Molecular marker-based species identification of carnivorous freshwater catfish (Wallago attu) from river Chenab, Pakistan ... : تحديد الأنواع الجزيئية القائمة على العلامات لسمك السلور آكل اللحوم في المياه العذبة (Wallago attu) من نهر Chenab، باكستان ...

• Main Authors: Parsa Riaz, Muhammad Naeem, Shoaib Hassan, Ammar Danyal Naeem, Zara Naeem, Muhammad Azam Sheikh
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2024
• Subjects: DNA Barcoding for Food Authentication and Fraud Detection; Molecular Biology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; Length-Weight Relationships of Fish Species; Aquatic Science; Agricultural and Biological Sciences; Importance and Conservation of Freshwater Biodiversity; Nature and Landscape Conservation; Environmental Science; Physical Sciences; DNA Barcoding; Catfish; Identification biology; Geography; Fishery; Biology; Zoology; FOS Biological sciences; Ecology; Fish; Attu
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/b613b-6cz39; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/b613b-6cz39

DNA barcoding, one of several procedures for identification of organisms, is an effective way to identify fish species. DNA-based identification is reliable and accurate to characterize an organism at different stages of its life cycle. Several reference libraries were used to link species by adding data to report species. For the sequencing of undetermined species, a customized primer was used. An unknown specimen was identified using a cytochrome c oxidase 1 primer. In this study, cytochrome c oxidase subunit 1 was used to identify Wallago attu at the molecular level. After sequencing, the mitochondrial cytochrome c oxidase subunit 1 gene was fragmented into 380 base pair pieces. A molecular-based identification approach, which comprised a neighbor-joining tree to estimate divergence, was used in addition to morphological identification to identify and authenticate the species under investigation. The COI barcodes were morphologically identified and matched with reference sequences of anticipated species. ... : يعد الترميز الشريطي للحمض النووي، وهو أحد الإجراءات العديدة لتحديد الكائنات الحية، طريقة فعالة لتحديد أنواع الأسماك. تحديد الهوية القائم على الحمض النووي موثوق ودقيق لوصف الكائن الحي في مراحل مختلفة من دورة حياته. تم استخدام العديد من المكتبات المرجعية لربط الأنواع عن طريق إضافة بيانات للإبلاغ عن الأنواع. بالنسبة لتسلسل الأنواع غير المحددة، تم استخدام كتاب تمهيدي مخصص. تم تحديد عينة غير معروفة باستخدام السيتوكروم c أوكسيديز 1 التمهيدي. في هذه الدراسة، تم استخدام السيتوكروم ج أوكسيديز الوحدة الفرعية 1 لتحديد والاجو أتو على المستوى الجزيئي. بعد التسلسل، تم تجزئة جين السيتوكروم سي أوكسيديز الفرعي 1 للميتوكوندريا إلى 380 قطعة زوج قاعدية. تم استخدام نهج تحديد الهوية الجزيئي، الذي يتألف من شجرة مجاورة لتقدير الاختلاف، بالإضافة إلى التحديد المورفولوجي لتحديد وتوثيق الأنواع قيد التحقيق. تم تحديد الباركود الخاص بـ COI من الناحية الشكلية ومطابقته مع التسلسلات المرجعية للأنواع المتوقعة. تلقت قواعد بيانات GenBank تقارير الأنواع برقم الإدخال MT476360. أشارت نتائج الدراسة إلى أن الترميز الشريطي للحمض النووي هو طريقة قابلة ...