Peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type I in various populations of the Russian Federation

Tyrosinemia type I (TH1) is an inborn autosomal recessive disorder of tyrosine catabolism caused by defective strength of fumarylacetoacetate hydrolase and mutations in FAH gene. The frequency of TH1 is approximately one in 100,000 to 120,000 live births worldwide. Several regions of the world have...

Full description

Bibliographic Details
Main Authors: G. Baydakova V., T. Ivanova A., G. Radzhabova M., D. Saydaeva Kh., L. Dzhudinova L., A. Akhlakova I., A. Gamzatova I., L. Melikyan P., I. Bychkov O., S. Mikhaylova V., E. Zakharova Yu., Г. Байдакова В., Т. Иванова А., Г. Раджабова М., Д. Сайдаева Х., Л. Джудинова Л., А. Ахлакова И., А. Гамзатова И., Л. Меликян П., И. Бычков О., С. Михайлова В., Е. Захарова Ю.
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:Russian
Published: Publishing House «Genius Media» LLC 2018
Subjects:
Online Access:https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/306
id ftjmedgen:oai:oai.medgen.elpub.ru:article/306
record_format openpolar
institution Open Polar
collection Medical Genetics (E-Journal)
op_collection_id ftjmedgen
language Russian
topic тирозинемия тип 1
недостаточность фумарилацетоацетат гидролазы
мутация
аллель
этнос
tyrosinemia type 1
fumarylacetoacetate hydrolase deficiency
mutation
allele
ethnicity
spellingShingle тирозинемия тип 1
недостаточность фумарилацетоацетат гидролазы
мутация
аллель
этнос
tyrosinemia type 1
fumarylacetoacetate hydrolase deficiency
mutation
allele
ethnicity
G. Baydakova V.
T. Ivanova A.
G. Radzhabova M.
D. Saydaeva Kh.
L. Dzhudinova L.
A. Akhlakova I.
A. Gamzatova I.
L. Melikyan P.
I. Bychkov O.
S. Mikhaylova V.
E. Zakharova Yu.
Г. Байдакова В.
Т. Иванова А.
Г. Раджабова М.
Д. Сайдаева Х.
Л. Джудинова Л.
А. Ахлакова И.
А. Гамзатова И.
Л. Меликян П.
И. Бычков О.
С. Михайлова В.
Е. Захарова Ю.
Peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type I in various populations of the Russian Federation
topic_facet тирозинемия тип 1
недостаточность фумарилацетоацетат гидролазы
мутация
аллель
этнос
tyrosinemia type 1
fumarylacetoacetate hydrolase deficiency
mutation
allele
ethnicity
description Tyrosinemia type I (TH1) is an inborn autosomal recessive disorder of tyrosine catabolism caused by defective strength of fumarylacetoacetate hydrolase and mutations in FAH gene. The frequency of TH1 is approximately one in 100,000 to 120,000 live births worldwide. Several regions of the world have a higher expected frequency of TH1 due to an increased frequency of certain pathogenic variants resulting from the founder effect. In Norway, Finland and province of Quebec (Canada) the birth incidence is estimated as 1:74,000, 1:60,000 and 1:16,000 for live births, respectively. The frequency of TH1in whole Russia and in its regions is not known. To study the frequency and spectrum of mutations of HT1 in the Russian Federation, a number of ethnic groups belonging to different linguistic and geographical regions were explored. The mutation c.1025 C>T (Pro342Leu) whish constist (33.3% of all the mutant HT1 alleles) and is specific to the Chechen ethnic group. Among 296 newborn DBS from Chechen Republic, heterozygous carriers were found at a frequency of 0.0236 (the frequency of the mutant allele is 0.0118), which causes the calculated incidence rate HT1 at 1:7152, one of the most frequent rates worldwide. No single case of mutation of the pool leading to this disease was found among 201 newborn DBS from Dagestan. A previously undocumented mutation c.1090 G>C (Glu364Gln) was found in three Yakut, Buryat and Nenets patients in homozygous state. Detection of the ethno-specific mutations associated with HT1 in different populations of the Russian Federation is probably due to the founder effect. Наследственная тирозинемия (НТ1) или тирозинемия типа 1 - наследственное аутосомно-рецессивное нарушение катаболизма тирозина, вызванное нарушением активности фуарилацетоацетат гидролазы и связанное с мутациями в