Vigilancia nacional de aislamientos clínicos de Enterococcus faecalis resistentes al linezolid portadores del gen optrA en Colombia, 2014-2019

• Published in: Revista Panamericana de Salud Pública
• Main Authors: Sandra Yamile Saavedra, Johan Fabian Bernal, Efrain Montilla-Escudero, German Torres, Mabel Karina Rodríguez, Andrea Melissa Hidalgo, María Victoria Ovalle, Sandra Rivera, Enrique Perez-Gutierrez, Carolina Duarte
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: English; Spanish; Portuguese
• Published: Pan American Health Organization 2020
• Subjects: enterococcus faecalis; linezolid; farmacorresistencia microbiana; colombia; Medicine; R; Arctic medicine. Tropical medicine; RC955-962; Public aspects of medicine; RA1-1270; Alta; Arctic
• Online Access: https://doi.org/10.26633/RPSP.2020.104; https://doaj.org/article/a4ce10cad482431886a4b7e7889592f6

Objetivo. Describir las características epidemiológicas, fenotípicas y genéticas de aislamientos clínicos portadores de optrA identificados en la vigilancia de resistencia antimicrobiana por el laboratorio del Instituto Nacional de Salud de Colombia. Métodos. Entre octubre de 2014 y febrero 2019, se recibieron 25 aislamientos de Enterococcus spp. resistentes al linezolid. La identificación y sensibilidad antimicrobiana se determinó con Vitek 2 y la concentración inhibitoria mínima (CIM) al linezolid se estableció con E-test. El gen optrA se detectó mediante PCR. La diversidad genética de aislamientos positivos para optrA se analizó con Diversilab®. Se seleccionaron seis aislamientos para llevar a cabo la secuenciación del genoma completo. Resultados. Se confirmó el gen optrA en 23/25 aislamientos de E. faecalis de siete departamentos de Colombia. Los aislamientos presentaron una CIM al linezolid entre 8 y >256µg/mL. La tipificación por Diversilab® indicó una amplia variabilidad genética. Todos los aislamientos analizados mediante secuenciación del genoma completo, presentaron genes de resistencia fexA, ermB, lsaA, tet(M), tet(L) y dfrG además de optrA y fueron negativos para otros mecanismos de resistencia al linezolid. Se identificaron tres secuencias tipos y tres variantes de optrA: ST16 (optrA-2), ST476 (optrA-5) y ST618 (optrA-6). El entorno genético de los aislamientos optrA-2 (ST16) presentó el segmento impB, fex, optrA, asociado a plásmido, mientras que en dos aislamientos (optrA-6 y optrA-5) se encontró el elemento cromosómico transferible Tn6674-like. Conclusión. Los aislamientos clínicos positivos para optrA presentan una alta diversidad genética, con diferentes clones y variantes de optrA relacionados con dos tipos de estructuras y diferentes elementos genéticos móviles.