The case of multiple osteohondromas in Yakut family (Eastern Siberia, Russia) caused by rare mutation in the EXT2 gene

• Published in: Nauchno-prakticheskii zhurnal «Medicinskaia genetika»
• Main Authors: A. Yakovleva E., D. Petukhova A., P. Golikova I., E. Gurinova E., A. Danilova L., A. Sukhomyasova L., N. Maksimova R., А. Яковлева Е., Д. Петухова А., П. Голикова И., Е. Гуринова Е., А. Данилова Л., А. Сухомясова Л., Н. Максимова Р.
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: Russian
• Published: Publishing House «Genius Media» LLC 2020
• Subjects: множественная экзостозная хондродисплазия; EXT2; массовое параллельное секвенирование (МПС); якуты; multiple osteochondromas; massive parallel sequencing (MPS); Yakuts; Yakut; Siberia
• Online Access: https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/745; https://doi.org/10.25557/2073-7998.2019.12.25-33

Introduction. Multiple osteohondromas (MO) is an autosomal dominant inherited skeletal disease characterized by the formation of multiple cartilaginous exostoses in the areas of growth in a long bones. Difficult issues arise for the genetic counseling of families with MO. We presents the clinical and molecular genetic analysis of four-generation Yakut family with an autosomal dominant inherited MO, caused by a rare mutation in the EXT2 gene. Aim: сonducting a clinical, genealogical, molecular genetic study of patients with a clinical diagnosis MO. Methods. Targeted panel sequencing performed for the 4800 known candidate genes using Trusight One Sequencing Panel (Illumina Inc., USA) on one sample (DNA of proband). Sanger sequencing was performed for validation of candidate disease causing mutation in DNA from a proband and family members. Results. A rare EXT2 nonsense mutation (c.751C> T, p.Gln251*) was revealed by targeted exome sequencing and validated by Sanger sequencing in the 7 MO-affected members of this family. The variant was interpreted as pathogenic based on an in silico analysis. This mutation was absent in 4 healthy members of this family and in 10 controls. Conclusions. This is the first study of EXT2 gene mutation in a Russian patients from Yakut family with MO. Timely health care of patients with diagnosis of MO can contribute to establishment coordinated multispecialty management of the patient focusing on the orthopedic problems issues through childhood. Введение. Множественная экзостозная хондродисплазия (МЭХД) - наследственное аутосомно-доминантное заболевание скелета, которое характеризуется образованием множественных хрящевых экзостозов в зонах роста костей. Консультирование семей с МЭХД является сложной задачей для врача-генетика. В статье приведены клинические, молекулярно-генетические данные обследования большой якутской семьи с аутосомно-доминантной наследственной МЭХД, причиной которой является редкая мутация в гене EXT2. Цель: проведение клинико-генеалогического, молекулярно-генетического обследования больных с клиническим диагнозом МЭХД. Методы. В исследование включены 4 поколения одной якутской семьи (11 больных и здоровых членов). Секвенирование экзома одного члена семьи (ДНК пробанда) проводилось на секвенаторе MiSeq Illumina с использованием панели, включающей 4800 генов. Патогенность выявленной мутации подтверждалась in silico, а также секвенированием по Сэнгеру с использованием ДНК пробанда, его родителей. Данный метод также был использован для выявления мутации у остальных членов семьи. Результаты. В результате молекулярно-генетического исследования у 7 членов семьи с клиническим диагнозом МЭХД была выявлена редкая нонсенс-мутация c.751С>T в экзоне 5 гена EXT2 в гетерозиготном состоянии. Данная мутация отсутствовала у 4 здоровых членов этой семьи, а также в 10 образцах из контрольной группы. Оценка патогенности выявленной мутации показала, что данная мутация является причиной возникновения МЭХД в якутской семье. Заключение. Ранняя медицинская помощь пациентам с диагнозом МЭХД может дать возможность оказания медицинской помощи пациентам специалистами разного профиля, а также сосредоточить внимание врачей на ортопедических проблемах в раннем возрасте.