гене FAH . Частота НТ1 оценивается как 1:100 000 - 120 000 живых новорожденных. В некоторых регионах мира зарегистрирована более высокая частота заболевания: в Норвегии, Финляндии и Тунисе частота НТ1 составляет 1:74000, 1:60000 и 1:16000 соответственно. Частота ТН1 в Российской Федерации и отдельных ее регионах неизвестна. Для изучения спектра мутаций, приводящих к НТ1, их частот в Российской Федерации, исследован ряд этносов, принадлежащих к различным лингвистико-географическим регионам. Из 15 мутаций, ассоциированных с НТ1, встречающихся с различной частотой, наибольшую долю (33,3% от всех мутантных аллелей НТ1) составляет специфичная для чеченского этноса мутация c.1025C>T (Pro342Leu). В 296 обследованных образцах крови новорожденных г.Грозного (Чеченская Республика) гетерозиготное носительство выявлено с частотой 0,0236 (частота аллеля - 0,0118), что обусловливает расчётную частоту НТ1 - 1:7152. Такая частота является одной из самых высоких в мире. Среди 201 обследованного образца крови новорожденных из г. Махачкала (Республика Дагестан) данной мутации не обнаружено. У пациентов якутского, бурятского и ненецкого происхождения выявлена в гомозиготном состоянии не описанная ранее мутация c.1090G>C (Glu364Gln). Обнаружение этноспецифичных мутаций по НТ1 в различных популяциях РФ, вероятно, обусловлено эффектом основателя.
format Article in Journal/Newspaper
author G. Baydakova V.
T. Ivanova A.
G. Radzhabova M.
D. Saydaeva Kh.
L. Dzhudinova L.
A. Akhlakova I.
A. Gamzatova I.
L. Melikyan P.
I. Bychkov O.
S. Mikhaylova V.
E. Zakharova Yu.
Г. Байдакова В.
Т. Иванова А.
Г. Раджабова М.
Д. Сайдаева Х.
Л. Джудинова Л.
А. Ахлакова И.
А. Гамзатова И.
Л. Меликян П.
И. Бычков О.
С. Михайлова В.
Е. Захарова Ю.
author_facet G. Baydakova V.
T. Ivanova A.
G. Radzhabova M.
D. Saydaeva Kh.
L. Dzhudinova L.
A. Akhlakova I.
A. Gamzatova I.
L. Melikyan P.
I. Bychkov O.
S. Mikhaylova V.
E. Zakharova Yu.
Г. Байдакова В.
Т. Иванова А.
Г. Раджабова М.
Д. Сайдаева Х.
Л. Джудинова Л.
А. Ахлакова И.
А. Гамзатова И.
Л. Меликян П.
И. Бычков О.
С. Михайлова В.
Е. Захарова Ю.
author_sort G. Baydakova V.
title Peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type I in various populations of the Russian Federation
title_short Peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type I in various populations of the Russian Federation
title_full Peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type I in various populations of the Russian Federation
title_fullStr Peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type I in various populations of the Russian Federation
title_full_unstemmed Peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type I in various populations of the Russian Federation
title_sort peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type i in various populations of the russian federation
publisher Publishing House «Genius Media» LLC
publishDate 2018
url https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/306
long_lat ENVELOPE(-172.850,-172.850,64.367,64.367)
geographic Canada
Chechen
Norway
geographic_facet Canada
Chechen
Norway
genre nenets
Ненец*
genre_facet nenets
Ненец*
op_source Medical Genetics; Том 16, № 6 (2017); 43-47
Медицинская генетика; Том 16, № 6 (2017); 43-47
2073-7998
op_relation https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/306/222
Endo F, Sun MS. Tyrosinaemia type I and apoptosis of hepatocytes and renal tubular cells. J Inherit Metab Dis. 2002;25:227-234.
Новиков ПВ. Тирозинемия I типа: клиника, диагностика и лечение. Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2012;(S3):1-27.
Bergeron A, D’Astous M, Timm DE, Tanguay RM. Structural and functional analysis of missense mutations in fumarylacetoacetate hydrolase, the gene deficient in hereditary tyrosinemia type 1. The Journal of Biological Chemistry. 2001;276:15225-15231.
van Spronsen FJ, Thomasse Y, Smit GP, Leonard JV, et al. Hereditary tyrosinemia type I: a new clinical classification with difference in prognosis on dietary treatment. Hepatology. 1994;20:1187-1191.
