Molecular Characterization of Infectious Bronchitis Virus Strain HH06 Isolated in a Poultry Farm in Northeastern China ... : التوصيف الجزيئي لسلالة فيروس التهاب الشعب الهوائية المعدي HH06 المعزولة في مزرعة دواجن في شمال شرق الصين ...

• Main Authors: Ghulam Abbas, Yue Zhang, Xiao-Wei Sun, Huijie Chen, Yudong Ren, Xiurong Wang, Muhammad Zulfiqar Ahmad, Xiaodan Huang, Guangxing Li
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2021
• Subjects: Viral Diseases in Livestock and Poultry; Animal Science and Zoology; Agricultural and Biological Sciences; Life Sciences; Coronavirus Disease 2019 Research; Infectious Diseases; FOS Health sciences; Medicine; Health Sciences; Gastrointestinal Viral Infections and Vaccines Development; Corona Virus; Biology; Phylogenetic tree; Genetics; FOS Biological sciences; Infectious bronchitis virus; Clade; Phylogenetics; Avian infectious bronchitis virus; Coronavirus; Nidovirales; Gene; Sequence analysis; Virology; Evolutionary biology; Coronavirus disease 2019 COVID-19; Infectious disease medical specialty; Disease; Pathology; Beluga; Beluga whale; Beluga*
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/56rp5-ycm17; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/56rp5-ycm17

Spike (S) glycoprotein is an important virulent factor for coronaviruses (CoVs), and variants of CoVs have been characterized based on S gene analysis. We present phylogenetic relationship of an isolated infectious bronchitis virus (IBV) strain with reference to the available genome and protein sequences based on network, multiple sequence, selection pressure, and evolutionary fingerprinting analysis in People's Republic of China. One hundred and elven strains of CoVs i.e., Alphacoronaviruses (Alpha-CoVs; n = 12), Betacoronaviruses (Beta-CoVs; n = 37), Gammacoronaviruses (Gamma-CoVs; n = 46), and Deltacoronaviruses (Delta-CoVs; n = 16) were selected for this purpose. Phylogenetically, SARS-CoV-2 and SARS-CoVs clustered together with Bat-CoVs and MERS-CoV of Beta-CoVs (C). The IBV HH06 of Avian-CoVs was closely related to Duck-CoV and partridge S14, LDT3 (teal and chicken host). Beluga whale-CoV (SW1) and Bottlenose dolphin-CoVs of mammalian origin branched distantly from other animal origin viruses, however, ... : يعد البروتين السكري Spike (S) عاملًا ضارًا مهمًا لفيروسات كورونا (CoVs)، وقد تم تمييز متغيرات فيروسات كورونا بناءً على تحليل الجين S. نقدم العلاقة الوراثية لسلالة فيروس التهاب الشعب الهوائية المعدي المعزول (IBV) بالرجوع إلى تسلسلات الجينوم والبروتين المتاحة بناءً على الشبكة والتسلسل المتعدد وضغط الانتقاء وتحليل البصمات التطوري في جمهورية الصين الشعبية. تم اختيار مائة سلالات من فيروسات كورونا، أي فيروسات ألفا كورونا (فيروسات ألفا كوف ؛ n = 12)، فيروسات بيتا كورونا (فيروسات بيتا كوف ؛ n = 37)، فيروسات جاما كورونا (فيروسات جاما كوف ؛ n = 46)، وفيروسات دلتا كورونا (فيروسات دلتا كوف ؛ n = 16) لهذا الغرض. من الناحية الوراثية، يتجمع فيروس كورونا 2 المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة وفيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة مع فيروسات كورونا الخفافيش وفيروس كورونا المرتبط بمتلازمة الشرق الأوسط التنفسية مع فيروسات كورونا بيتا (C). كان IBV HH06 لفيروسات كوف الطيور مرتبطًا ارتباطًا وثيقًا بـ Duck - CoV و partridge S14 و LDT3 (مضيف البط البري والدجاج). تشعب كل من Beluga whale - CoV (SW1) و ...