Bartonella spp. identifikavimas utėlėse panaudojant rpoB ir ITS regiono sekų analizę

• Main Author: Griciūtė, Gabija
• Other Authors: Radzijevskaja, Jana
• Format: Bachelor Thesis
• Language: Lithuanian
• Published: 2020
• Subjects: Bartonella; utėlės; rpoB genas; ITS regionas; Lice; rpoB gene; ITS region; Chemijos inžinerija / Chemical engineering (T005); Ligas; Microtus arvalis
• Online Access: https://hdl.handle.net/20.500.12259/107480

Tyrimai atliekami su Bartonella bakterijomis yra svarbūs dėl šių patogenų paplitimo tarp graužikų ir kitų laukinių bei naminių gyvūnų ir jų ektoparazitų. Bartonella bakterijos gali sukelti įvairaus sunkumo ligas žmonėms, o komplikacijos gali išlikti visą gyvenimą. Bartonella patogenų identifikacija taip pat svarbi ištirti naujas rūšis bei jų plitimą anksčiau neužkrėstuose regionuose ar žemynuose. Šio darbo tikslas yra identifikuoti Bartonella bakterijų rūšis utėlėse, surinktose nuo smulkiųjų graužikų Slovakijoje, naudojantis molekuliniais tyrimo metodais. Rūšių identifikavime buvo tirtos 5 utėlių rūšys: Huebneria affinis, Pyroteuthis serrata, Polyplax spinulosa, Hoplopleura sp., Hoplopleura acanthopus, surinktos iš Apodemus agrarius, Apodemus flavicollis, Microtus arvalis ir Myodes glareolus graužikų. Bartonella rūšių identifikavimui buvo gausinami rpoB geno ir ITS regiono sekų fragmentai atliekant PGR. Amplifikuoti rpoB geno ir ITS regiono PGR produktai buvo išvalomi ir sekvenuojami. Gautos sekos buvo analizuojamos naudojant Mega X programą. Atliekant rpoB geno ir ITS regiono sekų analizę nustatytos 3 Bartonella rūšys: Bartonella coopersplainsensis, Bartonella tribocorum ir Bartonella taylorii. Užsikrėtimas B. coopersplainsensis nustatytas 7 H. affinis utėlių mėginiuose, B. taylorii nustatyta 1 H. affinis mėginyje ir B. tribocorum identifikuota 2 H. affinis bei 1 P. serrata mėginyje. Studies done with Bartonella bacteria are important as these pathogens are very common between domestic and wild animals (including rodents) and their ectoparasites. Bartonella bacteria can cause serious diseases in humans and complications can last for the rest of the life. As well, identification of Bartonella pathogens is important to identify new species and its spreading to new regions or continents. The aim of this study was to identify Bartonella bacteria species by using molecular methods in lice. They were collected from small rodents in Slovenia. In identification of Bartonella species 5 lice species were investigated: Huebneria affinis, Pyroteuthis serrata, Polyplax spinulosa, Hoplopleura sp., Hoplopleura acanthopus. Lice were collected from rodents identified as Apodemus agrarius, Apodemus flavicollis, Microtus arvalis and Myodes glareolus. Bartonella species identification was based on amplification of partial rpoB gene and ITS region. Amplified rpoB gene and ITS region PCR products were purified and sequenced. Obtained sequences were analyzed by using Mega X software. Sequence analysis allowed to identify three Bartonella species: Bartonella coopersplainsensis, Bartonella tribocorum and Bartonella taylorii. B. coopersplainsensis infection was identified in 7 H. affinis lice samples, B. taylorii was identified in 1 H. affinis sample and B. tribocorum in 2 H. affinis as well as in 1 P. serrata samples. Gamtos mokslų fakultetas Biologijos katedra