Permanent genetic resources added to molecular ecology resources database 1 august 2011-30 september 2011

International audience This article documents the addition of 299 microsatellite marker loci and nine pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) EPIC primers to the Molecular Ecology Resources (MER) Database. Loci were developed for the following species: Alosa pseudoharengus, Alosa aestivalis, A...

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Published in:Molecular Ecology Resources
Main Authors: A'Hara, S.W., Amouroux, Paul, Argo, Emily.E., Avand-Faghih, Arman, Barat, Ashoktaru, Barbieri, Luiz, Bert, Theresa M., Blatrix, R., Blin, Aurelie, Bouktila, D., Broome, A., Burban, Christian, Capdevielle-Dulac, C., Casse, N., Chandra, Suresh, Cho Kyung Jin, -, Cottrell, J.E., Crawford, Charles R., Davis, Michelle C., Delatte, Hélène, Desneux, Nicolas, Djiéto-Lordon, C., Dubois, M.P., El-Mergawy, A.A.M., Gallardo-Escarate, C., Garcia, M., Gardiner, Mary M., Guillemaud, Thomas, Haye, P.A., Hellemans, B., Hinrichsen, Patricio, Hyun Jeon, J.I., Kerdelhue, Carole, Kharrat, I., Ki Hwan Kim, -, Yong Yul Kim, -, Ye-Seul Kwan, -, Labbe, Ellen M., Lahood, Eric, Kyung Mi Lee, -, Wan-Ok Lee, -, Yat-Hung Lee, -, Legoff, Isabelle, Li, H., Chung-Ping Lin, -, Liu, S.S., Liu, Y.G., Long, D., Maes, G.E., Magnoux, Emmanuelle
Other Authors: BBSRC Roslin Institute, Partenaires INRAE, Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Réunion (UR), Duke University, National University of Singapore (NUS), Iranian Research Institute of Plant Protection, Indian Council of Agricultural Research (ICAR), Florida Fish and Wildlife Conservation Commission, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud ), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Tunis El Manar (UTM), Université de Jendouba (UJ), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), UR 072, Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation (LEGS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université du Mans, Korea Forest Research Institute, Université de Yaoundé I, Minoufia University, Universidad de Concepción, Ohio State University, Interactions Biotiques et Santé Végétale, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), universidad catolica del Norte, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Instituto de Investigaciones Agropecuarias, Biomedic, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud )-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), EWHA Womans University (EWHA), University of Maine, Northwest Fisheries Science Center, National Fisheries Research and Development Institute, Tunghai University, Yancheng Teachers University, Ocean University of China (OUC), Plantlife Scotland, Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF)
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:English
Published: HAL CCSD 2012
Subjects:
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Ki Hwan Kim, -
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Permanent genetic resources added to molecular ecology resources database 1 august 2011-30 september 2011
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description International audience This article documents the addition of 299 microsatellite marker loci and nine pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) EPIC primers to the Molecular Ecology Resources (MER) Database. Loci were developed for the following species: Alosa pseudoharengus, Alosa aestivalis, Aphis spiraecola, Argopecten purpuratus, Coreoleuciscus splendidus, Garra gotyla, Hippodamia convergens, Linnaea borealis,Menippe mercenaria,Menippe adina, Parus major, Pinus densiflora, Portunus trituberculatus, Procontarinia mangiferae, Rhynchophorus ferrugineus, Schizothorax richardsonii, Scophthalmus rhombus, Tetraponera aethiops, Thaumetopoea pityocampa, Tuta absoluta and Ugni molinae. These loci were cross-tested on the following species: Barilius bendelisis, Chiromantes haematocheir, Eriocheir sinensis, Eucalyptus camaldulensis, Eucalyptus cladocalix, Eucalyptus globulus, Garra litaninsis vishwanath, Garra para lissorhynchus, Guindilla trinervis, Hemigrapsus sanguineus, Luma chequen. Guayaba, Myrceugenia colchagu¨ensis, Myrceugenia correifolia, Myrceugenia exsucca, Parasesarma plicatum, Parus major, Portunus pelagicus, Psidium guayaba, Schizothorax richardsonii, Scophthalmus maximus, Tetraponera latifrons, Thaumetopoea bonjeani, Thaumetopoea ispartensis, Thaumetopoea libanotica, Thaumetopoea pinivora, Thaumetopoea pityocampa ena clade, Thaumetopoea solitaria, Thaumetopoea wilkinsoni and Tor putitora. This article also documents the addition of nine EPIC primer pairs for Euphaea decorata, Euphaea formosa, Euphaea ornata and Euphaea yayeyamana.
author2 BBSRC Roslin Institute
Partenaires INRAE
Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Réunion (UR)
Duke University
National University of Singapore (NUS)
Iranian Research Institute of Plant Protection
Indian Council of Agricultural Research (ICAR)
Florida Fish and Wildlife Conservation Commission
Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE)
Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud )
Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2)
Institut Sophia Agrobiotech (ISA)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS)
COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)
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Université de Jendouba (UJ)
Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo)
Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB)
UR 072, Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation
Institut de Recherche pour le Développement (IRD)
Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation (LEGS)
Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)
Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11)
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Université de Yaoundé I
Minoufia University
Universidad de Concepción
Ohio State University
Interactions Biotiques et Santé Végétale
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Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL)
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Biomedic
Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP)
Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud )-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro)
Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
EWHA Womans University (EWHA)
University of Maine
Northwest Fisheries Science Center
National Fisheries Research and Development Institute
Tunghai University
Yancheng Teachers University
Ocean University of China (OUC)
Plantlife Scotland
Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF)
format Article in Journal/Newspaper
author A'Hara, S.W.