McKiernan PJ. Nitisinone in the treatment of hereditary tyrosinaemia type 1. Drugs. 2006;66 (6):743-750.
Полякова СИ. Эффективность терапии нитизиноном наследственной тирозинемии I типа. Российский педиатрический журнал. 2012;(6):59-60.
Allard P, Grenier A, Korson MS, Zytkovicz TH. Newborn screening for hepatorenal tyrosinemia by tandem mass spectrometry: analysis of succinylacetone extracted from dried blood spots. Clinical Biochemistry. 2004;37(11):1010-1015.
Mitchell GA, Grompe M, Lambert M, Tanguay RM. Hypertyrosinemia. In: Scriver CR, Beaudet AL, Sly WS, Valle D, eds. The Metabolic and Molecular Bases of Inherited Disease. New York, NY: McGraw Hill; 2001:1777-1806.
Bliksrud YT, Brodtkorb E, Backe PH, et al. Hereditary tyrosinaemia type I in Norway: incidence and three novel small deletions in the fumarylacetoacetase gene. Scandinavian journal of clinical and laboratory investigation. 2012;72(5):369-373.
St-Louis M1, Leclerc B, Laine J, et al. Identification of a stop mutation in five Finnish patients suffering from hereditary tyrosinemia type I. Human Molecular Genetics. 1994;3(1):69-72.
Nasrallah F, Hammami MB, Ben Rhouma H, et al. Clinical and Biochemical Profile of Tyrosinemia Type 1 in Tunisia. Clinical laboratory. 2015;61(5-6):487-92.
DeBraekeeler MJ, Larochelle J. Genetic epidemiology of hereditairy tyrosinemia in Quebec and the Saguenay-Lac-St-Jean. American journal of human genetics. 1990;47(2):302-307.
Bergman AJ, van den Berg IE, Brink W, et al. Spectrum of mutations in the fumarylacetoacetate hydrolase gene of tyrosinemia type 1 patients in northwestern Europe and Mediterranean countries. Human mutation. 1998;12(1):19-26.
Elpeleg ON, Shaag A, Holme E, et al. Mutation analysis of the FAH gene in Israeli patients with tyrosinemia type I. Human mutation. 2002;19(1):80-81.
Rootwelt H, Chou J, Gahl WA, Berger R, Coskun T, Brodtkorb E, Kvittingen EA. Two missense mutations causing tyrosinemia type 1 with presence and absence of immunoreactive fumarylacetoacetase. Human Genetic. 1994; 93(6):615-619.
Дибирова ХД, Балановская ЕВ, Кузнецова МА, и др. Генетический рельеф Кавказа: четыре лингвистико-географических региона по данным о полиморфизме хромосомы Y. Медицинская генетика. 2010;(10):10-14.
Maksimova NR, Gurinova EE, Sukhomyasova AL, et al. A novel homozygous mutation causing hereditary tyrosinemia type I in yakut patient in russia: case report. Wiadomosci lekarskie. 2016;69(2 Pt 2):295-298.
https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/306
op_rights Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access).
Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access).
op_rightsnorm CC-BY
_version_ 1766072053477146624
spelling ftjmedgen:oai:oai.medgen.elpub.ru:article/306 2023-05-15T17:14:39+02:00 Peculiarities of the spectrum of mutations in hereditary tyrosinemia type I in various populations of the Russian Federation Особенности спектра мутаций при наследственной тирозинемии I типа в различных популяциях Российской Федерации G. Baydakova V. T. Ivanova A. G. Radzhabova M. D. Saydaeva Kh. L. Dzhudinova L. A. Akhlakova I. A. Gamzatova I. L. Melikyan P. I. Bychkov O. S. Mikhaylova V. E. Zakharova Yu. Г. Байдакова В. Т. Иванова А. Г. Раджабова М. Д. Сайдаева Х. Л. Джудинова Л. А. Ахлакова И. А. Гамзатова И. Л. Меликян П. И. Бычков О. С. Михайлова В. Е. Захарова Ю. 2018-02-20 application/pdf https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/306 rus rus Publishing House «Genius Media» LLC https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/306/222 Endo F, Sun MS. Tyrosinaemia type I and apoptosis of hepatocytes and renal tubular cells. J Inherit Metab Dis. 2002;25:227-234. Новиков ПВ. Тирозинемия I типа: клиника, диагностика и лечение. Российский вестник перинатологии и педиатрии. 2012;(S3):1-27. Bergeron A, D’Astous M, Timm DE, Tanguay RM. Structural and functional analysis of missense mutations in fumarylacetoacetate hydrolase, the gene deficient in hereditary tyrosinemia type 1. The Journal of Biological Chemistry. 