Anguilla anguilla ir A. japonica individų rūšinės priklausomybės nustatymas molekuliniu metodu, pagrįstu mtDNR D-kilpos regiono homologinių sekų analize

• Main Authors: Ragauskas, Adomas, Butkauskas, Dalius, Sruoga, Aniolas
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: Lithuanian
• Published: 2011
• Subjects: Anguilla sp; Molekulinis metodas; D-kilpa; Rūšies identifikacija; Molecular technique; D-loop; Species identification; Straipsnis Clarivate Analytics Web of Science / Article in Clarivate Analytics Web of Science (S1); Biologija / Biology (N010); Kad’; Anguilla anguilla
• Online Access: http://vetzoo.lva.lt/data/vols/2011/55/pdf/ragauskas.pdf

Įgyvendinant CITES konvencijos reikalavimus, norint nustatyti Anguilla sp. individų rūšinę priklausomybę, taikytas molekulinis metodas, pagrįstas PGR su Ang1 pradmenų pora, skirta amplifikuoti A. anguilla mtDNR D-kilpos regioną, ir gautų mtDNR fragmentų bei kelių A. anguilla, A. rostrata ir A. japonica sekų iš „GenBank“ homologinių sekų analize. Tyrimų rezultatai vienareikšmiškai patvirtina, kad A. anguilla, A. rostrata ir A. japonica rūšių identifikacija, analizuojant mtDNR D-kilpos regiono 450-455 bp homologines sekas, yra patikima. Panaudojus abejotinos kilmės 31 individo audinių pavyzdžius nustatyta, kad visos tirtos mtDNR D-kilpos regiono sekos priklauso A. japonica rūšiai ir priskirtinos skirtingiems haplotipams. Taikytas molekulinis metodas atitinka tarptautinius rūšies identifikavimo reikalavimus ir gali būti alternatyva kitiems metodams In order to clarify whether declared eels belong to A. japonica species or not, molecular technique which is based on PCR with Ang1 primer pair and alignment of newly obtained sequences with homologous A. anguilla, A. rostrata and A. japonica sequences from the GenBank, was used. It was shown that identification of A. anguilla, A. rostrata and A. japonica species based on analysis of 450-455 bp homologous mtDNA D-loop region sequences is reliable. After the study of 31 eels of uncertain origin it became clear that all investigated mtDNA D-loop region sequences belong to A. japonica species. Since this molecular technique is a powerful tool for A. anguilla and A. japonica d iscrimination, thus it could be used as an alternative to other methods Biologijos katedra Gamtos tyrimų centras Vytauto Didžiojo universitetas