Amouroux, Paul
Argo, Emily.E.
Avand-Faghih, Arman
Barat, Ashoktaru
Barbieri, Luiz
Bert, Theresa M.
Blatrix, R.
Blin, Aurelie
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Magnoux, Emmanuelle BBSRC Roslin Institute Partenaires INRAE Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT) Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Réunion (UR) Duke University National University of Singapore (NUS) Iranian Research Institute of Plant Protection Indian Council of Agricultural Research (ICAR) Florida Fish and Wildlife Conservation Commission Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE) Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro) Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud ) Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2) Institut Sophia Agrobiotech (ISA) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS) COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) Université de Tunis El Manar (UTM) Université de Jendouba (UJ) Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB) UR 072, Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation Institut de Recherche pour le Développement (IRD) Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation (LEGS) Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS) Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11) Université du Mans Korea Forest Research Institute Université de Yaoundé I Minoufia University Universidad de Concepción Ohio State University Interactions Biotiques et Santé Végétale Institut National de la Recherche Agronomique (INRA) universidad catolica del Norte Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL) Instituto de Investigaciones Agropecuarias Biomedic Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP) Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud )-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro) Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro) EWHA Womans University (EWHA) University of Maine Northwest Fisheries Science Center National Fisheries Research and Development Institute Tunghai University Yancheng Teachers University Ocean University of China (OUC) Plantlife Scotland Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF) 2012 https://hal.inrae.fr/hal-02653040 https://hal.inrae.fr/hal-02653040/document https://hal.inrae.fr/hal-02653040/file/49724_20120419021101390_1.pdf https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2011.03088.x en eng HAL CCSD Wiley/Blackwell info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1111/j.1755-0998.2011.03088.x hal-02653040 https://hal.inrae.fr/hal-02653040 https://hal.inrae.fr/hal-02653040/document https://hal.inrae.fr/hal-02653040/file/49724_20120419021101390_1.pdf doi:10.1111/j.1755-0998.2011.03088.x PRODINRA: 49724 WOS: 000298585000022 info:eu-repo/semantics/OpenAccess ISSN: 1755-098X EISSN: 1755-0998 Molecular Ecology Resources https://hal.inrae.fr/hal-02653040 Molecular Ecology Resources, Wiley/Blackwell, 2012, 12 (1), pp.185-189. ⟨10.1111/j.1755-0998.2011.03088.x⟩ animals databases genetic fishes genetics microsatellite repeats molecular sequence data insects genetics invertebrates genetics pinus genetics génétique insecte [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology environment info:eu-repo/semantics/article Journal articles 2012 ftccsdartic https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2011.03088.x 2021-12-12T01:36:16Z International audience This article documents the addition of 299 microsatellite marker loci and nine pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) EPIC primers to the Molecular Ecology Resources (MER) Database. Loci were developed for the following species: Alosa pseudoharengus, Alosa aestivalis, Aphis spiraecola, Argopecten purpuratus, Coreoleuciscus splendidus, Garra gotyla, Hippodamia convergens, Linnaea borealis,Menippe mercenaria,Menippe adina, Parus major, Pinus densiflora, Portunus trituberculatus, Procontarinia mangiferae, Rhynchophorus ferrugineus, Schizothorax richardsonii, Scophthalmus rhombus, Tetraponera aethiops, Thaumetopoea pityocampa, Tuta absoluta and Ugni molinae. These loci were cross-tested on the following species: Barilius bendelisis, Chiromantes haematocheir, Eriocheir sinensis, Eucalyptus camaldulensis, Eucalyptus cladocalix, Eucalyptus globulus, Garra litaninsis vishwanath, Garra para lissorhynchus, Guindilla trinervis, Hemigrapsus sanguineus, Luma chequen. Guayaba, Myrceugenia colchagu¨ensis, Myrceugenia correifolia, Myrceugenia exsucca, Parasesarma plicatum, Parus major, Portunus pelagicus, Psidium guayaba, Schizothorax richardsonii, Scophthalmus maximus, Tetraponera latifrons, Thaumetopoea bonjeani, Thaumetopoea ispartensis, Thaumetopoea libanotica, Thaumetopoea pinivora, Thaumetopoea pityocampa ena clade, Thaumetopoea solitaria, Thaumetopoea wilkinsoni and Tor putitora. This article also documents the addition of nine EPIC primer pairs for Euphaea decorata, Euphaea formosa, Euphaea ornata and Euphaea yayeyamana. Article in Journal/Newspaper Scophthalmus maximus Archive ouverte HAL (Hyper Article en Ligne, CCSD - Centre pour la Communication Scientifique Directe) Parus ENVELOPE(3.950,3.950,-71.983,-71.983) Ugni ENVELOPE(145.420,145.420,59.404,59.404) Molecular Ecology Resources 12 1 185 189