2001;276:15225-15231. van Spronsen FJ, Thomasse Y, Smit GP, Leonard JV, et al. Hereditary tyrosinemia type I: a new clinical classification with difference in prognosis on dietary treatment. Hepatology. 1994;20:1187-1191. McKiernan PJ. Nitisinone in the treatment of hereditary tyrosinaemia type 1. Drugs. 2006;66 (6):743-750. Полякова СИ. Эффективность терапии нитизиноном наследственной тирозинемии I типа. Российский педиатрический журнал. 2012;(6):59-60. Allard P, Grenier A, Korson MS, Zytkovicz TH. Newborn screening for hepatorenal tyrosinemia by tandem mass spectrometry: analysis of succinylacetone extracted from dried blood spots. Clinical Biochemistry. 2004;37(11):1010-1015. Mitchell GA, Grompe M, Lambert M, Tanguay RM. Hypertyrosinemia. In: Scriver CR, Beaudet AL, Sly WS, Valle D, eds. The Metabolic and Molecular Bases of Inherited Disease. New York, NY: McGraw Hill; 2001:1777-1806. Bliksrud YT, Brodtkorb E, Backe PH, et al. Hereditary tyrosinaemia type I in Norway: incidence and three novel small deletions in the fumarylacetoacetase gene. Scandinavian journal of clinical and laboratory investigation. 2012;72(5):369-373. St-Louis M1, Leclerc B, Laine J, et al. Identification of a stop mutation in five Finnish patients suffering from hereditary tyrosinemia type I. Human Molecular Genetics. 1994;3(1):69-72. Nasrallah F, Hammami MB, Ben Rhouma H, et al. Clinical and Biochemical Profile of Tyrosinemia Type 1 in Tunisia. Clinical laboratory. 2015;61(5-6):487-92. DeBraekeeler MJ, Larochelle J. Genetic epidemiology of hereditairy tyrosinemia in Quebec and the Saguenay-Lac-St-Jean. American journal of human genetics. 1990;47(2):302-307. Bergman AJ, van den Berg IE, Brink W, et al. Spectrum of mutations in the fumarylacetoacetate hydrolase gene of tyrosinemia type 1 patients in northwestern Europe and Mediterranean countries. Human mutation. 1998;12(1):19-26. Elpeleg ON, Shaag A, Holme E, et al. Mutation analysis of the FAH gene in Israeli patients with tyrosinemia type I. Human mutation. 2002;19(1):80-81. Rootwelt H, Chou J, Gahl WA, Berger R, Coskun T, Brodtkorb E, Kvittingen EA. Two missense mutations causing tyrosinemia type 1 with presence and absence of immunoreactive fumarylacetoacetase. Human Genetic. 1994; 93(6):615-619. Дибирова ХД, Балановская ЕВ, Кузнецова МА, и др. Генетический рельеф Кавказа: четыре лингвистико-географических региона по данным о полиморфизме хромосомы Y. Медицинская генетика. 2010;(10):10-14. Maksimova NR, Gurinova EE, Sukhomyasova AL, et al. A novel homozygous mutation causing hereditary tyrosinemia type I in yakut patient in russia: case report. Wiadomosci lekarskie. 2016;69(2 Pt 2):295-298. https://www.medgen-journal.ru/jour/article/view/306 Authors who publish with this journal agree to the following terms:Authors retain copyright and grant the journal right of first publication with the work simultaneously licensed under a Creative Commons Attribution License that allows others to share the work with an acknowledgement of the work's authorship and initial publication in this journal.Authors are able to enter into separate, additional contractual arrangements for the non-exclusive distribution of the journal's published version of the work (e.g., post it to an institutional repository or publish it in a book), with an acknowledgement of its initial publication in this journal.Authors are permitted and encouraged to post their work online (e.g., in institutional repositories or on their website) prior to and during the submission process, as it can lead to productive exchanges, as well as earlier and greater citation of published work (See The Effect of Open Access). Авторы, публикующие статьи в данном журнале, соглашаются на следующее:Авторы сохраняют за собой автороские права и предоставляют журналу право первой публикации работы, которая по истечении 6 месяцев после публикации автоматически лицензируется на условиях Creative Commons Attribution License , которая позволяет другим распространять данную работу с обязательным сохранением ссылок на авторов оригинальной работы и оригинальную публикацию в этом журнале.