to the territory of theSakhaRepublic (Yakutia) fairly recently (approximately fifty years ago) compared to the other regions ofRussia. Цель: реконструкция эпидемического распространения штаммов генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis на территории с ограниченными миграционными событиями на основе сравнительного изучения 153 изолятов, полученных от больных разных поколений из Республики Саха (Якутия).Материалы и методы. Путем MIRU-VNTR-генотипирования, субтипирования по участкам генома RD105/RD207, классификации паттернов по клональным комплексам Merker M. et al. (2015) и филогенетического моделирования была описана и проанализирована структура популяции Mycobacterium tuberculosis. Результаты. Показано, что высокотрансмиссивные субтипы генотипа Beijing, несущие высокий потенциал формирования антибиотикорезистентности, значимо чаще (χ2 = 8,3, p < 0,01) встречаются у молодых (после 1990 года рождения), чем в старшем поколении (до 1959 года рождения). Определен сдвиг в ...
format Article in Journal/Newspaper
author S. N. Zhdаnovа
O. B. Ogаrkov
M. K. Vinokurovа
G. I. Аlekseevа
A. F. Krаvchenko
E. D. Sаvilov
С. Н. Жданова
О. Б. Огарков
М. К. Винокурова
Г. И. Алексеева
А. Ф. Кравченко
Е. Д. Савилов
author_facet S. N. Zhdаnovа
O. B. Ogаrkov
M. K. Vinokurovа
G. I. Аlekseevа
A. F. Krаvchenko
E. D. Sаvilov
С. Н. Жданова
О. Б. Огарков
М. К. Винокурова
Г. И. Алексеева
А. Ф. Кравченко
Е. Д. Савилов
author_sort S. N. Zhdаnovа
title SIMULATION OF EPIDEMIC TRANSMISSION OF МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN THE SAKHA REPUBLIC (YUKUTIA )
title_short SIMULATION OF EPIDEMIC TRANSMISSION OF МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN THE SAKHA REPUBLIC (YUKUTIA )
title_full SIMULATION OF EPIDEMIC TRANSMISSION OF МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN THE SAKHA REPUBLIC (YUKUTIA )
title_fullStr SIMULATION OF EPIDEMIC TRANSMISSION OF МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN THE SAKHA REPUBLIC (YUKUTIA )
title_full_unstemmed SIMULATION OF EPIDEMIC TRANSMISSION OF МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN THE SAKHA REPUBLIC (YUKUTIA )
title_sort simulation of epidemic transmission of мycobacterium tuberculosis in the sakha republic (yukutia )
publisher Медицинские знания и технологии
publishDate 2017
url https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1022
https://doi.org/10.21292/2075-1230-2017-95-7-40-47
genre Sakha Republic
Yakutia
Саха
Якути*
Якутия
genre_facet Sakha Republic
Yakutia
Саха
Якути*
Якутия
op_source Tuberculosis and Lung Diseases; Том 95, № 7 (2017); 40-47
Туберкулез и болезни легких; Том 95, № 7 (2017); 40-47
2542-1506
2075-1230
op_relation https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1022/1023
Жданова С. Н., Алексеева Г. И., Огарков О. Б., Кравченко А. Ф., Зоркальцева Е. Ю., Винокурова М. К., Савилов Е. Д. Сравнительный анализ генотипов Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутия) и Иркутской области // Якутский медицинский журнал. ‒ 2013. ‒ № 1. ‒ С. 68-71.
Жданова С. Н., Огарков О. Б., Степаненко Л. А., Лац А. А., Синьков В. В., Унтанова Л. С., Алексеева Г. И., Савилов Е. Д. Применение делеционного анализа по RD105 для выявления генотипа Пекин Mycobacterium tuberculosis // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра Сибирского отделения Российской академии медицинских наук. ‒ 2011. ‒ № 2. ‒ С. 194-197.
Сивцева С. И. Население Якутии после войны: условия жизни и быта // Вестник СВФУ. – 2013. – Т.10. – С. 69-74.
