Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019
Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se...
Published in: | Revista Panamericana de Salud Pública |
---|---|
Main Authors: | , , , , , , , , , |
Format: | Article in Journal/Newspaper |
Language: | English Spanish Portuguese |
Published: |
Pan American Health Organization
2020
|
Subjects: | |
Online Access: | https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104 https://doaj.org/article/a4ce10cad482431886a4b7e7889592f6 |
id |
ftdoajarticles:oai:doaj.org/article:a4ce10cad482431886a4b7e7889592f6 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftdoajarticles:oai:doaj.org/article:a4ce10cad482431886a4b7e7889592f6 2023-05-15T15:12:25+02:00 Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 Sandra Yamile Saavedra Johan Fabian Bernal Efrain Montilla-Escudero German Torres Mabel Karina Rodríguez Andrea Melissa Hidalgo María Victoria Ovalle Sandra Rivera Enrique Perez-Gutierrez Carolina Duarte 2020-09-01T00:00:00Z https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104 https://doaj.org/article/a4ce10cad482431886a4b7e7889592f6 EN ES PT eng spa por Pan American Health Organization https://iris.paho.org/handle/10665.2/52679 https://doaj.org/toc/1020-4989 https://doaj.org/toc/1680-5348 1020-4989 1680-5348 doi:10.26633/RPSP.2020.104 https://doaj.org/article/a4ce10cad482431886a4b7e7889592f6 Revista Panamericana de Salud Pública, Vol 44, Iss 104, Pp 1-10 (2020) enterococcus faecalis linezolid farmacorresistencia microbiana colombia Medicine R Arctic medicine. Tropical medicine RC955-962 Public aspects of medicine RA1-1270 article 2020 ftdoajarticles https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104 2022-12-31T06:53:44Z Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se recibieron 25 aislamientos de Enterococcus spp. resistentes al linezolid. La identificación y sensibilidad antimicrobiana se determinó con Vitek 2 y la concentración inhibitoria mínima (CIM) al linezolid se estableció con E-test. El gen optrA se detectó mediante PCR. La diversidad genética de aislamientos positivos para optrA se analizó con Diversilab®. Se seleccionaron seis aislamientos para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo. Resultados. Se confirmó el gen optrA en 23/25 aislamientos de E. faecalis de siete departamentos de Colombia. Los aislamientos presentaron una CIM al linezolid entre 8 y >256µg/mL. La tipificación por Diversilab® indicó una amplia variabilidad genética. Todos los aislamientos analizados mediante secuenciación del genoma completo, presentaron genes de resistencia fexA, ermB, lsaA, tet(M), tet(L) y dfrG además de optrA y fueron negativos para otros mecanismos de resistencia al linezolid. Se identificaron tres secuencias tipos y tres variantes de optrA: ST16 (optrA-2), ST476 (optrA-5) y ST618 (optrA-6). El entorno genético de los aislamientos optrA-2 (ST16) presentó el segmento impB, fex, optrA, asociado a plásmido, mientras que en dos aislamientos (optrA-6 y optrA-5) se encontró el elemento cromosómico transferible Tn6674-like. Conclusión. Los aislamientos clínicos positivos para optrA presentan una alta diversidad genética, con diferentes clones y variantes de optrA relacionados con dos tipos de estructuras y diferentes elementos genéticos móviles. Article in Journal/Newspaper Arctic Directory of Open Access Journals: DOAJ Articles Alta Arctic Revista Panamericana de Salud Pública 44 1 |
institution |
Open Polar |
collection |
Directory of Open Access Journals: DOAJ Articles |
op_collection_id |
ftdoajarticles |
language |
English Spanish Portuguese |
topic |
enterococcus faecalis linezolid farmacorresistencia microbiana colombia Medicine R Arctic medicine. Tropical medicine RC955-962 Public aspects of medicine RA1-1270 |
spellingShingle |
