Positive selection over the mitochondrial genome and its role in the diversification of gentoo penguins in response to adaptation in isolation ... : الانتقاء الإيجابي على جينوم الميتوكوندريا ودوره في تنويع طيور البطريق الجنتو استجابة للتكيف في عزلة ...

• Main Authors: Daly Noll, Francisco J. Garcı́a de León, Débora Y. C. Brandt, Pierre Pistorius, Céline Le Bohec, Francesco Bonadonna, Philip N. Trathan, Andrés Barbosa, Andréa Raya Rey, Gisele P.M. Dantas, Rauri C. K. Bowie, Élie Poulin, Juliana A. Vianna
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2022
• Subjects: RNA Sequencing Data Analysis; Molecular Biology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; Population Genetic Structure and Dynamics; Genetics; FOS Biological sciences; Importance and Conservation of Freshwater Biodiversity; Nature and Landscape Conservation; Environmental Science; Physical Sciences; phylogenetic tree; Phylogenetic Analysis; Adaptive Evolution; Biology; Mitochondrial DNA; Adaptation eye; Lineage genetic; Evolutionary biology; Genome; Gene; Neuroscience; Antarc*; Antarctic; Gentoo penguin; Pygoscelis papua
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/gnhm2-xy713; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/gnhm2-xy713

Although mitochondrial DNA has been widely used in phylogeography, evidence has emerged that factors such as climate, food availability, and environmental pressures that produce high levels of stress can exert a strong influence on mitochondrial genomes, to the point of promoting the persistence of certain genotypes in order to compensate for the metabolic requirements of the local environment. As recently discovered, the gentoo penguins (Pygoscelis papua) comprise four highly divergent lineages across their distribution spanning the Antarctic and sub-Antarctic regions. Gentoo penguins therefore represent a suitable animal model to study adaptive processes across divergent environments. Based on 62 mitogenomes that we obtained from nine locations spanning all four gentoo penguin lineages, we demonstrated lineage-specific nucleotide substitutions for various genes, but only lineage-specific amino acid replacements for the ND1 and ND5 protein-coding genes. Purifying selection (dN/dS < 1) is the main driving ... : على الرغم من استخدام الحمض النووي للميتوكوندريا على نطاق واسع في الجغرافيا النباتية، فقد ظهرت أدلة على أن عوامل مثل المناخ وتوافر الغذاء والضغوط البيئية التي تنتج مستويات عالية من التوتر يمكن أن تمارس تأثيرًا قويًا على جينومات الميتوكوندريا، إلى حد تعزيز استمرار بعض الأنماط الجينية من أجل التعويض عن المتطلبات الأيضية للبيئة المحلية. كما تم اكتشافه مؤخرًا، تتكون طيور البطريق الجنتو (Pygoscelis papua) من أربعة سلالات متباينة للغاية عبر توزيعها عبر مناطق القارة القطبية الجنوبية وشبه القارة القطبية الجنوبية. لذلك تمثل طيور البطريق جنتو نموذجًا حيوانيًا مناسبًا لدراسة العمليات التكيفية عبر بيئات متباينة. استنادًا إلى 62 ميتوجينوم حصلنا عليها من تسعة مواقع تمتد عبر جميع سلالات البطريق جنتو الأربعة، أظهرنا بدائل نيوكليوتيد خاصة بالنسب لجينات مختلفة، ولكن فقط بدائل الأحماض الأمينية الخاصة بالنسب لجينات ترميز البروتين ND1 و ND5. الانتقاء المنقي (dN/dS < 1) هو القوة الدافعة الرئيسية في جينات ترميز البروتين التي تشكل تنوع الميتوجينومات في طيور البطريق الجنتو. كان الانتقاء الإيجابي (dN/dS > 1) موجودًا في الغالب في ...