Palaeogenomic analysis of black rat (Rattus rattus) reveals multiple European introductions associated with human economic history ... : يكشف التحليل الجيني القديم للجرذ الأسود (الجرذ الجرذ) عن مقدمات أوروبية متعددة مرتبطة بالتاريخ الاقتصادي البشري ...

• Main Authors: Yu He, Alexandra Jamieson, Ardern Hulme-Beaman, Chris J. Conroy, Becky Knight, Camilla Speller, Hiba Al-Jarah, Heidi Eager, Alexandra Trinks, G. Adikari, Henriette Baron, Beate Böhlendorf‐Arslan, Wijerathne Bohingamuwa, Alison Crowther, Thomas Cucchi, Kinie Esser, Jeffrey Fleisher, Louisa Gidney, Elena Gladilina, Pavel Gol'din, Steven M. Goodman, Sheila Hamilton‐Dyer, Richard Helm, Jesse C. Hillman, Nabil Kallala, Hanna Kivikero, Zsófia Eszter Kovács, Günther Karl Kunst, René Kyselý, Anna Linderholm, Bouthéina Maraoui-Telmini, Nemanja Marković, Arturo Morales‐Muñiz, Mariana Nabais, T. P. O'Connor, Tarek Oueslati, Eréndira M. Quintana Morales, Kerstin Pasda, Jude Perera, Nimal Perera, Silvia Radbauer, Joan Ramon, Eve Rannamäe, Joan Sanmartí Grego, Edward R. Treasure, Sílvia Valenzuela‐Lamas, Inge van der Jagt, Wim Van Neer, Jean‐Denis Vigne, Thomas Walker
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2022
• Subjects: Genetic and Pathogenic Study of Plague Bacteria; Genetics; FOS Biological sciences; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; Population Genetic Structure and Dynamics; Ecological Impact of Invasive Species on Islands; Ecology; Environmental Science; Physical Sciences; Ancient DNA; Biological dispersal; Plague disease; Population; Demographic history; Rodent; Biology; Mediterranean climate; Geography; Zoology; Evolutionary biology; Genetic diversity; Demography; FOS Sociology; Archaeology; Sociology; Rattus rattus
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/16m0w-pe626; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/16m0w-pe626

The distribution of the black rat (Rattus rattus) has been heavily influenced by its association with humans. The dispersal history of this non-native commensal rodent across Europe, however, remains poorly understood, and different introductions may have occurred during the Roman and medieval periods. Here, in order to reconstruct the population history of European black rats, we first generate a de novo genome assembly of the black rat. We then sequence 67 ancient and three modern black rat mitogenomes, and 36 ancient and three modern nuclear genomes from archaeological sites spanning the 1st-17th centuries CE in Europe and North Africa. Analyses of our newly reported sequences, together with published mitochondrial DNA sequences, confirm that black rats were introduced into the Mediterranean and Europe from Southwest Asia. Genomic analyses of the ancient rats reveal a population turnover in temperate Europe between the 6th and 10th centuries CE, coincident with an archaeologically attested decline in the ... : تأثر توزيع الجرذ الأسود (الجرذ الجرذ) بشدة بارتباطه بالبشر. ومع ذلك، لا يزال تاريخ تشتت هذه القوارض المعايِرة غير الأصلية في جميع أنحاء أوروبا غير مفهوم بشكل جيد، وربما حدثت مقدمات مختلفة خلال الفترات الرومانية والعصور الوسطى. هنا، من أجل إعادة بناء التاريخ السكاني للفئران السوداء الأوروبية، نقوم أولاً بإنشاء مجموعة جينوم جديدة للفئران السوداء. ثم نقوم بتسلسل 67 من الميتوجينومات القديمة وثلاثة من الميتوجينومات الحديثة للفئران السوداء، و 36 جينومًا نوويًا قديمًا وثلاثة من الجينوم النووي الحديث من المواقع الأثرية التي تمتد من القرن الأول إلى القرن السابع عشر الميلادي في أوروبا وشمال إفريقيا. تؤكد تحليلات تسلسلاتنا المبلغ عنها حديثًا، جنبًا إلى جنب مع تسلسلات الحمض النووي للميتوكوندريا المنشورة، أن الفئران السوداء قد تم إدخالها إلى البحر الأبيض المتوسط وأوروبا من جنوب غرب آسيا. تكشف التحليلات الجينية للفئران القديمة عن دوران السكان في أوروبا المعتدلة بين القرنين السادس والعاشر الميلاديين، بالتزامن مع انخفاض موثق أثريًا في عدد الفئران السوداء. ربما كان الاختفاء الوشيك وعودة ظهور الفئران السوداء في أوروبا نتيجة ...