Connectivité chez les amphipodes marins arctiques à différentes échelles spatiales et temporelles

• Main Author: Tempestini, Astrid
• Format: Text
• Language: French
• Published: 2016
• Subjects: Connectivité écologique; Amphipodes > Dispersion > Arctique; Themisto > Hémisphère nord > Phylogenèse; Métagénomique; Polymorphisme de nucléotide simple; Codage à barres de l'ADN pour la taxonomie; Biodiversité marine > Arctique; Barres; Arctique*; Océan Arctique
• Online Access: http://archipel.uqam.ca/9648/1/D3214.pdf

La connectivité, ou les échanges d'individus entre les populations, est un thème important en écologie marine, car elle permet aux espèces de se maintenir et d'évoluer. Les études sur la connectivité marine montrent des inégalités dans les zones d'études, dans les échelles spatiales et les organismes. La biodiversité de l'océan Arctique est encore mal connue. Cette biodiversité marine arctique est le résultat de l'histoire complexe de ce milieu et des échanges avec les océans Pacifique et Atlantique limitrophes. Les outils génétiques ont souvent permis de caractériser non seulement une biodiversité cryptique mais aussi les échanges en milieux marins. Depuis quelques années, l'apparition des nouvelles techniques de séquençage a permis de caractériser le polymorphisme nucléotidique (SNP) réparti sur l'ensemble du génome chez les organismes non-modèles. Ces nouvelles techniques de séquençage tel que le séquençage RAD, ont permis de mettre en évidence des structures de population qui n'étaient pas détectées avec d'autres marqueurs. L'objectif général de ma thèse est de documenter la connectivité en milieu marin arctique à différentes échelles spatiales et temporelles afin de détecter la présence éventuelle de barrière à la dispersion, en utilisant comme modèles les amphipodes. Afin de répondre à cet objectif, chacun des quatre chapitres documente un aspect de la connectivité. Tout d'abord le chapitre II rapporte la contribution de chacun des océans limitrophes de l'Arctique dans la composition de la biodiversité marine. Comme les espèces d'amphipodes sont difficiles à caractériser, nous avons dans un premier temps utilisé les 2557 séquences de code-barres ADN provenant de notre échantillonnage et d'une base de données que nous avons regroupés en espèces potentielles. Puis dans un second temps, nous avons comparé les compositions en espèces de chaque océan Arctique, Atlantique et Pacifique. Nous avons trouvé que les océans Arctique et Atlantique partageaient plus d'espèces tandis que l'océan Pacifique semblait plus ...