ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА ШТАММОВ ВИРУСА ЗАЛИВ ТЕРПЕНИЯ (ZTV ZALIV TERPENIYA VIRUS) (BUNYAVIRIDAE, PHLEBOVIRUS, АНТИГЕННЫЙ КОМПЛЕКС УКУНИЕМИ), ИЗОЛИРОВАННОГО В ВЫСОКИХ ШИРОТАХ СЕВЕРНОЙ ЕВРАЗИИ ИЗ ОБЛИГАТНЫХ ЭКТОПАРАЗИТОВ ЧИСТИКОВЫХ ПТИЦ (ALCIDAE LEACH, 1820) КЛЕЩЕЙ IXODES (CERATIXODES) URIAE WHITE, 1852 И ОТ КОМАРОВ CULEX MODESTUS FICALBI, 1889 В СУБТРОПИКАХ ЗАКАВКАЗЬЯ

• Main Authors: Львов, Дмитрий, Альховский, Сергей, Щелканов, Михаил, Щетинин, Алексей, Дерябин, Петр, Гительман, Ася, Самохвалов, Евгений, Ботиков, Андрей
• Format: Text
• Language: unknown
• Published: ОАО «Издательство «Медицина» 2014
• Subjects: ВИРУС ЗАЛИВ ТЕРПЕНИЯ ZTV; ВИРУС УКУНИЕМИ UUKV; ВЫСОКИЕ ШИРОТЫ; КОЛОНИАЛЬНЫЕ МОРСКИЕ ПТИЦЫ; IXODES (CERATIXODES) URIAE; СУБТРОПИКИ; ЗАКАВКАЗЬЕ; МЕТАГЕНОМНЫЙ АНАЛИЗ; ПОЛНОГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ; ZALIV TERPENIYA VIRUS (ZTV); UUKUNIEMI VIRUS (UUKV); Zaliv; Командорские острова
• Online Access: http://cyberleninka.ru/article/n/geneticheskaya-harakteristika-shtammov-virusa-zaliv-terpeniya-ztv-zaliv-terpeniya-virus-bunyaviridae-phlebovirus-antigennyy-kompleks; http://cyberleninka.ru/article_covers/15806773.png

В работе методом полногеномного секвенирования определены нуклеотидные последовательности генома двух вирусов LEiV-13841Ka (iD GenBank KF767463-65) и LEiV-279Az (iD GenBank KF767460-62), которые на основании филогенетического анализа классифицированы нами как штаммы вируса Залива Терпения (ZTV Zaliv Terpeniya virus). LEiV-13841Ka изолирован от клещей Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852 на острове Арий Камень (Командорские острова) в 1986 г. Второй изученный изолят LEiV-279Az, по данным первичной серологической идентификации охарактеризованный как вирус Укуниеми (UUKV Uukuniemi virus), изолирован из комаров Culex modestus Ficalbi, 1889, собранных в августе 1969 г. в колонии цапель (Ardea Linnaeus, 1758) в Азербайджане. Согласно проведенным исследованиям, LEiV-279Az также является изолятом ZTV. По RdRp LEiV-13841Ka и LEiV-279Az практически гомологичны (99%) ранее секве-нированному штамму ZTV/LEiV-271Ka. На нуклеотидном уровне гомология L-сегмента с ZTV/LEiV-271Ka составляет 94 и 98% для LEiV-13841Ka и LEiV-279Az, по сегменту М 89 и 88% соответственно. При этом по аминокислотной последовательности полипротеина Gn/Gc данные значения составляют 98,3 и 97,7%. По белку нуклеокапсида (NP) изученные штаммы ZTV/LEiV-13841Ka и LEiV-279Az обладают 88,7 и 84,6% гомологии с ZTV/LEiV-271Ka и по аминокислотной и нуклеотидной последовательности соответственно. Таким образом, нами впервые охарактеризован изолят ZTV из субтропической зоны Закавказья, который был изолирован от комаров. Полученные данные позволяют расширить предполагаемый ареал ZTV и дополнить данные об экологии флебовирусов серогруппы Укуниеми и их эволюции. Complete genome sequences were obtained for the LEIV-13841Ka (ID GenBank KF767463-65) and LEIV-279Az (ID GenBank KF767460-62) virus strains, which were classified as different strains of the Zaliv Terpeniya virus (ZTV). LEIV-13841Ka was isolated from the ticks Ixodes (Ceratixodes) uriae White, 1852 collected on Ariy Ka-men (Commander Islands) in 1986. LEIV-279Az was isolated from the mosquitoes Culex modestus Ficalbi, 1889, collected in heron colony (Ardea Linnaeus, 1758) in Azerbaijan (1969) and was initially identified as Uukuniemi virus (UUKV). According to the results obtained LeIV-279Az is ZTV strain as well. LEIV-13841Ka and LEIV-279Az RdRp sequences have high level of homology (99 %) with previously sequenced ZTV/LEIV-271Ka. The L-segment nucleotide sequences are homological with ZTV/LEIV-271Ka on the level of 94% and 98% for LEIV-13841Ka and LEIV-279Az, respectively; М-segment 89% and 88%, respectively. Such homologies for the amino acid sequences of Gn/Gc polyprotein are 98.3 % and 97.7 %. NP proteins of ZTV/LEIV-13841Ka и LEIV-279Az have 88.7 % and 84.6 % homologies with ZTV/LEIV-271Ka both for amino acid and nucleotide sequences, respectively. Thus, for the very first time we demonstrated ZTV strain isolated from mosquitoes in subtropical Transcaucasia zone. Obtained results permit to expand suggested areal of ZTV and to fill up data upon the ecology of the Uukuniemi virus group.