Understanding inter-reach variation in brown trout ( Salmo trutta ) mortality rates using a hierarchical Bayesian state-space model

• Published in: Canadian Journal of Fisheries and Aquatic Sciences
• Main Authors: Bret, Victor, Capra, H., Gouraud, Véronique, Lamouroux, N., Piffady, Jérémy, Tissot, Laurence, Rivot, Etienne
• Other Authors: Milieux aquatiques, écologie et pollutions (UR MALY), Institut national de recherche en sciences et technologies pour l'environnement et l'agriculture (IRSTEA), EDF (EDF), Centre national du machinisme agricole, du génie rural, des eaux et forêts (CEMAGREF), Laboratoire National d’Hydraulique et Environnement (EDF R&D LNHE), EDF R&D (EDF R&D), EDF (EDF)-EDF (EDF), Écologie et santé des écosystèmes (ESE), Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-AGROCAMPUS OUEST, Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: English
• Published: HAL CCSD 2017
• Subjects: atlantic salmon; fish; new-zealand; environmental determinants; water temperature; stream network; mark-recapture; life-cycles; population-dynamics; variable selection; populations; [SDV.EE]Life Sciences [q-bio]/Ecology; environment; [SDV.EE.MOD]Life Sciences [q-bio]/Ecology; environment/domain_sdv.ee.mod; [SDV.BA]Life Sciences [q-bio]/Animal biology; [SDV]Life Sciences [q-bio]; New Zealand; Atlantic salmon
• Online Access: https://hal-agrocampus-ouest.archives-ouvertes.fr/hal-01821208; https://doi.org/10.1139/cjfas-2016-0240

International audience La gestion et la protection efficaces des populations d’animaux sauvages reposent sur une bonne compréhension de leurs cycles biologiques. Parce que la dynamique des populations dépend des interactions complexes de processus biologiques et écologiques à différentes échelles, de nouvelles approches sont nécessaires pour expliquer la variabilité des processus démographiques et des paramètres associés dans une hiérarchie d’échelles spatiales. Un modèle bayésien hiérarchique du cycle biologique des truites fario (Salmo trutta) résidentes a été élaboré pour évaluer l’influence relative de déterminants locaux et généraux de la mortalité. Le modèle a été calé sur un vaste ensemble de données provenant de 40 tronçons de rivière, qui combine des données d’abondance et de conditions du milieu (hydraulique, température de l’eau). La mortalité des juvéniles dépendante de la densité augmente à faibles températures et diminue quand la disponibilité d’abris augmente. Des températures de l’eau élevées accroissent la mortalité densité-dépendante chez les adultes. Le modèle pourrait aider à prédire la mortalité mensuelle des juvéniles et des adultes dans des scénarios de réchauffement climatique et de modifications de la disponibilité d’abris découlant de la dégradation ou de la restauration d’habit