enterococcus faecalis linezolid farmacorresistencia microbiana colombia Medicine R Arctic medicine. Tropical medicine RC955-962 Public aspects of medicine RA1-1270 Sandra Yamile Saavedra Johan Fabian Bernal Efrain Montilla-Escudero German Torres Mabel Karina Rodríguez Andrea Melissa Hidalgo María Victoria Ovalle Sandra Rivera Enrique Perez-Gutierrez Carolina Duarte Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 |
topic_facet |
enterococcus faecalis linezolid farmacorresistencia microbiana colombia Medicine R Arctic medicine. Tropical medicine RC955-962 Public aspects of medicine RA1-1270 |
description |
Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se recibieron 25 aislamientos de Enterococcus spp. resistentes al linezolid. La identificación y sensibilidad antimicrobiana se determinó con Vitek 2 y la concentración inhibitoria mínima (CIM) al linezolid se estableció con E-test. El gen optrA se detectó mediante PCR. La diversidad genética de aislamientos positivos para optrA se analizó con Diversilab®. Se seleccionaron seis aislamientos para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo. Resultados. Se confirmó el gen optrA en 23/25 aislamientos de E. faecalis de siete departamentos de Colombia. Los aislamientos presentaron una CIM al linezolid entre 8 y >256µg/mL. La tipificación por Diversilab® indicó una amplia variabilidad genética. Todos los aislamientos analizados mediante secuenciación del genoma completo, presentaron genes de resistencia fexA, ermB, lsaA, tet(M), tet(L) y dfrG además de optrA y fueron negativos para otros mecanismos de resistencia al linezolid. Se identificaron tres secuencias tipos y tres variantes de optrA: ST16 (optrA-2), ST476 (optrA-5) y ST618 (optrA-6). El entorno genético de los aislamientos optrA-2 (ST16) presentó el segmento impB, fex, optrA, asociado a plásmido, mientras que en dos aislamientos (optrA-6 y optrA-5) se encontró el elemento cromosómico transferible Tn6674-like. Conclusión. Los aislamientos clínicos positivos para optrA presentan una alta diversidad genética, con diferentes clones y variantes de optrA relacionados con dos tipos de estructuras y diferentes elementos genéticos móviles. |
format |
Article in Journal/Newspaper |
author |
Sandra Yamile Saavedra Johan Fabian Bernal Efrain Montilla-Escudero German Torres Mabel Karina Rodríguez Andrea Melissa Hidalgo María Victoria Ovalle Sandra Rivera Enrique Perez-Gutierrez Carolina Duarte |
author_facet |
Sandra Yamile Saavedra Johan Fabian Bernal Efrain Montilla-Escudero German Torres Mabel Karina Rodríguez Andrea Melissa Hidalgo María Victoria Ovalle Sandra Rivera Enrique Perez-Gutierrez Carolina Duarte |
author_sort |
Sandra Yamile Saavedra |
title |
Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 |
title_short |
Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 |
title_full |
Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 |
title_fullStr |
Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 |
title_full_unstemmed |
Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019 |
title_sort |
vigilancia nacional de aislamientos clínicos de enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optra en colombia, 2014-2019 |
publisher |
Pan American Health Organization |
publishDate |
2020 |
url |
https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104 https://doaj.org/article/a4ce10cad482431886a4b7e7889592f6 |
geographic |
Alta Arctic |
geographic_facet |
Alta Arctic |
genre |
Arctic |
genre_facet |
Arctic |
op_source |
Revista Panamericana de Salud Pública, Vol 44, Iss 104, Pp 1-10 (2020) |
op_relation |
https://iris.paho.org/handle/10665.2/52679 https://doaj.org/toc/1020-4989 https://doaj.org/toc/1680-5348 1020-4989 1680-5348 doi:10.26633/RPSP.2020.104 https://doaj.org/article/a4ce10cad482431886a4b7e7889592f6 |
op_doi |
https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104 |
container_title |
Revista Panamericana de Salud Pública |
container_volume |
44 |
container_start_page |
1 |
_version_ |
1766343094235561984 |