Hantaviruses in Insectivore Populations in Siberia

• Published in: New Theatre Quarterly
• Main Authors: L. Yashina N., S. Abramov A., T. Dupal A., V. Yakimenko V., A. Tantsev K., B. Malyshev S., M. Kartashov Yu., Л. Яшина Н., C. Абрамов А., Т. Дупал А., В. Якименко В., А. Танцев К., Б. Малышев С., М. Карташов Ю.
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: Russian
• Published: Russian Research Anti-Plague Institute “Microbe” 2018
• Subjects: hantavirus; insectivores; Siberia; хантавирус; насекомоядные; Сибирь; Sakha; Sakha Republic; Саха
• Online Access: https://journal.microbe.ru/jour/article/view/1098; https://doi.org/10.21055/0370-1069-2018-4-89-93

Objective of the study was investigation of hantaviruses in a new natural reservoir - insectivores, their diversity and geographic distribution in the Western and Eastern Siberia. Materials and methods. Sorex shrews (71 specimens) were captured in Altai Republic, Altai, and Krasnoyarsk Territories, and Omsk Region. All samples were analyzed for hantavirus RNA using reverse transcription polymerase chain reaction with subsequent sequencing. Results and conclusions. A total of 12 viral RNA isolates from two Sorex species (S. araneus and S. roboratus) were genetically typed. Sequence analysis of the partial L and S segments identified two distinct hantaviruses. Kenkeme (KKMV) virus was detected in a flat-skulled shrew (S. roboratus) in Altai Territory. This virus was previously found in geographically remote sites in the Sakha Republic and China. New foci of Seewis virus circulation among common shrews (S. araneus), were found in the Omsk Region, Altai and Krasnoyarsk Territories. Previously published and new findings suggest that hantaviruses among shrews are widely distributed over the Russian Federation territory. The widespread circulation of SWSV and KKMV throughout Siberia is an important argument for investigation of their role in human infections. Цель работы: исследование хантавирусов в новом природном резервуаре - насекомоядных, их многообразия и распространения на территории Западной и Восточной Сибири. Материалы и методы. Бурозубки рода Sorex (71 особь) отловлены на территории республики Алтай, Алтайского, Красноярского краев и Омской области. Все образцы выделенных РНК проанализированы методом обратной транскрипции - полимеразной цепной реакции с последующим секвенированием. результаты и выводы. Генотипированы 12 РНК изолятов вируса, выделенных от двух видов бурозубок - обыкновенной (S. araneus)и бурой (S. roboratus).Анализ последовательностей L- и S-сегментов вирусного генома выявил циркуляцию двух видов хантавирусов. В Алтайском крае у бурой бурозубки (S. roboratus)обнаружен вирус Кенкеме (KKMV), ранее найденный в географически удаленных точках Республики Саха и Китая. Новые очаги циркуляции вируса Сивис (SWSV) среди обыкновенных бурозубок (S. araneus) установлены на территории омской области, Алтайского и Красноярского краев. суммируя новые и ранее полученные данные, можно заключить, что хантавирусы в популяциях насекомоядных широко распростра­нены на территории Российской Федерации. Установленная на территории Сибири широкая циркуляция вирусов SWSV и KKMV дает веские основания для исследования роли выявленных вирусов в патологии человека.