Синьков В. В., Савилов Е. Д., Огарков О. Б. Реконструкция эпидемической истории «пекинского» генотипа Mycobacterium tuberculosis в России и странах бывшего СССР по результатам сполиготипирования // Мол. генетика микробиол. вирусол. ‒ 2011. ‒ № 3. ‒ С. 25-29.
Синьков В. В., Савилов Е. Д., Огарков О. Б. Эпидемиология туберкулёза в России: молекулярные и исторические доказательства в пользу сценария распространения пекинского генотипа M. tuberculosis в XX в. // Туб. и болезни легких. ‒ 2012. ‒ № 3. ‒ С. 057-062.
Сукнёва С. А. Миграционные процессы в Республике Саха (Якутия) // Пространственная экономика. ‒ 2008. ‒ № 1. ‒ С. 62-67.
Dabernat H., Theves C., Bouakaze C., Nikolaeva D., Keyser C., Mokrousov I., Geraut A., Duchesne S., Gerard P., Alexeev A. N., Crubezy E., Ludes B. Tuberculosis Epidemiology and Selection in an Autochthonous Siberian Population from the 16th-19th Century // PLoS ONE. ‒ 2014. ‒ Vol. 9, № 2: e89877. doi:10.1371/journal.pone.0089877.
Groenheit R., Ghebremichael S., Pennhag A., Jonsson J., Hoffner S., Couvin D., Koivula T., Rastogi N., Kallenius G. Mycobacterium tuberculosis strains potentially involved in the TB epidemic in Sweden a century ago // PLOS ONE. ‒ 2012. ‒ Vol. 77, № 10:e46848. DOI:10.1371/journal.pone.0046848.
Marais B. J., Gie R. P., Schaaf H. S., Hesseling A. C., Obihara C. C., Starke J. J., Enarson D. A., Donald P. R., Beyers N. The natural history of childhood intra-thoracic tuberculosis: a critical review of literature from the pre-chemotherapy era // Int. J. Tuberc. Lung Dis. ‒ 2004. ‒ Vol. 8, № 4. ‒ Р. 392-402.
Merker M., Blin C., Mona S., Duforet-Frebourg N., Lecher S., Willery E., Blum M. G., Rusch-Gerdes S., Mokrousov I., Aleksic E. et al. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage // Nat Genet. ‒ 2015. ‒ Vol. 47, № 3. ‒ P. 242-249.
MIRU. URL: http://www.miru-vntrplus.org/MIRU/miruinfo.faces;jsessionid= 89112F274226E781C7B0B0D9118FDD70
Mokrousov I. Insights into the origin, emergence, and current spread of a successful Russian clone of Mycobacterium tuberculosis // Clin. Microbiol. Rev. ‒ 2013. ‒ Vol. 26, № 2. ‒ P. 342-360.
Mokrousov I., Ly H. M., Otten T., Lan N. N., Vyshnevskyi B., Hoffner S., Narvskaya O. Origin and primary dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: clues from human phylogeography // Genome Res. ‒ 2005. ‒ Vol. 15, № 10. ‒ P. 1357-1364.
Morariu V. I., Srinivasan B. V., Raykar V. C., Duraiswami R., Davis L. Automatic online tuning for fast Gaussian summation // Advances in Neural Information Processing Systems. ‒ 2008. ‒ Vol. 21. ‒ P. 1113-1120.
Ogarkov O., Mokrousov I., Sinkov V., Zhdanova S., Antipina S., Savilov E. «Lethal» combination of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209 -336G allele in Russian male population // Infect. Genet. Evol. ‒ 2012. ‒ Vol. 12, № 4. ‒ P. 732-736.
Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M. The UGENE team. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit // Bioinformatics. ‒ 2012. ‒ Vol. 28. ‒ P. 1166-1167.
