Ecology and diversity of cultured bacteria from frozen red lagoon sediments in the Antarctic Vapour Col penguin colony

• Main Author: Bundó Ruiz, Raimon
• Other Authors: Universitat Politècnica de Catalunya. Departament d'Enginyeria Civil i Ambiental, Institut de Ciències del Mar, Mösso Aranda, César, González Acinas, Silvia
• Format: Bachelor Thesis
• Language: English
• Published: Universitat Politècnica de Catalunya 2023
• Subjects: Àrees temàtiques de la UPC::Enginyeria agroalimentària::Ciències de la terra i de la vida::Microbiologia; Antarctica; Microorganisms; Bacteria; Biology > Classification; 16S rRNA; microorganism; sediment; taxonomy; psychrophiles; Antàrtida; Microorganismes; Bacteris; Biologia > Classificació; Antarc*; Antarctic
• Online Access: http://hdl.handle.net/2117/397914

Els microorganismes exerceixen papers fonamentals en els cicles biogeoquímics, actuen com a valuosos indicadors de la salut del medi ambient, funcionant com a sentinelles del canvi global fins i tot en les remotes i delicades regions polars. La diversitat microbiana dels sediments aquàtics sol analitzar-se a partir de sediments frescos o congelats conservats a -20°C. No obstant, en la majoria dels casos es desconeix si es poden aïllar bacteris en cultiu pur a partir de sediments congelats a -70°C durant un llarg període de temps. L'objectiu principal d'aquest projecte és investigar la diversitat bacteriana en mostres procedents d'un testimoni de sediment recollides en la llacuna vermella Antàrtica situada a l'Illa Decepció, les quals van ser conservades a -70°C durant més d'un any i mig. Es va investigar si era possible aïllar bacteris en cultiu pur, investigant l'efecte de tres períodes d'incubació diferents (10, 20 i 30 dies). Com a resultat, un total de 91 ceps van ser analitzades en profunditat per a determinar la seva taxonomia i les seves relacions filogenètiques. La taxonomia d'aquests 91 aïllats es va deduir mitjançant la seqüenciació d'uns 600 pb del gen 16S ARNr. Els principals gèneres obtinguts es van relacionar amb Psychrobacter, Chryseobacterium i Flavobacterium, demostrant un primer indici de quins grups bacterians tenen major capacitat per a sobreviure i ser aïllats després de la seva conservació a llarg termini a aquesta temperatura, i per tant, ser considerats com a bacteris psicròfils extrems. Finalment, es va extreure l'ADN d'un total de 56 mostres de dues seccions de testimonis de sediment de la mateixa llacuna que serien adequades per a un següent pas en l'estudi de la diversitat microbiana mitjançant “16S metabarcoding”, amb la finalitat d'estudiar la diversitat completa per a entendre la rellevància d'aquests microorganismes en el canvi climàtic i global i poder identificar espècies indicadores amb les que poder realitzar estudis de mitigació. Los microorganismos ejercen papeles ...