Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony
Els microorganismes exerceixen papers fonamentals en els cicles biogeoquímics, actuen com a valuosos indicadors de la salut del medi ambient, funcionant com a sentinelles del canvi global fins i tot en les remotes i delicades regions polars. La diversitat microbiana dels sediments aquàtics sol anali...
Main Author: | |
---|---|
Other Authors: | , , , |
Format: | Bachelor Thesis |
Language: | English |
Published: |
Universitat Politècnica de Catalunya
2023
|
Subjects: | |
Online Access: | http://hdl.handle.net/2117/397914 |
id |
ftupcatalunyair:oai:upcommons.upc.edu:2117/397914 |
---|---|
record_format |
openpolar |
spelling |
ftupcatalunyair:oai:upcommons.upc.edu:2117/397914 2024-09-15T17:44:41+00:00 Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony Bundó Ruiz, Raimon Universitat Politècnica de Catalunya. Departament d'Enginyeria Civil i Ambiental Institut de Ciències del Mar Mösso Aranda, César González Acinas, Silvia east=-60.55537510000001; north=-62.9409297; name=Antàrtida 2023-06 application/pdf http://hdl.handle.net/2117/397914 eng eng Universitat Politècnica de Catalunya http://hdl.handle.net/2117/397914 PRISMA-177277 Open Access Àrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària::Ciències de la terra i de la vida::Microbiologia Antarctica Microorganisms Bacteria Biology--Classification 16S rRNA microorganism sediment taxonomy psychrophiles Antàrtida Microorganismes Bacteris Biologia--Classificació Bachelor thesis 2023 ftupcatalunyair 2024-07-25T11:19:08Z Els microorganismes exerceixen papers fonamentals en els cicles biogeoquímics, actuen com a valuosos indicadors de la salut del medi ambient, funcionant com a sentinelles del canvi global fins i tot en les remotes i delicades regions polars. La diversitat microbiana dels sediments aquàtics sol analitzar-se a partir de sediments frescos o congelats conservats a -20°C. No obstant, en la majoria dels casos es desconeix si es poden aïllar bacteris en cultiu pur a partir de sediments congelats a -70°C durant un llarg període de temps. L'objectiu principal d'aquest projecte és investigar la diversitat bacteriana en mostres procedents d'un testimoni de sediment recollides en la llacuna vermella Antàrtica situada a l'Illa Decepció, les quals van ser conservades a -70°C durant més d'un any i mig. Es va investigar si era possible aïllar bacteris en cultiu pur, investigant l'efecte de tres períodes d'incubació diferents (10, 20 i 30 dies). Com a resultat, un total de 91 ceps van ser analitzades en profunditat per a determinar la seva taxonomia i les seves relacions filogenètiques. La taxonomia d'aquests 91 aïllats es va deduir mitjançant la seqüenciació d'uns 600 pb del gen 16S ARNr. Els principals gèneres obtinguts es van relacionar amb Psychrobacter, Chryseobacterium i Flavobacterium, demostrant un primer indici de quins grups bacterians tenen major capacitat per a sobreviure i ser aïllats després de la seva conservació a llarg termini a aquesta temperatura, i per tant, ser considerats com a bacteris psicròfils extrems. Finalment, es va extreure l'ADN d'un total de 56 mostres de dues seccions de testimonis de sediment de la mateixa llacuna que serien adequades per a un següent pas en l'estudi de la diversitat microbiana mitjançant “16S metabarcoding”, amb la finalitat d'estudiar la diversitat completa per a entendre la rellevància d'aquests microorganismes en el canvi climàtic i global i poder identificar espècies indicadores amb les que poder realitzar estudis de mitigació. Los microorganismos ejercen papeles ... Bachelor Thesis Antarc* Antarctic Antarctica Universitat Politècnica de Catalunya, BarcelonaTech: UPCommons - Global access to UPC knowledge |
institution |
Open Polar |
collection |
Universitat Politècnica de Catalunya, BarcelonaTech: UPCommons - Global access to UPC knowledge |
op_collection_id |
ftupcatalunyair |
language |
English |
topic |
Àrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària::Ciències de la terra i de la vida::Microbiologia Antarctica Microorganisms Bacteria Biology--Classification 16S rRNA microorganism sediment taxonomy psychrophiles Antàrtida Microorganismes Bacteris Biologia--Classificació |
spellingShingle |
Àrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària::Ciències de la terra i de la vida::Microbiologia Antarctica Microorganisms Bacteria Biology--Classification 16S rRNA microorganism sediment taxonomy psychrophiles Antàrtida Microorganismes Bacteris Biologia--Classificació Bundó Ruiz, Raimon Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony |
topic_facet |
Àrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària::Ciències de la terra i de la vida::Microbiologia Antarctica Microorganisms Bacteria Biology--Classification 16S rRNA microorganism sediment taxonomy psychrophiles Antàrtida Microorganismes Bacteris Biologia--Classificació |
description |
Els microorganismes exerceixen papers fonamentals en els cicles biogeoquímics, actuen com a valuosos indicadors de la salut del medi ambient, funcionant com a sentinelles del canvi global fins i tot en les remotes i delicades regions polars. La diversitat microbiana dels sediments aquàtics sol analitzar-se a partir de sediments frescos o congelats conservats a -20°C. No obstant, en la majoria dels casos es desconeix si es poden aïllar bacteris en cultiu pur a partir de sediments congelats a -70°C durant un llarg període de temps. L'objectiu principal d'aquest projecte és investigar la diversitat bacteriana en mostres procedents d'un testimoni de sediment recollides en la llacuna vermella Antàrtica situada a l'Illa Decepció, les quals van ser conservades a -70°C durant més d'un any i mig. Es va investigar si era possible aïllar bacteris en cultiu pur, investigant l'efecte de tres períodes d'incubació diferents (10, 20 i 30 dies). Com a resultat, un total de 91 ceps van ser analitzades en profunditat per a determinar la seva taxonomia i les seves relacions filogenètiques. La taxonomia d'aquests 91 aïllats es va deduir mitjançant la seqüenciació d'uns 600 pb del gen 16S ARNr. Els principals gèneres obtinguts es van relacionar amb Psychrobacter, Chryseobacterium i Flavobacterium, demostrant un primer indici de quins grups bacterians tenen major capacitat per a sobreviure i ser aïllats després de la seva conservació a llarg termini a aquesta temperatura, i per tant, ser considerats com a bacteris psicròfils extrems. Finalment, es va extreure l'ADN d'un total de 56 mostres de dues seccions de testimonis de sediment de la mateixa llacuna que serien adequades per a un següent pas en l'estudi de la diversitat microbiana mitjançant “16S metabarcoding”, amb la finalitat d'estudiar la diversitat completa per a entendre la rellevància d'aquests microorganismes en el canvi climàtic i global i poder identificar espècies indicadores amb les que poder realitzar estudis de mitigació. Los microorganismos ejercen papeles ... |
author2 |
Universitat Politècnica de Catalunya. Departament d'Enginyeria Civil i Ambiental Institut de Ciències del Mar Mösso Aranda, César González Acinas, Silvia |
format |
Bachelor Thesis |
author |
Bundó Ruiz, Raimon |
author_facet |
Bundó Ruiz, Raimon |
author_sort |
Bundó Ruiz, Raimon |
title |
Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony |
title_short |
Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony |
title_full |
Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony |
title_fullStr |
Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony |
title_full_unstemmed |
Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony |
title_sort |
ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the antarctic vapour col penguin colony |
publisher |
Universitat Politècnica de Catalunya |
publishDate |
2023 |
url |
http://hdl.handle.net/2117/397914 |
op_coverage |
east=-60.55537510000001; north=-62.9409297; name=Antàrtida |
genre |
Antarc* Antarctic Antarctica |
genre_facet |
Antarc* Antarctic Antarctica |
op_relation |
http://hdl.handle.net/2117/397914 PRISMA-177277 |
op_rights |
Open Access |
_version_ |
1810492346180042752 |