ОЦЕНКА РОЛИ ИОНА ЦИНКА ПРИ ПЕРЕНОСЕ ЭЛЕКТРОНА В КАТАЛИТИЧЕСКОМ ЦИКЛЕ СУПЕРОКСИДДИСМУТАЗЫ

• Main Authors: Рябых, А. В., Маслова, О. А., Безносюк, С. А.
• Format: Article in Journal/Newspaper
• Language: Russian
• Published: Нижнетагильский технологический институт (филиал) Уральского федерального университета 2022
• Subjects: CU,ZN-СУПЕРОКСИДДИСМУТАЗА; СУПЕРОКСИДНЫЙ ИОН-РАДИКАЛ; ФЕРМЕНТ; АКТИВНЫЕ ФОРМЫ КИСЛОРОДА; АНТИОКСИДАНТЫ; ФИЗИКОХИМИЯ КОНДЕНСИРОВАННОГО СОСТОЯНИЯ; КОМПЬЮТЕРНОЕ МОДЕЛИРОВАНИЕ; Orca
• Online Access: http://elar.urfu.ru/handle/10995/117341

Проведено изучение взаимодействие супероксидного ион-радикала О2-с активным центром Cu,Zn-супероксиддисмутазы путем компьютерного моделирования при помощи программного пакета ORCA версии 5.0.2 на уровне теории функционала плотности с использованием функционала PBE и базисных наборов функций def2-SVP, def2-SVPD и def2-TZVPD. Получены основные характеристики для двух процессов переноса электрона в каталитическом цикле дезактивации ион-радикала: потенциал реакции .G0, полная энергия реорганизации .tot, энергия активации .G., матричный элемент перекрывания HDA и константа скорости переноса k по Маркусу. Переменным фактором при моделировании являлось наличие иона Zn2+ в активном центре фермента. Установлено, что наличие иона Zn2+ способствует в значительной степени только второму переносу электрона от иона Cu+ к протонированной форме ион-радикала – гидропероксидному радикалу HO2. Посредством специфических взаимодействий ион цинка при прочих равных условиях повышает константу скорости переноса электрона на пять порядков.