Авторы имеют право размещать их работу в сети Интернет (например в институтском хранилище или персональном сайте) до и во время процесса рассмотрения ее данным журналом, так как это может привести к продуктивному обсуждению и большему количеству ссылок на данную работу (См. The Effect of Open Access). CC-BY Medical Genetics; Том 16, № 6 (2017); 43-47 Медицинская генетика; Том 16, № 6 (2017); 43-47 2073-7998 тирозинемия тип 1 недостаточность фумарилацетоацетат гидролазы мутация аллель этнос tyrosinemia type 1 fumarylacetoacetate hydrolase deficiency mutation allele ethnicity info:eu-repo/semantics/article info:eu-repo/semantics/publishedVersion 2018 ftjmedgen 2022-02-16T19:36:26Z Tyrosinemia type I (TH1) is an inborn autosomal recessive disorder of tyrosine catabolism caused by defective strength of fumarylacetoacetate hydrolase and mutations in FAH gene. The frequency of TH1 is approximately one in 100,000 to 120,000 live births worldwide. Several regions of the world have a higher expected frequency of TH1 due to an increased frequency of certain pathogenic variants resulting from the founder effect. In Norway, Finland and province of Quebec (Canada) the birth incidence is estimated as 1:74,000, 1:60,000 and 1:16,000 for live births, respectively. The frequency of TH1in whole Russia and in its regions is not known. To study the frequency and spectrum of mutations of HT1 in the Russian Federation, a number of ethnic groups belonging to different linguistic and geographical regions were explored. The mutation c.1025 C>T (Pro342Leu) whish constist (33.3% of all the mutant HT1 alleles) and is specific to the Chechen ethnic group. Among 296 newborn DBS from Chechen Republic, heterozygous carriers were found at a frequency of 0.0236 (the frequency of the mutant allele is 0.0118), which causes the calculated incidence rate HT1 at 1:7152, one of the most frequent rates worldwide. No single case of mutation of the pool leading to this disease was found among 201 newborn DBS from Dagestan. A previously undocumented mutation c.1090 G>C (Glu364Gln) was found in three Yakut, Buryat and Nenets patients in homozygous state. Detection of the ethno-specific mutations associated with HT1 in different populations of the Russian Federation is probably due to the founder effect. Наследственная тирозинемия (НТ1) или тирозинемия типа 1 - наследственное аутосомно-рецессивное нарушение катаболизма тирозина, вызванное нарушением активности фуарилацетоацетат гидролазы и связанное с мутациями в гене FAH . Частота НТ1 оценивается как 1:100 000 - 120 000 живых новорожденных. В некоторых регионах мира зарегистрирована более высокая частота заболевания: в Норвегии, Финляндии и Тунисе частота НТ1 составляет 1:74000, 1:60000 и 1:16000 соответственно. Частота ТН1 в Российской Федерации и отдельных ее регионах неизвестна. Для изучения спектра мутаций, приводящих к НТ1, их частот в Российской Федерации, исследован ряд этносов, принадлежащих к различным лингвистико-географическим регионам. Из 15 мутаций, ассоциированных с НТ1, встречающихся с различной частотой, наибольшую долю (33,3% от всех мутантных аллелей НТ1) составляет специфичная для чеченского этноса мутация c.1025C>T (Pro342Leu). В 296 обследованных образцах крови новорожденных г.Грозного (Чеченская Республика) гетерозиготное носительство выявлено с частотой 0,0236 (частота аллеля - 0,0118), что обусловливает расчётную частоту НТ1 - 1:7152. Такая частота является одной из самых высоких в мире. Среди 201 обследованного образца крови новорожденных из г. Махачкала (Республика Дагестан) данной мутации не обнаружено. У пациентов якутского, бурятского и ненецкого происхождения выявлена в гомозиготном состоянии не описанная ранее мутация c.1090G>C (Glu364Gln). Обнаружение этноспецифичных мутаций по НТ1 в различных популяциях РФ, вероятно, обусловлено эффектом основателя. Article in Journal/Newspaper nenets Ненец* Medical Genetics (E-Journal) Canada Chechen ENVELOPE(-172.850,-172.850,64.367,64.367) Norway