Quantitative comparison of taxa and taxon concepts in the diatom genus Fragilariopsis: a case study on using slide scanning, multiexpert image annotation, and image analysis in taxonomy1 ... : المقارنة الكمية لمفاهيم الأصناف والأصناف في جنس الدياتوم Fragilariopsis: دراسة حالة حول استخدام مسح الشرائح والتعليق التوضيحي للصور متعدد الخبراء وتحليل الصور في التصنيف1 ...

• Main Authors: Bánk Beszteri, Claire S. Allen, Gastón O. Almandoz, Leanne Armand, María Ángeles Bárcena, Hannelore Cantzler, Xavier Crosta, Oliver Esper, Richard W. Jordan, Gerhard Kauer, Christine Klaas, Michael Kloster, Amy Leventer, Jennifer Pike, Andrés S. Rigual-Hernández
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2018
• Subjects: Biomimetic Nanotechnology in Material Synthesis and Assembly; Biomaterials; Materials Science; Physical Sciences; DNA Barcoding for Food Authentication and Fraud Detection; Molecular Biology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; RNA Sequencing Data Analysis; Phylogenetic Analysis; Taxon; Biology; Taxonomy biology; Taxonomic rank; Set abstract data type; Pattern recognition psychology; Genus; Artificial intelligence; Evolutionary biology; Zoology; FOS Biological sciences; Paleontology; Computer science; Programming language; Southern Ocean
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/8qgct-2bc87; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/8qgct-2bc87

Semiautomated methods for microscopic image acquisition, image analysis, and taxonomic identification have repeatedly received attention in diatom analysis. Less well studied is the question whether and how such methods might prove useful for clarifying the delimitation of species that are difficult to separate for human taxonomists. To try to answer this question, three very similar Fragilariopsis species endemic to the Southern Ocean were targeted in this study: F. obliquecostata , F. ritscheri , and F. sublinearis . A set of 501 extended focus depth specimen images were obtained using a standardized, semiautomated microscopic procedure. Twelve diatomists independently identified these specimen images in order to reconcile taxonomic opinions and agree upon a taxonomic gold standard. Using image analyses, we then extracted morphometric features representing taxonomic characters of the target taxa. The discriminating ability of individual morphometric features was tested visually and statistically, and ... : حظيت الطرق شبه الآلية لاكتساب الصور المجهرية وتحليل الصور والتعرف التصنيفي باهتمام متكرر في تحليل الدياتوم. أقل دراسة هو السؤال عما إذا كانت هذه الأساليب قد تكون مفيدة لتوضيح تحديد الأنواع التي يصعب فصلها عن علماء التصنيف البشري وكيف يمكن أن تكون مفيدة. في محاولة للإجابة على هذا السؤال، تم استهداف ثلاثة أنواع متشابهة جدًا من الفراجيليروبسيس المستوطنة في المحيط الجنوبي في هذه الدراسة: F. obliquecostata و F. ritscheri و F. sublinearis . تم الحصول على مجموعة من 501 صورة لعينة عمق التركيز الممتد باستخدام إجراء مجهر موحد وشبه آلي. حدد اثنا عشر طبيب دياتومي بشكل مستقل صور العينات هذه من أجل التوفيق بين الآراء التصنيفية والاتفاق على معيار ذهبي تصنيفي. باستخدام تحليلات الصور، استخرجنا بعد ذلك ميزات مورفومترية تمثل الأحرف التصنيفية للأصناف المستهدفة. تم اختبار القدرة التمييزية للسمات المورفومترية الفردية بصريًا وإحصائيًا، وتم إجراء تجارب تصنيف متعددة المتغيرات لاختبار توافق تعيينات الأصناف المحددة كميًا مع رأي إجماع الخبراء. بالإضافة إلى التشخيص التفريقي المحدث للأصناف المدروسة، تُظهر دراستنا أيضًا أن إجراءات التصوير ...