Filogenetinė hemotropinių Mycoplasma spp. 16S rRNR regiono ir Rickettsia spp. gltA geno sekų analizė iš šiksnosparnių.

• Main Author: Dumaitytė, Modesta
• Other Authors: Paulauskas, Algimantas
• Format: Master Thesis
• Language: Lithuanian
• Published: 2020
• Subjects: Ricketsia spp; Mycoplasma spp; Šikšnosparniai; Bats; Biologija / Biology (N010); Kad’; Vespertilio murinus
• Online Access: https://hdl.handle.net/20.500.12259/107285

Darbo tikslas - panaudojant molekulinius tyrimo metodus atlikti šikšnosparniuose aptinkamų Mycoplasma spp. ir Rickettsia spp. patogenų filogenetinę sekų analizę. Šiame darbe buvo ištirta 17 kritusių Vespertilionidae šeimos šikšnosparnių. Diagnozuojant užsikrėtimą Mycoplasma spp. patogenais buvo panaudotas klasikinis PGR metodas, o detektuojant Rickettsia spp. - tikro laiko PGR ir lizdinės PGR metodai. Molekuliniais metodais ištyrus šikšnosparnių mėginius nustatyta, kad užsikrėtimas Mycoplasma spp. patogenais aptiktas dviejuose Myotis daubentonii šikšnosparniuose - blužnies mėginiuose ir Eptesicus serotinus šikšnosparnio plaučių mėginyje. O Vespertilio murinus blužnies ir širdies mėginiuose buvo aptiktas užsikrėtimas Rickettsia spp. patogenais. Atlikus filogenetinę Mycoplasma spp. 16S rRNR geno sekų analizę su GenBank esančiomis sekomis identifikuota, kad tiriamoji bakterija yra filogenetiškai artimiausia su Mycoplasma insons, Mycoplasma cavipharyngis ir Mycoplasma fastidiosum rūšimis. Tuo tarpu Rickettsia spp. gltA geno filogenetinė analizė parodė, kad tiriamasis patogenas yra artimiausias su Rickettsia heilongjiangensis rūšimi, aptikta Haemaphysalis concinna erkėje. The aim of the study was to investigate the presence of Mycoplasma spp. and Rickettsia spp. in bats using molecular testing methods and build a phylogenetic tree based on GenBank genetic sequence database. In this work, 17 fallen bats of the Vespertilionidae family were examined. Clasic PCR is used to diagnose Mycoplasma spp. infections, real-time PCR and nested PCR were used for the detection of Rickettsia spp. pathogens. Molecular analysis of bat samples has shown that Mycoplasma spp. were detected in two bats of Myotis daubentonii (spleen specimens), and in the Eptesicus serotinus bat - lung specimen. Infection of Rickettsia spp. was detected in the spleen and heart samples of Vespertilio murinus bat. Phylogenetic analysis of 16S rRNA gene of Mycoplasma spp. with the sequences from GenBank, has shown that the our sequence is phylogenetically closest to Mycoplasma insons, Mycoplasma cavipharyngis, and Mycoplasma fastidiosum species. Rickettsia spp. phylogenetic analysis of the gltA gene showed that the tested pathogen sequence is phylogeneticaly closest to the Rickettsia heilongjiangensis specie detected in the Haemaphysalis concinna tick. Gamtos mokslų fakultetas Biologijos katedra