SITVIT. URL: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_ONLINE/query
Smit P. W., Haanpera M., Rantala P., Couvin D., Lyytikainen O., Rastogi N., Ruutu P., Soini H. Genotypic characterization and historical perspective of Mycobacterium tuberculosis among older and younger Finns, 2008-2011 // Clin. Microbiol. Infect. ‒ 2014. ‒ Vol. 20, № 11. ‒ Р. 1134-1139.
Supply P., Allix C., Lesjean S., Cardoso-Oelemann M., Rusch-Gerdes S., Willery E., Savine E., de Haas P., van Deutekom H., Roring S. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. ‒ 2006. ‒ Vol. 44, № 12. ‒ P. 4498-4510.
Zhdanova S., Heysell S., Ogarkov O., Boyarinova G., Alexeeva G., Pholwat S., Zorkaltseva E., Houpt E., Savilov E. Primary multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in 2 regions, Eastern Siberia, Russian Federation // Emerging infectious diseases. ‒ 2013. ‒ Vol. 19, № 10. ‒ P. 1649-1652.
https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1022
doi:10.21292/2075-1230-2017-95-7-40-47
op_rights Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
op_doi https://doi.org/10.21292/2075-1230-2017-95-7-40-4710.1371/journal.pone.008987710.1371/journal.pone.0046848
container_title Tuberculosis and Lung Diseases
container_volume 95
container_issue 7
container_start_page 40
op_container_end_page 47
_version_ 1810474411602477056
spelling ftjtibl:oai:oai.tiblj.elpub.ru:article/1022 2024-09-15T18:32:41+00:00 SIMULATION OF EPIDEMIC TRANSMISSION OF МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS IN THE SAKHA REPUBLIC (YUKUTIA ) МОДЕЛИРОВАНИЕ ЭПИДЕМИЧЕСКОГО РАСПРОСТРАНЕНИЯ ГЕНОТИПА ВEIJING МYCOBACTERIUM TUBERCULOSIS В РЕСПУБЛИКЕ САХА (ЯКУТИЯ) S. N. Zhdаnovа O. B. Ogаrkov M. K. Vinokurovа G. I. Аlekseevа A. F. Krаvchenko E. D. Sаvilov С. Н. Жданова О. Б. Огарков М. К. Винокурова Г. И. Алексеева А. Ф. Кравченко Е. Д. Савилов 2017-08-09 application/pdf https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1022 https://doi.org/10.21292/2075-1230-2017-95-7-40-47 rus rus Медицинские знания и технологии https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1022/1023 Жданова С. Н., Алексеева Г. И., Огарков О. Б., Кравченко А. Ф., Зоркальцева Е. Ю., Винокурова М. К., Савилов Е. Д. Сравнительный анализ генотипов Mycobacterium tuberculosis в Республике Саха (Якутия) и Иркутской области // Якутский медицинский журнал. ‒ 2013. ‒ № 1. ‒ С. 68-71. Жданова С. Н., Огарков О. Б., Степаненко Л. А., Лац А. А., Синьков В. В., Унтанова Л. С., Алексеева Г. И., Савилов Е. Д. Применение делеционного анализа по RD105 для выявления генотипа Пекин Mycobacterium tuberculosis // Бюллетень Восточно-Сибирского научного центра Сибирского отделения Российской академии медицинских наук. ‒ 2011. ‒ № 2. ‒ С. 194-197. Сивцева С. И. Население Якутии после войны: условия жизни и быта // Вестник СВФУ. – 2013. – Т.10. – С. 69-74. Синьков В. В., Савилов Е. Д., Огарков О. Б. Реконструкция эпидемической истории «пекинского» генотипа Mycobacterium tuberculosis в России и странах бывшего СССР по результатам сполиготипирования // Мол. генетика микробиол. вирусол. ‒ 2011. ‒ № 3. ‒ С. 25-29. Синьков В. В., Савилов Е. Д., Огарков О. Б. Эпидемиология туберкулёза в России: молекулярные и исторические доказательства в пользу сценария распространения пекинского генотипа M. tuberculosis в XX в. // Туб. и болезни легких. ‒ 2012. ‒ № 3. ‒ С. 057-062. Сукнёва С. А. Миграционные процессы в