The identification and determination of toxin genes of Vibrio strains causing hemorrhagic disease on red drum (Sciaenops ocellatus) using PCR ... : تحديد وتحديد الجينات السامة لسلالات الضمة المسببة للمرض النزفي على الأسطوانة الحمراء (Sciaenops ocellatus) باستخدام PCR ...

• Main Authors: Phạm Thị Hải Yến, Nguyen Quang Linh, Nguyễn Duy Quỳnh Trâm
• Format: Text
• Language: English
• Published: OpenAlex 2021
• Subjects: Dynamics and Pathogenesis of Cholera Bacteria; Endocrinology; Biochemistry, Genetics and Molecular Biology; Life Sciences; Immunological Responses in Aquatic Organisms; Immunology; FOS Clinical medicine; Immunology and Microbiology; Genetic and Pathogenic Study of Plague Bacteria; Genetics; FOS Biological sciences; Virulence Factors; Biology; Vibrio alginolyticus; Vibrio; 16S ribosomal RNA; Microbiology; Phylogenetic tree; Nucleotide diversity; Vibrio parahaemolyticus; Population; Toxin; GenBank; Haplotype; Bacteria; Genotype; Gene; Demography; FOS Sociology; Sociology; Red drum; Sciaenops ocellatus
• Online Access: https://dx.doi.org/10.60692/0zj69-tw218; https://gresis.osc.int//doi/10.60692/0zj69-tw218

Abstract Data were collected from 30 strains of Vibrio and sampled on different organs (brain, hemorrhagic site and digestive tract) of Sciaenops ocellatus infection. The results showed that the nucleotide sequences 16S rRNA region are highly similar to those of V. alginolyticus , V. azureus , V. fluvialis, V. natriengens and V. orientalis, which were published on Genbank and other, ranging from 98.05 to 100%. The digestive tract has the most common Vibrio strains ( V. alginolyticus [16] V. azureu s [7] and V. fluvialis ). Thereout, 25 of 30 strains of Vibrio contained 1 to 3 toxin genes, except V. parahaemolyticus . Six parameters were used to measure the DNA polymorphism of 33 homologous DNA sequences in this Vibrio bacteria population. The results indicated that number of separate polymorphic sites (S), total number of mutant sites (Eta), number of haplotype (h), haplotype diversity (Hd), average number of nucleotide differences (k), nucleotide diversity (Pi) were 98 (S), 103 (Eta), 9 (h), 0.887 ± 0.032 ... : تم جمع البيانات المجردة من 30 سلالة من الضمة وأخذ عينات من أعضاء مختلفة (الدماغ والموقع النزفي والجهاز الهضمي) من عدوى Sciaenops ocellatus. أظهرت النتائج أن متواليات النوكليوتيدات 16S rRNA تشبه إلى حد كبير متواليات V. alginolyticus و V. azureus و V. fluvialis و V. natriengens و V. orientalis، والتي تم نشرها على Genbank وغيرها، والتي تتراوح من 98.05 إلى 100 ٪. يحتوي الجهاز الهضمي على سلالات الضمة الأكثر شيوعًا ( V. alginolyticus [16] V. azureu s [7] و V. fluvialis ). هناك، 25 من أصل 30 سلالة من الضمة تحتوي على 1 إلى 3 جينات سامة، باستثناء V. parahaemolyticus . تم استخدام ستة معلمات لقياس تعدد أشكال الحمض النووي لـ 33 تسلسل حمض نووي متماثل في مجموعة بكتيريا الضمة هذه. أشارت النتائج إلى أن عدد المواقع المنفصلة متعددة الأشكال (S)، والعدد الإجمالي للمواقع المتحولة (ETA)، وعدد الأنماط الفردية (h)، وتنوع الأنماط الفردية (Hd)، ومتوسط عدد اختلافات النيوكليوتيدات (k)، وتنوع النيوكليوتيدات (Pi) كان 98 (S)، 103 (ETA)، 9 (h)، 0.887 ± 0.032 (Hd)، 25.789 (k) و 17.980 × 10–3 ± 0.003 (Pi)، على التوالي (P < 0,05). يمثل ...