Proteorhodopsin Phototrophy in Antarctic Coastal Waters ... : التصوير الفوتوغرافي للبروتورهودوبسين في المياه الساحلية لأنتاركتيكا ...

• Main Authors: Jerónimo Cifuentes-Anticevic, María E. Alcamán-Arias, Tomás Alarcón-Schumacher, Javier Tamayo-Leiva, Carlos Pedrós‐Alió, Laura Farı́as, Beatriz Dı́ez
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2021
• Subjects: Optogenetics in Neuroscience and Biophysics Research; Cellular and Molecular Neuroscience; Neuroscience; Life Sciences; Marine Microbial Diversity and Biogeography; Ecology; FOS Biological sciences; Environmental Science; Physical Sciences; Global Diversity of Microbial Eukaryotes and Their Evolution; Molecular Biology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Microbial Rhodopsins; Gammaproteobacteria; Alphaproteobacteria; Biology; Anoxygenic photosynthesis; Marine bacteriophage; Phototroph; Oceanography; FOS Earth and related environmental sciences; Bacteria; Geology; 16S ribosomal RNA; Genetics; Antarc*; Antarctic; Antarctica; South Shetland Islands
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/q597b-ajw71; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/q597b-ajw71

Microbial proton-pumping rhodopsins are considered the simplest strategy among phototrophs to conserve energy from light. Proteorhodopsins are the most studied rhodopsins thus far because of their ubiquitous presence in the ocean, except in Antarctica, where they remain understudied. We analyzed proteorhodopsin abundance and transcriptional activity in the Western Antarctic coastal seawaters. Combining quantitative PCR (qPCR) and metagenomics, the relative abundance of proteorhodopsin-bearing bacteria accounted on average for 17, 3.5, and 29.7% of the bacterial community in Chile Bay (South Shetland Islands) during 2014, 2016, and 2017 summer-autumn, respectively. The abundance of proteorhodopsin-bearing bacteria changed in relation to environmental conditions such as chlorophyll a and temperature. Alphaproteobacteria, Gammaproteobacteria, and Flavobacteriia were the main bacteria that transcribed the proteorhodopsin gene during day and night. Although green light-absorbing proteorhodopsin genes were more ... : تعتبر رودوبسينات ضخ البروتون الميكروبية أبسط استراتيجية بين الصور الفوتوغرافية للحفاظ على الطاقة من الضوء. البروتورودوبسينات هي أكثر أنواع الرودوبسين دراسة حتى الآن بسبب وجودها في كل مكان في المحيط، باستثناء القارة القطبية الجنوبية، حيث لا تزال غير مدروسة. قمنا بتحليل وفرة البروتورودوبسين ونشاط النسخ في مياه البحر الساحلية الغربية في أنتاركتيكا. بالجمع بين تفاعل البوليميراز المتسلسل الكمي (qPCR) وعلم الميتاجينوميات، شكلت الوفرة النسبية للبكتيريا الحاملة للبروتيرودوبسين في المتوسط 17 و 3.5 و 29.7 ٪ من المجتمع البكتيري في خليج تشيلي (جزر جنوب شتلاند) خلال 2014 و 2016 و 2017 صيف- خريف، على التوالي. تغيرت وفرة البكتيريا الحاملة للبروتينورودوبسين فيما يتعلق بالظروف البيئية مثل الكلوروفيل أ ودرجة الحرارة. كانت بكتيريا ألفا بروتوباكتريا، وبكتيريا غامابروتوباكتريا، وبكتيريا فلافوباكتريا هي البكتيريا الرئيسية التي نسخت جين بروتورودوبسين خلال النهار والليل. على الرغم من أن جينات البروتيورودوبسين الممتصة للضوء الأخضر كانت أكثر وفرة من الجينات الممتصة للضوء الأزرق، إلا أن الأخير تم نسخه بشكل أكثر كثافة، مما أدى إلى ...