Phylogenomics of an extra-Antarctic notothenioid radiation reveals a previously unrecognized lineage and diffuse species boundaries ... : يكشف علم الوراثة العرقي لإشعاع الظهارة خارج القارة القطبية الجنوبية عن سلالة غير معترف بها سابقًا وحدود منتشرة للأنواع ...

• Main Authors: Santiago Ceballos, Marius Roesti, Michael Matschiner, Daniel A. Fernández, Malte Damerau, Reinhold Hanel, Walter Salzburger
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2019
• Subjects: DNA Barcoding for Food Authentication and Fraud Detection; Molecular Biology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; Population Genetic Structure and Dynamics; Genetics; FOS Biological sciences; Conservation of Sharks and Rays; Nature and Landscape Conservation; Environmental Science; Physical Sciences; Adaptive Evolution; Biology; Monophyly; Lineage genetic; Evolutionary biology; Population; Phylogenetic tree; Phylogenetics; Paraphyly; Clade; Zoology; Gene; Demography; FOS Sociology; Sociology; Antarc*; Antarctic
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/3srf9-dnx81; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/3srf9-dnx81

The impressive adaptive radiation of notothenioid fishes in Antarctic waters is generally thought to have been facilitated by an evolutionary key innovation, antifreeze glycoproteins, permitting the rapid evolution of more than 120 species subsequent to the Antarctic glaciation. By way of contrast, the second-most species-rich notothenioid genus, Patagonotothen, which is nested within the Antarctic clade of Notothenioidei, is almost exclusively found in the non-Antarctic waters of Patagonia. While the drivers of the diversification of Patagonotothen are currently unknown, they are unlikely to be related to antifreeze glycoproteins, given that water temperatures in Patagonia are well above freezing point. Here we performed a phylogenetic analysis based on genome-wide single nucleotide polymorphisms (SNPs) derived from restriction site-associated DNA sequencing (RADseq) in a total of twelve Patagonotothen species.We present a well-supported, time-calibrated phylogenetic hypothesis including closely and ... : يُعتقد عمومًا أن الإشعاع التكيفي المثير للإعجاب للأسماك الظهارية في مياه القارة القطبية الجنوبية قد تم تسهيله من خلال ابتكار رئيسي تطوري، وهو البروتينات السكرية المضادة للتجمد، مما سمح بالتطور السريع لأكثر من 120 نوعًا بعد التجلد في القارة القطبية الجنوبية. على النقيض من ذلك، فإن ثاني أكثر جنس ظفيري غني بالأنواع، باتاغونوتوثين، الذي يتداخل داخل فرع القطب الجنوبي من Notothenioidei، يوجد بشكل حصري تقريبًا في مياه باتاغونيا غير القطبية الجنوبية. في حين أن دوافع تنويع الباتاغونوتوثين غير معروفة حاليًا، فمن غير المرجح أن تكون مرتبطة بالبروتينات السكرية المضادة للتجمد، نظرًا لأن درجات حرارة المياه في باتاغونيا أعلى بكثير من نقطة التجمد. هنا أجرينا تحليلًا لتطور السلالات استنادًا إلى تعدد أشكال النيوكليوتيدات المفردة على مستوى الجينوم (SNPs) المستمدة من تسلسل الحمض النووي المرتبط بموقع التقييد (RADseq) في ما مجموعه اثني عشر نوعًا من الباتاغونوثين. نقدم فرضية تطور مدعومة جيدًا ومعايرة زمنيًا بما في ذلك المجموعات الخارجية المرتبطة ارتباطًا وثيقًا وبعيدًا، مما يؤكد أحادية نظرية جنس الباتاغونوثين ذات الأصل منذ حوالي 3 ...