Республике Саха (Якутия) // Пространственная экономика. ‒ 2008. ‒ № 1. ‒ С. 62-67. Dabernat H., Theves C., Bouakaze C., Nikolaeva D., Keyser C., Mokrousov I., Geraut A., Duchesne S., Gerard P., Alexeev A. N., Crubezy E., Ludes B. Tuberculosis Epidemiology and Selection in an Autochthonous Siberian Population from the 16th-19th Century // PLoS ONE. ‒ 2014. ‒ Vol. 9, № 2: e89877. doi:10.1371/journal.pone.0089877. Groenheit R., Ghebremichael S., Pennhag A., Jonsson J., Hoffner S., Couvin D., Koivula T., Rastogi N., Kallenius G. Mycobacterium tuberculosis strains potentially involved in the TB epidemic in Sweden a century ago // PLOS ONE. ‒ 2012. ‒ Vol. 77, № 10:e46848. DOI:10.1371/journal.pone.0046848. Marais B. J., Gie R. P., Schaaf H. S., Hesseling A. C., Obihara C. C., Starke J. J., Enarson D. A., Donald P. R., Beyers N. The natural history of childhood intra-thoracic tuberculosis: a critical review of literature from the pre-chemotherapy era // Int. J. Tuberc. Lung Dis. ‒ 2004. ‒ Vol. 8, № 4. ‒ Р. 392-402. Merker M., Blin C., Mona S., Duforet-Frebourg N., Lecher S., Willery E., Blum M. G., Rusch-Gerdes S., Mokrousov I., Aleksic E. et al. Evolutionary history and global spread of the Mycobacterium tuberculosis Beijing lineage // Nat Genet. ‒ 2015. ‒ Vol. 47, № 3. ‒ P. 242-249. MIRU. URL: http://www.miru-vntrplus.org/MIRU/miruinfo.faces;jsessionid= 89112F274226E781C7B0B0D9118FDD70 Mokrousov I. Insights into the origin, emergence, and current spread of a successful Russian clone of Mycobacterium tuberculosis // Clin. Microbiol. Rev. ‒ 2013. ‒ Vol. 26, № 2. ‒ P. 342-360. Mokrousov I., Ly H. M., Otten T., Lan N. N., Vyshnevskyi B., Hoffner S., Narvskaya O. Origin and primary dispersal of the Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype: clues from human phylogeography // Genome Res. ‒ 2005. ‒ Vol. 15, № 10. ‒ P. 1357-1364. Morariu V. I., Srinivasan B. V., Raykar V. C., Duraiswami R., Davis L. Automatic online tuning for fast Gaussian summation // Advances in Neural Information Processing Systems. ‒ 2008. ‒ Vol. 21. ‒ P. 1113-1120. Ogarkov O., Mokrousov I., Sinkov V., Zhdanova S., Antipina S., Savilov E. «Lethal» combination of Mycobacterium tuberculosis Beijing genotype and human CD209 -336G allele in Russian male population // Infect. Genet. Evol. ‒ 2012. ‒ Vol. 12, № 4. ‒ P. 732-736. Okonechnikov K., Golosova O., Fursov M. The UGENE team. Unipro UGENE: a unified bioinformatics toolkit // Bioinformatics. ‒ 2012. ‒ Vol. 28. ‒ P. 1166-1167. SITVIT. URL: http://www.pasteur-guadeloupe.fr:8081/SITVIT_ONLINE/query Smit P. W., Haanpera M., Rantala P., Couvin D., Lyytikainen O., Rastogi N., Ruutu P., Soini H. Genotypic characterization and historical perspective of Mycobacterium tuberculosis among older and younger Finns, 2008-2011 // Clin. Microbiol. Infect. ‒ 2014. ‒ Vol. 20, № 11. ‒ Р. 1134-1139. Supply P., Allix C., Lesjean S., Cardoso-Oelemann M., Rusch-Gerdes S., Willery E., Savine E., de Haas P., van Deutekom H., Roring S. et al. Proposal for standardization of optimized mycobacterial interspersed repetitive unit-variable-number tandem repeat typing of Mycobacterium tuberculosis // J. Clin. Microbiol. ‒ 2006. ‒ Vol. 44, № 12. ‒ P. 4498-4510. Zhdanova S., Heysell S., Ogarkov O., Boyarinova G., Alexeeva G., Pholwat S., Zorkaltseva E., Houpt E., Savilov E. Primary multidrug-resistant Mycobacterium tuberculosis in 2 regions, Eastern