ГЕНЕТИЧЕСКАЯ ХАРАКТЕРИСТИКА НОВОГО ВИРУСА КОМАНДОРЫ (KOMV-KOMANDORY VIRUS; BUNYAVIRIDAE, PHLEBOVIRUS),ИЗОЛИРОВАННОГО ИЗ КЛЕЩЕЙ IXODES URIAE (ACARI: IXODIDAE), СОБРАННЫХ В ГНЕЗДОВЬЯХ КАЙР (URIA AALGE) НА КОМАНДОРСКИХ ОСТРОВАХ В БЕРИНГОВОМ МОРЕ

• Main Authors: Альховский, Сергей, Львов, Д., Щелканов, М., Щетинин, А., Дерябин, П., Ботиков, А., Гительман, А., Самохвалов, Е.
• Format: Text
• Language: unknown
• Published: ОАО «Издательство «Медицина» 2013
• Subjects: БУНЬЯВИРУСЫ; ФЛЕБОВИРУСЫ; АРБОВИРУСЫ; ВИРУС УКУНИЕМИ; ИКСОДОВЫЕ КЛЕЩИ; ПОЛНОГЕНОМНОЕ СЕКВЕНИРОВАНИЕ; Uria aalge; Берингов*; uria
• Online Access: http://cyberleninka.ru/article/n/geneticheskaya-harakteristika-novogo-virusa-komandory-komv-komandory-virus-bunyaviridae-phlebovirus-izolirovannogo-iz-kleschey-ixodes; http://cyberleninka.ru/article_covers/15806762.png

В настоящей работе проведено частичное секвенирование ранее не идентифицированного вируса, получившего название «Командоры» (Komandory KOMV, от англ. Komandorski islands), изолированного на Командорских островах из клещей Ixodes uriae в 1986 г. на основании молекулярно-генетического и филогенетического анализа последовательностей белков KOMV установлено, что KOMV является новым вирусом группы укуниеми (UUKV) рода Phlebovirus (сем. Binyaviridae). уровень идентичности последовательности белка нуклеокапсида (N) KOMV составляет в среднем 30-40% с москитными флебовирусами и 43% с вирусами группы UUKV. Наиболее высоким уровнем (65%) идентичности белок N KOMV обладает с вирусом Manawa. Гликопротеин (G) KOMV обладает от 45 до 59% идентичности с вирусами группы UUKV. Идентичность RdRp KOMV с MWAV достигает 74%. С другими вирусами группы UUKV данное значение составляет в среднем 63%. Unclassified virus named Komandory virus (KOMV) isolated in Komandorski islands from the ticks Ixodes uriae in 1986 was partially sequenced. The KOMV nucleocapsid (N) protein sequence shows 30-40% identity level with the mosquito-borne phleboviruses and 43% with the Uukuniemi virus (UUKV) group (Phlebovirus, Bunyaviridae). The maximum identity (65%) for the KOMV N protein is observed for the Manawa virus. The KOMV glycoprotein identity with the UUKV group viruses ranges from 45% to 59%. The KOMV RdRp identity with the Manawa virus reaches 74%, while showing 63% level at average with the other UUKV group viruses. According to the results of molecular-genetic and phylogenetic analysis, the KOMV is a new member of the UUKV group (Phlebovirus, Bunyaviridae).