Permanent genetic resources added to molecular ecology resources database 1 august 2011-30 september 2011

International audience This article documents the addition of 299 microsatellite marker loci and nine pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) EPIC primers to the Molecular Ecology Resources (MER) Database. Loci were developed for the following species: Alosa pseudoharengus, Alosa aestivalis, A...

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Bibliographic Details
Published in:Molecular Ecology Resources
Main Authors: A'Hara, S.W., Amouroux, Paul, Argo, Emily.E., Avand-Faghih, Arman, Barat, Ashoktaru, Barbieri, Luiz, Bert, Theresa M., Blatrix, R., Blin, Aurelie, Bouktila, D., Broome, A., Burban, Christian, Capdevielle-Dulac, C., Casse, N., Chandra, Suresh, Cho Kyung Jin, -, Cottrell, J.E., Crawford, Charles R., Davis, Michelle C., Delatte, Hélène, Desneux, Nicolas, Djiéto-Lordon, C., Dubois, M.P., El-Mergawy, A.A.M., Gallardo-Escarate, C., Garcia, M., Gardiner, Mary M., Guillemaud, Thomas, Haye, P.A., Hellemans, B., Hinrichsen, Patricio, Hyun Jeon, J.I., Kerdelhue, Carole, Kharrat, I., Ki Hwan Kim, -, Yong Yul Kim, -, Ye-Seul Kwan, -, Labbe, Ellen M., Lahood, Eric, Kyung Mi Lee, -, Wan-Ok Lee, -, Yat-Hung Lee, -, Legoff, Isabelle, Li, H., Chung-Ping Lin, -, Liu, S.S., Liu, Y.G., Long, D., Maes, G.E., Magnoux, Emmanuelle
Other Authors: BBSRC Roslin Institute, Partenaires INRAE, Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de La Réunion (UR), Duke University, National University of Singapore (NUS), Iranian Research Institute of Plant Protection, Indian Council of Agricultural Research (ICAR), Florida Fish and Wildlife Conservation Commission, Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud ), Université Montpellier 2 - Sciences et Techniques (UM2), Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Université de Tunis El Manar (UTM), Université de Jendouba (UJ), Biodiversité, Gènes & Communautés (BioGeCo), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université de Bordeaux (UB), UR 072, Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation, Institut de Recherche pour le Développement (IRD), Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation (LEGS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Université Paris-Sud - Paris 11 (UP11), Université du Mans, Korea Forest Research Institute, Université de Yaoundé I, Minoufia University, Universidad de Concepción, Ohio State University, Interactions Biotiques et Santé Végétale, Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), universidad catolica del Norte, Université Catholique de Louvain = Catholic University of Louvain (UCL), Instituto de Investigaciones Agropecuarias, Biomedic, Centre de Biologie pour la Gestion des Populations (UMR CBGP), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Université de Montpellier (UM)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud )-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), EWHA Womans University (EWHA), University of Maine, Northwest Fisheries Science Center, National Fisheries Research and Development Institute, Tunghai University, Yancheng Teachers University, Ocean University of China (OUC), Plantlife Scotland, Unité de recherche Zoologie Forestière (URZF)
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:English
Published: HAL CCSD 2012
Subjects:
Online Access:https://hal.inrae.fr/hal-02653040
https://hal.inrae.fr/hal-02653040/document
https://hal.inrae.fr/hal-02653040/file/49724_20120419021101390_1.pdf
https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2011.03088.x
Description
Summary:International audience This article documents the addition of 299 microsatellite marker loci and nine pairs of single-nucleotide polymorphism (SNP) EPIC primers to the Molecular Ecology Resources (MER) Database. Loci were developed for the following species: Alosa pseudoharengus, Alosa aestivalis, Aphis spiraecola, Argopecten purpuratus, Coreoleuciscus splendidus, Garra gotyla, Hippodamia convergens, Linnaea borealis,Menippe mercenaria,Menippe adina, Parus major, Pinus densiflora, Portunus trituberculatus, Procontarinia mangiferae, Rhynchophorus ferrugineus, Schizothorax richardsonii, Scophthalmus rhombus, Tetraponera aethiops, Thaumetopoea pityocampa, Tuta absoluta and Ugni molinae. These loci were cross-tested on the following species: Barilius bendelisis, Chiromantes haematocheir, Eriocheir sinensis, Eucalyptus camaldulensis, Eucalyptus cladocalix, Eucalyptus globulus, Garra litaninsis vishwanath, Garra para lissorhynchus, Guindilla trinervis, Hemigrapsus sanguineus, Luma chequen. Guayaba, Myrceugenia colchagu¨ensis, Myrceugenia correifolia, Myrceugenia exsucca, Parasesarma plicatum, Parus major, Portunus pelagicus, Psidium guayaba, Schizothorax richardsonii, Scophthalmus maximus, Tetraponera latifrons, Thaumetopoea bonjeani, Thaumetopoea ispartensis, Thaumetopoea libanotica, Thaumetopoea pinivora, Thaumetopoea pityocampa ena clade, Thaumetopoea solitaria, Thaumetopoea wilkinsoni and Tor putitora. This article also documents the addition of nine EPIC primer pairs for Euphaea decorata, Euphaea formosa, Euphaea ornata and Euphaea yayeyamana.