Siberia, Russian Federation // Emerging infectious diseases. ‒ 2013. ‒ Vol. 19, № 10. ‒ P. 1649-1652. https://www.tibl-journal.com/jour/article/view/1022 doi:10.21292/2075-1230-2017-95-7-40-47 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие в данном журнале, соглашаются со следующим:Авторы сохраняют за собой авторские права на работу и предоставляют журналу право первой публикации работы на условиях лицензии Creative Commons Attribution License, которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы сохраняют право заключать отдельные контрактные договорённости, касающиеся не-эксклюзивного распространения версии работы в опубликованном здесь виде (например, размещение ее в институтском хранилище, публикацию в книге), со ссылкой на ее оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). Tuberculosis and Lung Diseases; Том 95, № 7 (2017); 40-47 Туберкулез и болезни легких; Том 95, № 7 (2017); 40-47 2542-1506 2075-1230 Beijing MIRU-VNTR epidemic genotypes эпидемические генотипы info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2017 ftjtibl https://doi.org/10.21292/2075-1230-2017-95-7-40-4710.1371/journal.pone.008987710.1371/journal.pone.0046848 2024-07-04T03:02:47Z Goal: reconstruction of epidemic transmission of Beijing genotype of Mycobacterium tuberculosis on the territory with limited migration based on the comparative study of 153 isolates isolated from patients of different generations in theSakhaRepublic (Yakutia).Materials and methods. The structure of Mycobacterium tuberculosis population was described and analyzed through MIRU-VNTR-genotyping, subtyping of the parts of RD105/RD207 genome, pattern classification as per clonal pattern of Merker M. et al (2015), and phylogenetic simulation.Results. It was found out that highly transmissive subtypes of Beijing genotype having a high potential of developing drug resistance was confidently more prevalent (χ2 = 8.3, p < 0.01) among younger people (born after 1990) compared to the older generation (born before 1959). It was also found out that during previous five decades a certain shift occurred in the structure of M. tuberculosis population.Conclusion. The obtained data confirm the hypothesis that epidemic sybtypes ofBeijing genotype were brought to the territory of theSakhaRepublic (Yakutia) fairly recently (approximately fifty years ago) compared to the other regions ofRussia. Цель: реконструкция эпидемического распространения штаммов генотипа Beijing Mycobacterium tuberculosis на территории с ограниченными миграционными событиями на основе сравнительного изучения 153 изолятов, полученных от больных разных поколений из Республики Саха (Якутия).Материалы и методы. Путем MIRU-VNTR-генотипирования, субтипирования по участкам генома RD105/RD207, классификации паттернов по клональным комплексам Merker M. et al. (2015) и филогенетического моделирования была описана и проанализирована структура популяции Mycobacterium tuberculosis. Результаты. Показано, что высокотрансмиссивные субтипы генотипа Beijing, несущие высокий потенциал формирования антибиотикорезистентности, значимо чаще (χ2 = 8,3, p < 0,01) встречаются у молодых (после 1990 года рождения), чем в старшем поколении (до 1959 года рождения). Определен сдвиг в ... Article in Journal/Newspaper Sakha Republic Yakutia Саха Якути* Якутия Tuberculosis and Lung Diseases Tuberculosis and Lung Diseases 95 7 40 47

Similar Items