The dynamic proteome of Influenza A virus infection identifies species- and strain-specific control of M segment RNA splicing ... : Das dynamische Proteom der Influenza A Virus infektion zeigt spezies- und stammspezifische Kontrolle des M-Segment-RNA-Spleißens auf ...
All viruses hijack host cells to replicate. To this end, they have to interact with cellular factors at all stages of the replication cycle. Since these host cell factors differ markedly between species, viruses typically need to adapt in order to cross a species barrier. Advances in high-throughput...
| Main Author: | |
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| Format: | Doctoral or Postdoctoral Thesis |
| Language: | English |
| Published: |
Technische Universität Berlin
2020
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| Subjects: | |
| Online Access: | https://dx.doi.org/10.14279/depositonce-10399 https://depositonce.tu-berlin.de/handle/11303/11515 |
| Summary: | All viruses hijack host cells to replicate. To this end, they have to interact with cellular factors at all stages of the replication cycle. Since these host cell factors differ markedly between species, viruses typically need to adapt in order to cross a species barrier. Advances in high-throughput sequencing have provided insights into the extraordinary diversity of viruses and genomic determinants of host adaptation. However, the mechanism how these adaptive mutations enable replication in a given host is much less clear. Proteins are key players during virus infections. The study of many proteins (i.e. the proteome) in parallel was enabled by the advent of mass-spectrometry based proteomics. Further, quantitative proteomics provides the means to assess differences in proteome composition comparing different treatments or cell states. Here, quantitative proteomics in combination with bioorthogonal labeling was applied to study host-pathogen interaction at the level of protein synthesis. This approach was ... : Alle Viren befallen Wirtszellen, um sich zu replizieren. Zu diesem Zweck müssen sie in allen Phasen des Replikationszyklus mit zellulären Faktoren interagieren. Da sich diese Faktoren der Wirtszelle von speziesabhängig stark unterscheiden können, müssen sich die Viren typischerweise anpassen, um eine Artenbarriere zu überschreiten. Fortschritte in der Hochdurchsatz-Sequenzierung haben Einblicke in die außergewöhnliche Vielfalt von Viren und deren genomischen Determinanten der Wirtsadaption ermöglicht. Der Mechanismus, wie diese adaptiven Mutationen die Replikation in einem bestimmten Wirt ermöglichen, ist jedoch meist weniger klar. Proteine sind Schlüsselfaktoren bei Virusinfektionen. Die Untersuchung vieler Proteine (d.h. des gesamten Proteoms) wurde durch das Aufkommen der massenspektrometrisch basierten Proteomik ermöglicht. Darüber hinaus bietet die quantitative Proteomik die Möglichkeit, Unterschiede in der Proteomzusammensetzung im Vergleich verschiedener Behandlungen oder Zellzustände zu beurteilen. ... |
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