Permanent Genetic Resources added to Molecular Ecology Resources Database 1 June 2010 - 31 July 2010

Correspondance: Molecular Ecology Resources Primer Development Consortium, E-mail: editorial.office@molecol.com International audience This article documents the addition of 512 microsatellite marker loci and nine pairs of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) sequencing primers to the Molecular Ecol...

Full description

Bibliographic Details
Published in:Molecular Ecology Resources
Main Authors: ANDRIS, MALVINA, ARADOTTIR, GUDBJORG I., ARNAU, G., AUDZIJONYTE, ASTA, BESS, EMILIE C., Bonadonna, Francesco, Bourdel, G., Bried, Joël, BUGBEE, GREGORY J., Burger, P. A., CHAIR, H., CHARRUAU, P. C., CIAMPI, A. Y., Costet, Laurent, DeBARRO, PAUL J., Delatte, Hélène, Dubois, Marie-Pierre, ELDRIDGE, MARK D. B., ENGLAND, PHILLIP R., ENKHBILEG, D., FARTEK, B., GARDNER, MICHAEL G., GRAY, KAREN-ANN, GUNASEKERA, RASANTHI M., HANLEY, STEVEN J., HAVIL, NATHAN, HEREWARD, JAMES P., HIRASE, SHOTARO, HONG, YAN, Jarne, Philippe, JIANFEI, QI, JOHNSON, REBECCA N., KANNO, MANAMI, KIJIMA, AKIHIRO, KIM, HYUN C., KIM, KWAN S., Kim, Woo-Jin, LaRUE, ELIZABETH, LEE, JANG W., LEE, JEONG-HO, LI, CHUNHONG, LIAO, MINGHUI, LO, NATHAN, LOWE, ANDREW J., Malausa, Thibaut, Malé, Pierre-Jean G., MARKO, MICHELLE D., Martin, Jean-Francois, MESSING, RUSSELL, MILLER, KAREN J.
Other Authors: Centre d’Ecologie Fonctionnelle et Evolutive (CEFE), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université de Montpellier (UM)-École pratique des hautes études (EPHE), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Centre international d'études supérieures en sciences agronomiques (Montpellier SupAgro)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université Paul-Valéry - Montpellier 3 (UPVM)-Institut national d’études supérieures agronomiques de Montpellier (Montpellier SupAgro), Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD France-Sud ), Department of Biomedical Sciences, Institute of Population Genetics, University of Veterinary Medicine, University of Veterinary Medicine, Research Institute of Wildlife Ecology, University of Veterinary Medicine, Department of Epidemiology, Biostatistics and Occupational Health Montréal, McGill University = Université McGill Montréal, Canada, Institut de Chimie de Clermont-Ferrand (ICCF), Université Blaise Pascal - Clermont-Ferrand 2 (UBP)-SIGMA Clermont (SIGMA Clermont)-Institut de Chimie du CNRS (INC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Laboratoire Evolution, Génomes et Spéciation (LEGS), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), School of Physics and Astronomy, University of Birmingham Birmingham, Division of Cardiovascular Medicine, University of Cambridge UK (CAM), Birkbeck College University of London, Department of Mathematical Sciences, TJ Watson, IBM, Southeast University Jiangsu, State Key Lab. of Information Engineering in Surveying, Mapping and Remote Sensing, Wuhan University China, Institut Sophia Agrobiotech (ISA), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Université Nice Sophia Antipolis (. - 2019) (UNS), COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-COMUE Université Côte d'Azur (2015-2019) (COMUE UCA)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Evolution et Diversité Biologique (EDB), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université Toulouse III - Paul Sabatier (UT3), Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées-Université Fédérale Toulouse Midi-Pyrénées, Ecologie des forêts de Guyane (ECOFOG), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Université des Antilles et de la Guyane (UAG)-AgroParisTech-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), School of Mechanical and Chemical Engineering, The University of Western Australia (UWA), Institut de recherche agricole pour le développement (IRAD), Ministère de la Recherche et de l'innovation, Department of Physics and Graduate School of Nanoscience and Technology, Korea Advanced Institute of Science and Technology (KAIST), Paris-Jourdan Sciences Economiques (PSE), École normale supérieure - Paris (ENS Paris), Université Paris sciences et lettres (PSL)-Université Paris sciences et lettres (PSL)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-École des hautes études en sciences sociales (EHESS)-École des Ponts ParisTech (ENPC)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS), Polymorphismes d'intérêt agronomique (UMR PIA), Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de la Recherche Agronomique (INRA), Technologie Servier, Institute of Arctic and Alpine Research (INSTAAR), University of Colorado Boulder, Centre de recherche sur l'espace sonore et l'environnement urbain (CRESSON), Ambiances architecturales et urbaines (AAU), Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-École Centrale de Nantes (ECN)-Centre National de la Recherche Scientifique (CNRS)-Ministère de la Culture et de la Communication (MCC)-École Centrale de Nantes (ECN)
Format: Article in Journal/Newspaper
Language:English
Published: HAL CCSD 2010
Subjects:
Online Access:https://hal-agroparistech.archives-ouvertes.fr/hal-01094222
https://doi.org/10.1111/j.1755-0998.2010.02916.x
Description
Summary:Correspondance: Molecular Ecology Resources Primer Development Consortium, E-mail: editorial.office@molecol.com International audience This article documents the addition of 512 microsatellite marker loci and nine pairs of Single Nucleotide Polymorphism (SNP) sequencing primers to the Molecular Ecology Resources Database. Loci were developed for the following species: Alcippe morrisonia morrisonia, Bashania fangiana, Bashania fargesii, Chaetodon vagabundus, Colletes floralis, Coluber constrictor flaviventris, Coptotermes gestroi, Crotophaga major, Cyprinella lutrensis, Danaus plexippus, Fagus grandifolia, Falco tinnunculus, Fletcherimyia fletcheri, Hydrilla verticillata, Laterallus jamaicensis coturniculus, Leavenworthia alabamica, Marmosops incanus, Miichthys miiuy, Nasua nasua, Noturus exilis, Odontesthes bonariensis, Quadrula fragosa, Pinctada maxima, Pseudaletia separata, Pseudoperonospora cubensis, Podocarpus elatus, Portunus trituberculatus, Rhagoletis cerasi, Rhinella schneideri, Sarracenia alata, Skeletonema marinoi, Sminthurus viridis, Syngnathus abaster, Uroteuthis (Photololigo) chinensis, Verticillium dahliae, Wasmannia auropunctata, and Zygochlamys patagonica. These loci were cross-tested on the following species: Chaetodon baronessa, Falco columbarius, Falco eleonorae, Falco naumanni, Falco peregrinus, Falco subbuteo, Didelphis aurita, Gracilinanus microtarsus, Marmosops paulensis, Monodelphis Americana, Odontesthes hatcheri, Podocarpus grayi, Podocarpus lawrencei, Podocarpus smithii, Portunus pelagicus, Syngnathus acus, Syngnathus typhle,Uroteuthis (Photololigo) edulis, Uroteuthis (Photololigo) duvauceli and Verticillium albo-atrum. This article also documents the addition of nine sequencing primer pairs and sixteen allele specific primers or probes for Oncorhynchus mykiss and Oncorhynchus tshawytscha; these primers and assays were cross-tested in both species.