Influence of surrounding communities on the Pacific oyster disease risk in marine environments

• Main Author: Dugény, Elyne
• Other Authors: Laboratoire des Sciences de l'Environnement Marin (LEMAR) (LEMAR), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut Français de Recherche pour l'Exploitation de la Mer (IFREMER)-Université de Brest (UBO)-Institut Universitaire Européen de la Mer (IUEM), Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut national des sciences de l'Univers (INSU - CNRS)-Université de Brest (UBO)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université de Bretagne occidentale - Brest, Fabrice Pernet
• Format: Doctoral or Postdoctoral Thesis
• Language: French
• Published: HAL CCSD 2021
• Subjects: Bivalve; Disease ecology; Biotic interactions; Holobionte; Microbiome; Pathogen; Maladie; Interactions biotiques; Pathogènes; [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology; environment; Pacific; Pacific oyster
• Online Access: https://theses.hal.science/tel-04213495; https://theses.hal.science/tel-04213495/document; https://theses.hal.science/tel-04213495/file/These-2021-SML-Ecologie_marine-DUGENY_Elyne.pdf

Infectious diseases are structuring living communities in ecosystems and rely on host-pathogen-environment interactions. In this "interactome", the effect of biotic factors on the disease risk in marine environments has received less attention than abiotic factors. However, animals are never isolated in the environment and are in constant interaction with other organisms. As holobionts, they are also dependent on their microbiome equilibrium. In this context, this PhD thesis focused on the influence of surrounding algae communities on the Pacific oyster and its susceptibility to a viral infection. Green algae have been shown to decrease oysters’survival in disease context, while causing a disruptionof the oyster microbiome. These results wereobserved with algae of different geographical originsand over two years. Through this holistic approach,these observations allow to bring perspectives intothe "pathobiome" concept. The results obtained provide elements for understanding the biotic effects on host-pathogeninteractions and contribute to a better understanding of risk factors for disease emergence. Les maladies infectieuses structurent les communautés vivantes dans les écosystèmes et dépendent des interactions hôte-pathogène-environnement. Dans cet « interactome », l’effet de facteurs biotiques sur le risque infectieux en milieu marin, a reçu moins d’attention que les facteurs abiotiques. Pourtant, un animal n’est jamais isolé dans son milieu et est en perpétuelle interaction avec d’autres organismes. Lui-même, en tant qu’holobionte, est dépendant de l’équilibre de son microbiome. Ainsi, ce travail de thèse s’est articulé sur l’influence de communautés d’algues environnantes sur le modèle de l’huître creuse et sa sensibilité à une infection virale. Les algues vertes se sont avérées être un facteur aggravant pour la survie de l’huître, tout en causant une déstabilisation de son microbiote. Ces résultats ont été observés avec des algues de différentes origines géographiques et sur deux années. Par cette ...