Genetic diversity and effective size of wild fish populations: The case of Atlantic salmon a diadromous threatene d migratory fish
This thesis was concerned mainly with the genetic diversity and the effective size ( Ne ) of wild fish stocks of diadromous migratory endangered Atlantic salmon ( Salmo salar ). For this, four populations were chosen in the northern (Scotland) and southern (France) part of Europe for their differenc...
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Format: | Doctoral or Postdoctoral Thesis |
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HAL CCSD
2009
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ftutoulouse3hal:oai:HAL:tel-02820264v1 2023-07-30T04:02:25+02:00 Genetic diversity and effective size of wild fish populations: The case of Atlantic salmon a diadromous threatene d migratory fish Diversité génétique et taille efficace chez les populations de poissons sauvages : le cas du Saumon atlantique un poisson migrateur amphihalin menacé . Nikolic, Natacha Laboratoire de Génétique Cellulaire (LGC) Institut National de la Recherche Agronomique (INRA)-Ecole Nationale Vétérinaire de Toulouse (ENVT) Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT)-Institut National Polytechnique (Toulouse) (Toulouse INP) Université de Toulouse (UT)-Université de Toulouse (UT) Université Toulouse III - Paul Sabatier Claude Chevalet 2009-07-15 https://hal.inrae.fr/tel-02820264 fr fre HAL CCSD tel-02820264 https://hal.inrae.fr/tel-02820264 PRODINRA: 353300 https://hal.inrae.fr/tel-02820264 Sciences du Vivant [q-bio]. Université Toulouse III - Paul Sabatier, 2009. Français. ⟨NNT : ⟩ https://archives-publications.inrae.fr/353300.pdf these [SDV]Life Sciences [q-bio] info:eu-repo/semantics/doctoralThesis Theses 2009 ftutoulouse3hal 2023-07-20T22:27:30Z This thesis was concerned mainly with the genetic diversity and the effective size ( Ne ) of wild fish stocks of diadromous migratory endangered Atlantic salmon ( Salmo salar ). For this, four populations were chosen in the northern (Scotland) and southern (France) part of Europe for their differences in their structure and management. This work led to the development of two new models. DemoDivMS predicted genetic diversity of a population whose evolutionary scen ario, given by the user, describes variations of Ne during the previous generations. VarEff tries to estimate the effective sizes, sampling time and pasts, based on direct analytical calc ulations to shorten the time of calculations Ces travaux de thèse se sont intéressés principalement à la diversité génétique et à la taille efficace ( Ne ) de stocks de poissons sauvages amphih alins migrateurs en danger, le Saumon atlantique ( Salmo salar ). Pour cela, quatre populations ont été choisies en Europe du Nord (Ecosse) et en Europe du Sud (France) pour le urs différences de structure et de mode de gestion. Ces travaux ont abouti au développement de deux nouveaux modèles. DemoDivMS prédit la diversité génétique d’une population dont le scénario évolutif, donné par l’utilisateur, décrit des variations de Ne au cours des générations antérieures. VarEff cherche à estimer les tailles efficaces, au moment de l’échantillonnage et passées, en s’appuyant sur des calculs analytiques directs raccourcissant les temps de calculs. Doctoral or Postdoctoral Thesis Atlantic salmon Salmo salar Université Toulouse III - Paul Sabatier: HAL-UPS |
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This thesis was concerned mainly with the genetic diversity and the effective size ( Ne ) of wild fish stocks of diadromous migratory endangered Atlantic salmon ( Salmo salar ). For this, four populations were chosen in the northern (Scotland) and southern (France) part of Europe for their differences in their structure and management. This work led to the development of two new models. DemoDivMS predicted genetic diversity of a population whose evolutionary scen ario, given by the user, describes variations of Ne during the previous generations. VarEff tries to estimate the effective sizes, sampling time and pasts, based on direct analytical calc ulations to shorten the time of calculations Ces travaux de thèse se sont intéressés principalement à la diversité génétique et à la taille efficace ( Ne ) de stocks de poissons sauvages amphih alins migrateurs en danger, le Saumon atlantique ( Salmo salar ). Pour cela, quatre populations ont été choisies en Europe du Nord (Ecosse) et en Europe du Sud (France) pour le urs différences de structure et de mode de gestion. Ces travaux ont abouti au développement de deux nouveaux modèles. DemoDivMS prédit la diversité génétique d’une population dont le scénario évolutif, donné par l’utilisateur, décrit des variations de Ne au cours des générations antérieures. VarEff cherche à estimer les tailles efficaces, au moment de l’échantillonnage et passées, en s’appuyant sur des calculs analytiques directs raccourcissant les temps de calculs. |
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